RNA id: TCONS_00001485


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00001485
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.56
exon number 1
gene id XLOC_000930
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 1050941 ~ 1051057 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

acaggcggcagcagctctctgcaactctcacatggtcgctcactgaagctaagcagggctgtgcttggccagtacctggatgggagaccacatgggaatgttaggttgctgctggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000190086

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00003290 lncRNA downstream 36075 1005937 ~ 1014866 (-) True XLOC_000929
TCONS_00003289 lncRNA downstream 271327 778575 ~ 779614 (-) True XLOC_000927
TCONS_00001475 lncRNA downstream 428762 620990 ~ 622179 (-) False XLOC_000923
TCONS_00001467 lncRNA downstream 537224 511771 ~ 513717 (-) True XLOC_000919
TCONS_00001463 lncRNA downstream 566353 479807 ~ 484588 (-) False XLOC_000918
TCONS_00002897 lncRNA upstream 92905 1143962 ~ 1253194 (-) True XLOC_000931
TCONS_00003292 lncRNA upstream 240118 1291175 ~ 1314969 (-) False XLOC_000932
TCONS_00003291 lncRNA upstream 240118 1291175 ~ 1314969 (-) False XLOC_000932
TCONS_00003293 lncRNA upstream 240118 1291175 ~ 1315753 (-) False XLOC_000932
TCONS_00001488 lncRNA upstream 299054 1350111 ~ 1352997 (-) False XLOC_000933
TCONS_00001483 mRNA downstream 51385 960209 ~ 999556 (-) False XLOC_000928
TCONS_00001484 mRNA downstream 51385 973467 ~ 999556 (-) True XLOC_000928
TCONS_00001482 mRNA downstream 336315 691738 ~ 714626 (-) True XLOC_000926
TCONS_00001481 mRNA downstream 369825 673163 ~ 681116 (-) True XLOC_000925
TCONS_00001480 mRNA downstream 381224 658405 ~ 669717 (-) True XLOC_000924
TCONS_00001489 mRNA upstream 311875 1362932 ~ 1402303 (-) True XLOC_000934
TCONS_00001490 mRNA upstream 567937 1618994 ~ 1627487 (-) False XLOC_000937
TCONS_00001491 mRNA upstream 568096 1619153 ~ 1631399 (-) True XLOC_000937
TCONS_00001494 mRNA upstream 823370 1874427 ~ 1885594 (-) False XLOC_000939
TCONS_00001495 mRNA upstream 824013 1875070 ~ 1885516 (-) False XLOC_000939
TCONS_00001476 other downstream 425861 621025 ~ 625080 (-) False XLOC_000923
TCONS_00001460 other downstream 579016 467743 ~ 471925 (-) True XLOC_000917
TCONS_00001442 other downstream 897095 153238 ~ 153846 (-) False XLOC_000909
TCONS_00001429 other downstream 1001106 47954 ~ 49835 (-) False XLOC_000904
TCONS_00001421 other downstream 1006395 42204 ~ 44546 (-) False XLOC_000903
TCONS_00001486 other upstream 262548 1313605 ~ 1315753 (-) True XLOC_000932
TCONS_00001492 other upstream 819804 1870861 ~ 1875118 (-) False XLOC_000939
TCONS_00001493 other upstream 822951 1874008 ~ 1885600 (-) False XLOC_000939
TCONS_00001497 other upstream 833303 1884360 ~ 1928111 (-) False XLOC_000939
TCONS_00001500 other upstream 839114 1890171 ~ 1894005 (-) False XLOC_000939

Expression Profile

//