RNA id: TCONS_00059866


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00059866
length 127
RNA type snoRNA
GC content 0.48
exon number 1
gene id XLOC_030742
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 1952652 ~ 1952778 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

gtgcagGTTATCTACGGACTGGCTGTTGCAGTGCTTGTTTGTCGTTCCCCCTGCAGAAATAAACATGATTCCTTCTATCCCTGTCTGTTTGCATCCTACAACTAACAGGGACGCTGGTCTCAGACAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117331

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00061911 lncRNA downstream 46115 1879511 ~ 1906537 (-) True XLOC_030740
TCONS_00059858 lncRNA downstream 488217 1460363 ~ 1464435 (-) False XLOC_030736
TCONS_00059857 lncRNA downstream 495822 1454386 ~ 1456830 (-) False XLOC_030736
TCONS_00061909 lncRNA downstream 533121 1317890 ~ 1419531 (-) False XLOC_030734
TCONS_00061910 lncRNA downstream 533121 1418148 ~ 1419531 (-) True XLOC_030734
TCONS_00061912 lncRNA upstream 36682 1989460 ~ 1991666 (-) True XLOC_030745
TCONS_00061913 lncRNA upstream 44986 1997764 ~ 1998553 (-) False XLOC_030746
TCONS_00059871 lncRNA upstream 44986 1997764 ~ 1999493 (-) False XLOC_030746
TCONS_00059881 lncRNA upstream 819511 2772289 ~ 2775472 (-) True XLOC_030755
TCONS_00061914 lncRNA upstream 1134453 3087231 ~ 3089463 (-) True XLOC_030756
TCONS_00059863 mRNA downstream 82670 1833741 ~ 1869982 (-) True XLOC_030738
TCONS_00059862 mRNA downstream 125077 1668478 ~ 1827575 (-) True XLOC_030737
TCONS_00059856 mRNA downstream 465390 1432074 ~ 1487262 (-) False XLOC_030736
TCONS_00059867 mRNA upstream 2877 1955655 ~ 1962500 (-) True XLOC_030741
TCONS_00059870 mRNA upstream 44987 1997765 ~ 1999417 (-) True XLOC_030746
TCONS_00059872 mRNA upstream 113484 2066262 ~ 2112030 (-) True XLOC_030747
TCONS_00059874 mRNA upstream 288945 2241723 ~ 2282256 (-) True XLOC_030749
TCONS_00059875 mRNA upstream 456776 2409554 ~ 2636078 (-) True XLOC_030750
TCONS_00059864 other downstream 115392 1837149 ~ 1837260 (-) True XLOC_030739
TCONS_00059855 other downstream 575784 1376773 ~ 1376868 (-) True XLOC_030735
TCONS_00059850 other downstream 771128 1181409 ~ 1181524 (-) True XLOC_030731
TCONS_00059845 other downstream 954724 997812 ~ 997928 (-) True XLOC_030726
TCONS_00059844 other downstream 1116362 836137 ~ 836290 (-) True XLOC_030724
TCONS_00059868 other upstream 7295 1960073 ~ 1960200 (-) True XLOC_030743
TCONS_00059869 other upstream 9504 1962282 ~ 1962409 (-) True XLOC_030744
TCONS_00059873 other upstream 259894 2212672 ~ 2212788 (-) True XLOC_030748
TCONS_00059909 other upstream 2270737 4223515 ~ 4226620 (-) False XLOC_030776
TCONS_00059924 other upstream 2989820 4942598 ~ 4942712 (-) True XLOC_030789

Expression Profile

//