RNA id: TCONS_00025819


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00025819
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_012967
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 38017901 ~ 38018018 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TATGGCAACACCTAACTCTCTGCAagtctcacatggttgcccactgcaGCTAAGCAGTGCTGCGTCTGGTCAGtaactggatgggagaccacatgggaaagttaggttgctgccggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000161300

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00026923 lncRNA upstream 654873 37358896 ~ 37363028 (+) True XLOC_012964
TCONS_00027140 lncRNA upstream 736830 37272515 ~ 37281071 (+) False XLOC_012963
TCONS_00026920 lncRNA upstream 964799 37048505 ~ 37053102 (+) False XLOC_012960
TCONS_00025822 lncRNA downstream 188271 38206289 ~ 38208100 (+) True XLOC_012968
TCONS_00026924 lncRNA downstream 385307 38403325 ~ 38438625 (+) False XLOC_012971
TCONS_00026925 lncRNA downstream 385307 38403325 ~ 38518803 (+) False XLOC_012971
TCONS_00027141 lncRNA downstream 471654 38489672 ~ 38518601 (+) True XLOC_012971
TCONS_00027142 lncRNA downstream 730595 38748613 ~ 38754692 (+) False XLOC_012972
TCONS_00025816 mRNA upstream 736735 37272568 ~ 37281166 (+) True XLOC_012963
TCONS_00025813 mRNA upstream 747161 37259800 ~ 37270740 (+) False XLOC_012962
TCONS_00025814 mRNA upstream 753663 37259801 ~ 37264238 (+) False XLOC_012962
TCONS_00025812 mRNA upstream 783205 37219140 ~ 37234696 (+) True XLOC_012961
TCONS_00025811 mRNA upstream 816351 37120096 ~ 37201550 (+) True XLOC_012959
TCONS_00025820 mRNA downstream 173328 38191346 ~ 38210092 (+) False XLOC_012968
TCONS_00025821 mRNA downstream 174481 38192499 ~ 38210087 (+) False XLOC_012968
TCONS_00025823 mRNA downstream 270859 38288877 ~ 38296665 (+) True XLOC_012969
TCONS_00025826 mRNA downstream 303021 38321039 ~ 38364462 (+) False XLOC_012970
TCONS_00025825 mRNA downstream 303021 38321039 ~ 38364462 (+) False XLOC_012970
TCONS_00025818 other upstream 55004 37962778 ~ 37962897 (+) True XLOC_012966
TCONS_00025817 other upstream 559339 37458446 ~ 37458562 (+) True XLOC_012965
TCONS_00025815 other upstream 757250 37259970 ~ 37260651 (+) True XLOC_012962
TCONS_00025798 other upstream 1379735 36633253 ~ 36638166 (+) True XLOC_012951
TCONS_00025796 other upstream 1386607 36629820 ~ 36631294 (+) False XLOC_012951
TCONS_00025838 other downstream 967902 38985920 ~ 38994767 (+) False XLOC_012976
TCONS_00025852 other downstream 1718371 39736389 ~ 39736503 (+) True XLOC_012986
TCONS_00025854 other downstream 2005754 40023772 ~ 40023888 (+) True XLOC_012988
TCONS_00025863 other downstream 2448772 40466790 ~ 40466904 (+) True XLOC_012992
TCONS_00025872 other downstream 2615509 40633527 ~ 40636178 (+) True XLOC_013000