RNA id: TCONS_00001521


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00001521
length 155
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_000957
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 4210498 ~ 4210652 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

AACTCTTAGCGGTGGATCACTCGGCTCGTGCGTCGATGAAGAACGCAGCTAGCTGCGAGAACTTATGTGAATTGCAGGACACACATTGATCATCGACCTTTCGAACGCACATTGCGGCCCCGGGTCCATCCCGGGGCTACTCAGCTGACATGAAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000166854

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00002902 lncRNA downstream 136350 4029769 ~ 4074148 (-) True XLOC_000955
TCONS_00003308 lncRNA downstream 363634 3844836 ~ 3846864 (-) True XLOC_000954
TCONS_00003307 lncRNA downstream 363782 3844836 ~ 3846716 (-) False XLOC_000954
TCONS_00001520 lncRNA downstream 880063 3305549 ~ 3330435 (-) True XLOC_000953
TCONS_00001519 lncRNA downstream 901304 3305549 ~ 3309194 (-) False XLOC_000953
TCONS_00001522 lncRNA upstream 24751 4235403 ~ 4250442 (-) True XLOC_000956
TCONS_00002903 lncRNA upstream 573133 4783785 ~ 4785460 (-) False XLOC_000958
TCONS_00002904 lncRNA upstream 573212 4783864 ~ 4785460 (-) False XLOC_000958
TCONS_00002905 lncRNA upstream 574083 4784735 ~ 4785460 (-) True XLOC_000958
TCONS_00003312 lncRNA upstream 937941 5148593 ~ 5153828 (-) True XLOC_000960
TCONS_00001512 mRNA downstream 915453 3100244 ~ 3295045 (-) True XLOC_000951
TCONS_00001510 mRNA downstream 1752952 2454094 ~ 2457546 (-) True XLOC_000948
TCONS_00001508 mRNA downstream 1757313 2448051 ~ 2453185 (-) False XLOC_000947
TCONS_00001509 mRNA downstream 1757324 2450140 ~ 2453174 (-) True XLOC_000947
TCONS_00001507 mRNA downstream 1761906 2447025 ~ 2448592 (-) False XLOC_000947
TCONS_00001524 mRNA upstream 1143837 5354489 ~ 5394752 (-) False XLOC_000963
TCONS_00001525 mRNA upstream 1152917 5363569 ~ 5394791 (-) True XLOC_000963
TCONS_00001526 mRNA upstream 1239125 5449777 ~ 5455502 (-) False XLOC_000964
TCONS_00001527 mRNA upstream 1239218 5449870 ~ 5455498 (-) True XLOC_000964
TCONS_00001528 mRNA upstream 1293476 5504128 ~ 5542565 (-) False XLOC_000965
TCONS_00001518 other downstream 912249 3298112 ~ 3298249 (-) True XLOC_000952
TCONS_00001517 other downstream 912410 3298006 ~ 3298088 (-) False XLOC_000952
TCONS_00001516 other downstream 912562 3297848 ~ 3297936 (-) False XLOC_000952
TCONS_00001515 other downstream 912743 3297603 ~ 3297755 (-) False XLOC_000952
TCONS_00001514 other downstream 912928 3297484 ~ 3297570 (-) False XLOC_000952
TCONS_00001523 other upstream 867719 5078371 ~ 5078488 (-) True XLOC_000959
TCONS_00001538 other upstream 2010229 6220881 ~ 6222249 (-) False XLOC_000970
TCONS_00001542 other upstream 2242752 6453404 ~ 6453519 (-) True XLOC_000973
TCONS_00001543 other upstream 2931387 7142039 ~ 7142143 (-) True XLOC_000974
TCONS_00001545 other upstream 3363699 7574351 ~ 7603573 (-) False XLOC_000977