RNA id: TCONS_00025852


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00025852
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.56
exon number 1
gene id XLOC_012986
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 39736389 ~ 39736503 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GcaagcagctagctctctgcagctctcacatAGTCACCTattgaagccaagcagggctgcgcctggtgagtacctggatgggagaccacatgggaaagctaggtagctgtcggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000190482

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00027144 lncRNA upstream 104364 39621465 ~ 39632025 (+) False XLOC_012984
TCONS_00027145 lncRNA upstream 104364 39621474 ~ 39632025 (+) True XLOC_012984
TCONS_00027143 lncRNA upstream 563197 39165363 ~ 39173192 (+) True XLOC_012980
TCONS_00027142 lncRNA upstream 981697 38748613 ~ 38754692 (+) False XLOC_012972
TCONS_00026925 lncRNA upstream 1217586 38403325 ~ 38518803 (+) False XLOC_012971
TCONS_00026926 lncRNA downstream 782233 40518736 ~ 40520628 (+) True XLOC_012994
TCONS_00027146 lncRNA downstream 931564 40668067 ~ 40669736 (+) True XLOC_013002
TCONS_00027147 lncRNA downstream 1024138 40760641 ~ 40763051 (+) True XLOC_013003
TCONS_00027148 lncRNA downstream 1165395 40901898 ~ 40902607 (+) True XLOC_013004
TCONS_00027149 lncRNA downstream 1452236 41188739 ~ 41193714 (+) False XLOC_013006
TCONS_00025850 mRNA upstream 74019 39649660 ~ 39662370 (+) False XLOC_012985
TCONS_00025851 mRNA upstream 74215 39649825 ~ 39662174 (+) True XLOC_012985
TCONS_00025849 mRNA upstream 230542 39487486 ~ 39505847 (+) True XLOC_012983
TCONS_00025848 mRNA upstream 305433 39416504 ~ 39430956 (+) False XLOC_012982
TCONS_00025847 mRNA upstream 305433 39416504 ~ 39430956 (+) True XLOC_012982
TCONS_00025853 mRNA downstream 200722 39937225 ~ 39938534 (+) True XLOC_012987
TCONS_00025856 mRNA downstream 618495 40354998 ~ 40384313 (+) False XLOC_012989
TCONS_00025855 mRNA downstream 618495 40354998 ~ 40384313 (+) False XLOC_012989
TCONS_00025857 mRNA downstream 618905 40355408 ~ 40373870 (+) False XLOC_012989
TCONS_00025859 mRNA downstream 628229 40364732 ~ 40384313 (+) False XLOC_012989
TCONS_00025838 other upstream 741622 38985920 ~ 38994767 (+) False XLOC_012976
TCONS_00025819 other upstream 1718371 38017901 ~ 38018018 (+) True XLOC_012967
TCONS_00025818 other upstream 1773492 37962778 ~ 37962897 (+) True XLOC_012966
TCONS_00025817 other upstream 2277827 37458446 ~ 37458562 (+) True XLOC_012965
TCONS_00025815 other upstream 2475738 37259970 ~ 37260651 (+) True XLOC_012962
TCONS_00025854 other downstream 287269 40023772 ~ 40023888 (+) True XLOC_012988
TCONS_00025863 other downstream 730287 40466790 ~ 40466904 (+) True XLOC_012992
TCONS_00025872 other downstream 897024 40633527 ~ 40636178 (+) True XLOC_013000
TCONS_00025882 other downstream 1775642 41512145 ~ 41526488 (+) False XLOC_013010
TCONS_00025883 other downstream 1775656 41512159 ~ 41520460 (+) False XLOC_013010