RNA id: TCONS_00025899



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00025899
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_013020
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 41931719 ~ 41931833 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gccagcagctagctctctgcaacacTCACATGTTCATCCACTAAAGCCAAGCAGAGCTGTGCCCGgtaagtacctggatgggaaaccacatgggaaagctaggtttctgctgaaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000189614

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00025881 lncRNA upstream 405231 41512102 ~ 41526488 (+) False XLOC_013010
TCONS_00025885 lncRNA upstream 405231 41520160 ~ 41526488 (+) False XLOC_013010
TCONS_00025886 lncRNA upstream 409207 41520778 ~ 41522512 (+) True XLOC_013010
TCONS_00026927 lncRNA upstream 704517 41188790 ~ 41227202 (+) False XLOC_013006
TCONS_00026928 lncRNA upstream 704517 41188827 ~ 41227202 (+) True XLOC_013006
TCONS_00027150 lncRNA downstream 139895 42071728 ~ 42077328 (+) False XLOC_013021
TCONS_00027151 lncRNA downstream 139898 42071731 ~ 42091211 (+) True XLOC_013021
TCONS_00026929 lncRNA downstream 707235 42639068 ~ 42640691 (+) False XLOC_013022
TCONS_00027152 lncRNA downstream 707240 42639073 ~ 42640074 (+) True XLOC_013022
TCONS_00027153 lncRNA downstream 721321 42653154 ~ 42653955 (+) True XLOC_013023
TCONS_00025898 mRNA upstream 93300 41820039 ~ 41838419 (+) True XLOC_013019
TCONS_00025897 mRNA upstream 122978 41772474 ~ 41808741 (+) True XLOC_013018
TCONS_00025896 mRNA upstream 131124 41768357 ~ 41800595 (+) False XLOC_013018
TCONS_00025891 mRNA upstream 340035 41561285 ~ 41591684 (+) False XLOC_013014
TCONS_00025890 mRNA upstream 340304 41560822 ~ 41591415 (+) False XLOC_013014
TCONS_00025901 mRNA downstream 1038375 42970208 ~ 43225932 (+) False XLOC_013027
TCONS_00025903 mRNA downstream 1251916 43183749 ~ 43226503 (+) True XLOC_013027
TCONS_00025904 mRNA downstream 1434057 43365890 ~ 43440181 (+) True XLOC_013028
TCONS_00025907 mRNA downstream 1959218 43891051 ~ 43894087 (+) True XLOC_013031
TCONS_00025910 mRNA downstream 2149115 44080948 ~ 44120157 (+) True XLOC_013034
TCONS_00025895 other upstream 218529 41713076 ~ 41713190 (+) True XLOC_013017
TCONS_00025894 other upstream 263410 41668184 ~ 41668309 (+) True XLOC_013016
TCONS_00025893 other upstream 271895 41657487 ~ 41659824 (+) True XLOC_013015
TCONS_00025892 other upstream 346144 41582791 ~ 41585575 (+) True XLOC_013014
TCONS_00025882 other upstream 405231 41512145 ~ 41526488 (+) False XLOC_013010
TCONS_00025900 other downstream 841761 42773594 ~ 42778763 (+) False XLOC_013025
TCONS_00025902 other downstream 1249876 43181709 ~ 43225706 (+) False XLOC_013027
TCONS_00025908 other downstream 2074739 44006572 ~ 44006688 (+) True XLOC_013032
TCONS_00025911 other downstream 2187304 44119137 ~ 44119262 (+) True XLOC_013035
TCONS_00025912 other downstream 2221841 44153674 ~ 44154271 (+) True XLOC_013036