RNA id: TCONS_00031194


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00031194
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_015626
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 35831329 ~ 35831445 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCTAATAGCCATATCACCCTTCAGCcaaagaccggttactcactgaagctaagcaggactgagcctggtcagtacctgaatgggagaccacttaggaaagctaggttgctgttgtaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000179366

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00033606 lncRNA upstream 217031 35612555 ~ 35614298 (+) False XLOC_015623
TCONS_00031186 lncRNA upstream 225432 35603637 ~ 35605897 (+) False XLOC_015622
TCONS_00033278 lncRNA upstream 250038 35579580 ~ 35581291 (+) True XLOC_015619
TCONS_00033605 lncRNA upstream 250384 35517875 ~ 35580945 (+) False XLOC_015619
TCONS_00031183 lncRNA upstream 312900 35512002 ~ 35518429 (+) False XLOC_015619
TCONS_00033607 lncRNA downstream 241508 36072953 ~ 36078638 (+) True XLOC_015631
TCONS_00031209 lncRNA downstream 262116 36093561 ~ 36094319 (+) True XLOC_015636
TCONS_00033608 lncRNA downstream 348798 36180243 ~ 36367124 (+) False XLOC_015702
TCONS_00033609 lncRNA downstream 348798 36180243 ~ 36583275 (+) False XLOC_015702
TCONS_00033610 lncRNA downstream 413477 36244922 ~ 36247469 (+) True XLOC_015703
TCONS_00031190 mRNA upstream 99553 35728033 ~ 35731776 (+) True XLOC_015624
TCONS_00031189 mRNA upstream 99558 35615547 ~ 35731771 (+) False XLOC_015624
TCONS_00031188 mRNA upstream 217036 35612621 ~ 35614293 (+) True XLOC_015623
TCONS_00031187 mRNA upstream 219540 35603637 ~ 35611789 (+) True XLOC_015622
TCONS_00031185 mRNA upstream 229959 35595454 ~ 35601370 (+) True XLOC_015621
TCONS_00031195 mRNA downstream 22797 35854242 ~ 35873590 (+) True XLOC_015627
TCONS_00031196 mRNA downstream 49155 35880600 ~ 35979178 (+) True XLOC_015628
TCONS_00031198 mRNA downstream 161959 35993404 ~ 36001985 (+) True XLOC_015629
TCONS_00031199 mRNA downstream 172936 36004381 ~ 36021246 (+) False XLOC_015630
TCONS_00031200 mRNA downstream 176004 36007449 ~ 36014787 (+) False XLOC_015630
TCONS_00031167 other upstream 1898328 33927219 ~ 33933001 (+) True XLOC_015607
TCONS_00031163 other upstream 1928874 33902325 ~ 33902455 (+) True XLOC_015606
TCONS_00031162 other upstream 1930817 33900435 ~ 33900512 (+) True XLOC_015605
TCONS_00031160 other upstream 2073761 33756378 ~ 33757568 (+) True XLOC_015600
TCONS_00031140 other upstream 2630961 33189584 ~ 33200368 (+) False XLOC_015585
TCONS_00031197 other downstream 159692 35991137 ~ 35998576 (+) False XLOC_015629
TCONS_00031204 other downstream 256324 36087769 ~ 36087779 (+) True XLOC_015632
TCONS_00031205 other downstream 256986 36088431 ~ 36088479 (+) True XLOC_015633
TCONS_00031206 other downstream 257213 36088658 ~ 36088717 (+) True XLOC_015634
TCONS_00031207 other downstream 258215 36089660 ~ 36090680 (+) True XLOC_015635