RNA id: TCONS_00018418


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00018418
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.43
exon number 1
gene id XLOC_009370
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 33663055 ~ 33663172 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ttaagtagcAAAGTCATTCTTAAAGCCTTTCTTAATtaaactgaagctaagcagggctgagcctggtggtcagtacctgaatgggagaccacatggaaaagctaggttgttgcctgaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000189083

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00018411 lncRNA downstream 416291 33244970 ~ 33246764 (-) False XLOC_009368
TCONS_00018410 lncRNA downstream 419454 33234478 ~ 33243601 (-) False XLOC_009368
TCONS_00019207 lncRNA downstream 845060 32813736 ~ 32817995 (-) False XLOC_009367
TCONS_00019208 lncRNA downstream 845131 32814040 ~ 32817924 (-) True XLOC_009367
TCONS_00019206 lncRNA downstream 1027278 32633290 ~ 32635777 (-) False XLOC_009366
TCONS_00018834 lncRNA upstream 2752 33665924 ~ 33681678 (-) True XLOC_009371
TCONS_00018425 lncRNA upstream 205489 33868661 ~ 33886153 (-) False XLOC_009376
TCONS_00019209 lncRNA upstream 206407 33869579 ~ 33877331 (-) True XLOC_009377
TCONS_00018426 lncRNA upstream 212033 33875205 ~ 33887363 (-) False XLOC_009376
TCONS_00019210 lncRNA upstream 216181 33879353 ~ 33887350 (-) False XLOC_009376
TCONS_00018414 mRNA downstream 22165 33467298 ~ 33640890 (-) False XLOC_009369
TCONS_00018417 mRNA downstream 135334 33477405 ~ 33527721 (-) True XLOC_009369
TCONS_00018415 mRNA downstream 135424 33468213 ~ 33527631 (-) False XLOC_009369
TCONS_00018416 mRNA downstream 168007 33477108 ~ 33495048 (-) False XLOC_009369
TCONS_00018408 mRNA downstream 338009 32895659 ~ 33325046 (-) False XLOC_009368
TCONS_00018419 mRNA upstream 39746 33702918 ~ 33734105 (-) False XLOC_009372
TCONS_00018420 mRNA upstream 41579 33704751 ~ 33734112 (-) False XLOC_009372
TCONS_00018422 mRNA upstream 81377 33744549 ~ 33807758 (-) True XLOC_009373
TCONS_00018423 mRNA upstream 146692 33809864 ~ 33818872 (-) True XLOC_009374
TCONS_00018424 mRNA upstream 162578 33825750 ~ 33834577 (-) True XLOC_009375
TCONS_00018399 other downstream 1599646 32063292 ~ 32063409 (-) True XLOC_009362
TCONS_00018396 other downstream 2115203 31547734 ~ 31547852 (-) True XLOC_009360
TCONS_00018378 other downstream 2300914 31361787 ~ 31362141 (-) True XLOC_009348
TCONS_00018372 other downstream 2347507 31315209 ~ 31315548 (-) True XLOC_009344
TCONS_00018370 other downstream 2363377 31299563 ~ 31299678 (-) True XLOC_009342
TCONS_00018421 other upstream 43508 33706680 ~ 33734106 (-) True XLOC_009372
TCONS_00018452 other upstream 616249 34279421 ~ 34279535 (-) True XLOC_009383
TCONS_00018481 other upstream 1432033 35095205 ~ 35112786 (-) False XLOC_009398
TCONS_00018488 other upstream 1504123 35167295 ~ 35212237 (-) True XLOC_009400
TCONS_00018513 other upstream 2866293 36529465 ~ 36533247 (-) True XLOC_009417