RNA id: TCONS_00059845



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00059845
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_030726
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 997812 ~ 997928 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TAAAACAGccttatcaccctgcagccccAGAGCGGTCACTCACTGAAGCTATGcaaggctgagcctggttagtagctagatgggagaccacatgggaacactagactgctgttggca

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000180484

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00061505 lncRNA downstream 71735 921488 ~ 926077 (-) True XLOC_030725
TCONS_00061504 lncRNA downstream 171005 824709 ~ 826807 (-) True XLOC_030722
TCONS_00061907 lncRNA downstream 547199 446396 ~ 450613 (-) True XLOC_030718
TCONS_00061503 lncRNA downstream 598086 398305 ~ 399726 (-) True XLOC_030717
TCONS_00061906 lncRNA downstream 660722 326684 ~ 337090 (-) True XLOC_030716
TCONS_00061908 lncRNA upstream 8522 1006450 ~ 1084749 (-) True XLOC_030728
TCONS_00061909 lncRNA upstream 319962 1317890 ~ 1419531 (-) False XLOC_030734
TCONS_00061910 lncRNA upstream 420220 1418148 ~ 1419531 (-) True XLOC_030734
TCONS_00059857 lncRNA upstream 456458 1454386 ~ 1456830 (-) False XLOC_030736
TCONS_00059858 lncRNA upstream 462435 1460363 ~ 1464435 (-) False XLOC_030736
TCONS_00059842 mRNA downstream 171892 824709 ~ 825920 (-) False XLOC_030722
TCONS_00059837 mRNA downstream 580277 315183 ~ 417535 (-) False XLOC_030715
TCONS_00059836 mRNA downstream 580317 315183 ~ 417495 (-) False XLOC_030715
TCONS_00059838 mRNA downstream 674100 318217 ~ 323712 (-) True XLOC_030715
TCONS_00059835 mRNA downstream 796212 31748 ~ 201600 (-) True XLOC_030710
TCONS_00059846 mRNA upstream 368 998296 ~ 1047504 (-) False XLOC_030727
TCONS_00059847 mRNA upstream 29656 1027584 ~ 1047222 (-) True XLOC_030727
TCONS_00059848 mRNA upstream 75002 1072930 ~ 1076431 (-) True XLOC_030729
TCONS_00059849 mRNA upstream 182775 1180703 ~ 1203455 (-) True XLOC_030730
TCONS_00059851 mRNA upstream 205839 1203767 ~ 1218801 (-) True XLOC_030732
TCONS_00059844 other downstream 161522 836137 ~ 836290 (-) True XLOC_030724
TCONS_00059843 other downstream 163879 833599 ~ 833933 (-) True XLOC_030723
TCONS_00059841 other downstream 175526 821952 ~ 822286 (-) True XLOC_030721
TCONS_00059840 other downstream 509837 487859 ~ 487975 (-) True XLOC_030720
TCONS_00059839 other downstream 535577 462121 ~ 462235 (-) True XLOC_030719
TCONS_00059850 other upstream 183481 1181409 ~ 1181524 (-) True XLOC_030731
TCONS_00059855 other upstream 378845 1376773 ~ 1376868 (-) True XLOC_030735
TCONS_00059864 other upstream 839221 1837149 ~ 1837260 (-) True XLOC_030739
TCONS_00059866 other upstream 954724 1952652 ~ 1952778 (-) True XLOC_030742
TCONS_00059868 other upstream 962145 1960073 ~ 1960200 (-) True XLOC_030743