RNA id: TCONS_00030860



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00030860
length 423
RNA type mRNA
GC content 0.43
exon number 3
gene id XLOC_015421
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 23482798 ~ 23484348 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gaaccgattaacaaggtcactggtgggcggtcggggtgtgggggttcaaaccatttaaactgtatgcacctcattctaaaatgcatgttcttggtctttagataccaaagtgattttgttacctgtggatcttcaaacttcacatccagagttgtgaggaatcagaggtgcatgcggctgcccacgggaaaaatttgccatcagcccaacacagtttggattatcataggactgtcagaggtttgccaaacctgtcaaatgcatgatggctcctgtttggacttaccgatgtcctcgacttcaagtatccatcaaaactgtatacatttgagatatattagagactctttgtgggactggacattatgcatcctaaatcttcatcaaaatatgcaaatctcctcactgagttgccttggatga

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000187448

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00033531 lncRNA upstream 3552 23440077 ~ 23479246 (+) True XLOC_015418
TCONS_00033532 lncRNA upstream 31397 23450772 ~ 23451401 (+) True XLOC_015420
TCONS_00033528 lncRNA upstream 40270 23406453 ~ 23442528 (+) False XLOC_015418
TCONS_00033527 lncRNA upstream 40270 23406453 ~ 23442528 (+) False XLOC_015418
TCONS_00033530 lncRNA upstream 61751 23414883 ~ 23421047 (+) True XLOC_015419
TCONS_00033262 lncRNA downstream 57379 23541727 ~ 23545091 (+) False XLOC_015422
TCONS_00033533 lncRNA downstream 57379 23541727 ~ 23609276 (+) False XLOC_015422
TCONS_00033534 lncRNA downstream 59925 23544273 ~ 23609276 (+) False XLOC_015422
TCONS_00033535 lncRNA downstream 65838 23550186 ~ 23557515 (+) True XLOC_015423
TCONS_00033536 lncRNA downstream 91653 23576001 ~ 23609276 (+) True XLOC_015422
TCONS_00030857 mRNA upstream 120865 23351454 ~ 23361933 (+) False XLOC_015417
TCONS_00030859 mRNA upstream 121789 23352302 ~ 23361009 (+) True XLOC_015417
TCONS_00030858 mRNA upstream 127093 23351533 ~ 23355705 (+) False XLOC_015417
TCONS_00030854 mRNA upstream 189297 23222939 ~ 23293501 (+) False XLOC_015415
TCONS_00030852 mRNA upstream 350664 23130389 ~ 23132134 (+) True XLOC_015413
TCONS_00030861 mRNA downstream 128692 23613040 ~ 23620219 (+) False XLOC_015424
TCONS_00030863 mRNA downstream 192831 23677179 ~ 23713760 (+) False XLOC_015425
TCONS_00030865 mRNA downstream 217265 23701613 ~ 23726605 (+) True XLOC_015425
TCONS_00030866 mRNA downstream 246846 23731194 ~ 23745290 (+) True XLOC_015427
TCONS_00030867 mRNA downstream 306400 23790748 ~ 23805139 (+) True XLOC_015429
TCONS_00030856 other upstream 208017 23274332 ~ 23274781 (+) True XLOC_015415
TCONS_00030855 other upstream 224901 23257777 ~ 23257897 (+) True XLOC_015416
TCONS_00030841 other upstream 491277 22986282 ~ 22991521 (+) True XLOC_015408
TCONS_00030832 other upstream 816098 22660071 ~ 22666700 (+) True XLOC_015401
TCONS_00030805 other upstream 2107204 21375467 ~ 21375594 (+) True XLOC_015384
TCONS_00030864 other downstream 195525 23679873 ~ 23679989 (+) True XLOC_015426
TCONS_00030870 other downstream 528902 24013250 ~ 24014943 (+) True XLOC_015433
TCONS_00030885 other downstream 864241 24348589 ~ 24351040 (+) True XLOC_015440
TCONS_00030891 other downstream 999941 24484289 ~ 24497841 (+) True XLOC_015443
TCONS_00030897 other downstream 1055699 24540047 ~ 24540765 (+) False XLOC_015445

Expression Profile


//