RNA id: TCONS_00025854


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00025854
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_012988
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 40023772 ~ 40023888 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CACCTTAGCCATATAACCCTGCAGCCCAATACCggctactcactgaagctaagcagggctaagcctggtcagtacctggatgaaagaccacatggaaaaactaggttgctgatGGAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000175291

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00027144 lncRNA upstream 391747 39621465 ~ 39632025 (+) False XLOC_012984
TCONS_00027145 lncRNA upstream 391747 39621474 ~ 39632025 (+) True XLOC_012984
TCONS_00027143 lncRNA upstream 850580 39165363 ~ 39173192 (+) True XLOC_012980
TCONS_00027142 lncRNA upstream 1269080 38748613 ~ 38754692 (+) False XLOC_012972
TCONS_00027141 lncRNA upstream 1505171 38489672 ~ 38518601 (+) True XLOC_012971
TCONS_00026926 lncRNA downstream 494848 40518736 ~ 40520628 (+) True XLOC_012994
TCONS_00027146 lncRNA downstream 644179 40668067 ~ 40669736 (+) True XLOC_013002
TCONS_00027147 lncRNA downstream 736753 40760641 ~ 40763051 (+) True XLOC_013003
TCONS_00027148 lncRNA downstream 878010 40901898 ~ 40902607 (+) True XLOC_013004
TCONS_00027149 lncRNA downstream 1164851 41188739 ~ 41193714 (+) False XLOC_013006
TCONS_00025853 mRNA upstream 85238 39937225 ~ 39938534 (+) True XLOC_012987
TCONS_00025850 mRNA upstream 361402 39649660 ~ 39662370 (+) False XLOC_012985
TCONS_00025851 mRNA upstream 361598 39649825 ~ 39662174 (+) True XLOC_012985
TCONS_00025849 mRNA upstream 517925 39487486 ~ 39505847 (+) True XLOC_012983
TCONS_00025848 mRNA upstream 592816 39416504 ~ 39430956 (+) False XLOC_012982
TCONS_00025856 mRNA downstream 331110 40354998 ~ 40384313 (+) False XLOC_012989
TCONS_00025855 mRNA downstream 331110 40354998 ~ 40384313 (+) False XLOC_012989
TCONS_00025857 mRNA downstream 331520 40355408 ~ 40373870 (+) False XLOC_012989
TCONS_00025859 mRNA downstream 340844 40364732 ~ 40384313 (+) False XLOC_012989
TCONS_00025858 mRNA downstream 340844 40364732 ~ 40384313 (+) False XLOC_012989
TCONS_00025852 other upstream 287269 39736389 ~ 39736503 (+) True XLOC_012986
TCONS_00025838 other upstream 1029005 38985920 ~ 38994767 (+) False XLOC_012976
TCONS_00025819 other upstream 2005754 38017901 ~ 38018018 (+) True XLOC_012967
TCONS_00025818 other upstream 2060875 37962778 ~ 37962897 (+) True XLOC_012966
TCONS_00025817 other upstream 2565210 37458446 ~ 37458562 (+) True XLOC_012965
TCONS_00025863 other downstream 442902 40466790 ~ 40466904 (+) True XLOC_012992
TCONS_00025872 other downstream 609639 40633527 ~ 40636178 (+) True XLOC_013000
TCONS_00025882 other downstream 1488257 41512145 ~ 41526488 (+) False XLOC_013010
TCONS_00025883 other downstream 1488271 41512159 ~ 41520460 (+) False XLOC_013010
TCONS_00025892 other downstream 1558903 41582791 ~ 41585575 (+) True XLOC_013014