RNA id: TCONS_00019113


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00019113
length 7650
lncRNA type inter_gene
GC content 0.38
exon number 1
gene id XLOC_008933
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 2618279 ~ 2625928 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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Function

GO:

id name namespace
GO:0044281 small molecule metabolic process biological_process
GO:0006208 pyrimidine nucleobase catabolic process biological_process

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00017646 lncRNA downstream 7109 2598804 ~ 2611170 (-) True XLOC_008932
TCONS_00018809 lncRNA downstream 22158 2590381 ~ 2596121 (-) True XLOC_008931
TCONS_00017644 lncRNA downstream 98676 2517783 ~ 2519603 (-) True XLOC_008930
TCONS_00019112 lncRNA downstream 289995 2323666 ~ 2328284 (-) True XLOC_008928
TCONS_00017640 lncRNA downstream 290134 2323666 ~ 2328145 (-) False XLOC_008928
TCONS_00019114 lncRNA upstream 187588 2813516 ~ 2816142 (-) True XLOC_008942
TCONS_00017662 lncRNA upstream 292329 2918257 ~ 2931021 (-) True XLOC_008946
TCONS_00019115 lncRNA upstream 489409 3115337 ~ 3116262 (-) True XLOC_008951
TCONS_00019116 lncRNA upstream 534510 3160438 ~ 3162459 (-) True XLOC_008952
TCONS_00019117 lncRNA upstream 1128638 3754566 ~ 3760957 (-) True XLOC_008957
TCONS_00017645 mRNA downstream 22154 2589949 ~ 2596125 (-) False XLOC_008931
TCONS_00017643 mRNA downstream 98639 2510761 ~ 2519640 (-) False XLOC_008930
TCONS_00017641 mRNA downstream 120711 2490204 ~ 2497568 (-) False XLOC_008929
TCONS_00017642 mRNA downstream 124508 2490235 ~ 2493771 (-) True XLOC_008929
TCONS_00017638 mRNA downstream 429947 2182691 ~ 2188332 (-) True XLOC_008926
TCONS_00017648 mRNA upstream 5493 2631421 ~ 2632891 (-) True XLOC_008934
TCONS_00017649 mRNA upstream 12956 2638884 ~ 2640966 (-) True XLOC_008935
TCONS_00017650 mRNA upstream 24859 2650787 ~ 2652640 (-) True XLOC_008936
TCONS_00017651 mRNA upstream 29638 2655566 ~ 2657508 (-) True XLOC_008937
TCONS_00017652 mRNA upstream 74718 2700646 ~ 2726662 (-) True XLOC_008938
TCONS_00017639 other downstream 352196 2265969 ~ 2266083 (-) True XLOC_008927
TCONS_00017627 other downstream 780396 1834971 ~ 1837883 (-) True XLOC_008922
TCONS_00017597 other downstream 1296373 1321790 ~ 1321906 (-) True XLOC_008910
TCONS_00017537 other downstream 2192523 425695 ~ 425756 (-) True XLOC_008873
TCONS_00017535 other downstream 2268712 349451 ~ 349567 (-) True XLOC_008870
TCONS_00017655 other upstream 110455 2736383 ~ 2736498 (-) True XLOC_008940
TCONS_00017689 other upstream 1478480 4104408 ~ 4104526 (-) True XLOC_008968
TCONS_00017694 other upstream 1739230 4365158 ~ 4365272 (-) True XLOC_008973
TCONS_00017700 other upstream 1800566 4426494 ~ 4482147 (-) False XLOC_008974
TCONS_00017702 other upstream 1809537 4435465 ~ 4482230 (-) False XLOC_008974

Expression Profile

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