RNA id: TCONS_00025895


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00025895
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.57
exon number 1
gene id XLOC_013017
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 41713076 ~ 41713190 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

gccggcagctagctctctgcagctctcacatggtcgccctctgaagttaagcagggctgtgcacggtcagtatctggatgggagaccacatgggaaagctaggttgctgccaaaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000115638

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00025881 lncRNA upstream 186588 41512102 ~ 41526488 (+) False XLOC_013010
TCONS_00025885 lncRNA upstream 186588 41520160 ~ 41526488 (+) False XLOC_013010
TCONS_00025886 lncRNA upstream 190564 41520778 ~ 41522512 (+) True XLOC_013010
TCONS_00026927 lncRNA upstream 485874 41188790 ~ 41227202 (+) False XLOC_013006
TCONS_00026928 lncRNA upstream 485874 41188827 ~ 41227202 (+) True XLOC_013006
TCONS_00027150 lncRNA downstream 358538 42071728 ~ 42077328 (+) False XLOC_013021
TCONS_00027151 lncRNA downstream 358541 42071731 ~ 42091211 (+) True XLOC_013021
TCONS_00026929 lncRNA downstream 925878 42639068 ~ 42640691 (+) False XLOC_013022
TCONS_00027152 lncRNA downstream 925883 42639073 ~ 42640074 (+) True XLOC_013022
TCONS_00027153 lncRNA downstream 939964 42653154 ~ 42653955 (+) True XLOC_013023
TCONS_00025891 mRNA upstream 121392 41561285 ~ 41591684 (+) False XLOC_013014
TCONS_00025890 mRNA upstream 121661 41560822 ~ 41591415 (+) False XLOC_013014
TCONS_00025889 mRNA upstream 153658 41549764 ~ 41559418 (+) True XLOC_013013
TCONS_00025888 mRNA upstream 165758 41542542 ~ 41547318 (+) True XLOC_013012
TCONS_00025887 mRNA upstream 173820 41527877 ~ 41539256 (+) True XLOC_013011
TCONS_00025896 mRNA downstream 55167 41768357 ~ 41800595 (+) False XLOC_013018
TCONS_00025897 mRNA downstream 59284 41772474 ~ 41808741 (+) True XLOC_013018
TCONS_00025898 mRNA downstream 106849 41820039 ~ 41838419 (+) True XLOC_013019
TCONS_00025901 mRNA downstream 1257018 42970208 ~ 43225932 (+) False XLOC_013027
TCONS_00025903 mRNA downstream 1470559 43183749 ~ 43226503 (+) True XLOC_013027
TCONS_00025894 other upstream 44767 41668184 ~ 41668309 (+) True XLOC_013016
TCONS_00025893 other upstream 53252 41657487 ~ 41659824 (+) True XLOC_013015
TCONS_00025892 other upstream 127501 41582791 ~ 41585575 (+) True XLOC_013014
TCONS_00025882 other upstream 186588 41512145 ~ 41526488 (+) False XLOC_013010
TCONS_00025883 other upstream 192616 41512159 ~ 41520460 (+) False XLOC_013010
TCONS_00025899 other downstream 218529 41931719 ~ 41931833 (+) True XLOC_013020
TCONS_00025900 other downstream 1060404 42773594 ~ 42778763 (+) False XLOC_013025
TCONS_00025902 other downstream 1468519 43181709 ~ 43225706 (+) False XLOC_013027
TCONS_00025908 other downstream 2293382 44006572 ~ 44006688 (+) True XLOC_013032
TCONS_00025911 other downstream 2405947 44119137 ~ 44119262 (+) True XLOC_013035

Expression Profile

//