RNA id: TCONS_00059869


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00059869
length 128
RNA type snoRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_030744
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 1962282 ~ 1962409 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GTGCAGGTTCAGTTATGGACAGGCTGTTGCAGTGCTTGTTCGTCGTTCCCCCTGCACAAATGAACATGATTCCTTCTATCCCTGTCTGTCTGCATCTCATGACTTGCAGGGACGCTGGTCTCAGACAC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000116280

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00061911 lncRNA downstream 55745 1879511 ~ 1906537 (-) True XLOC_030740
TCONS_00059858 lncRNA downstream 497847 1460363 ~ 1464435 (-) False XLOC_030736
TCONS_00059857 lncRNA downstream 505452 1454386 ~ 1456830 (-) False XLOC_030736
TCONS_00061909 lncRNA downstream 542751 1317890 ~ 1419531 (-) False XLOC_030734
TCONS_00061912 lncRNA upstream 27051 1989460 ~ 1991666 (-) True XLOC_030745
TCONS_00061913 lncRNA upstream 35355 1997764 ~ 1998553 (-) False XLOC_030746
TCONS_00059871 lncRNA upstream 35355 1997764 ~ 1999493 (-) False XLOC_030746
TCONS_00059881 lncRNA upstream 809880 2772289 ~ 2775472 (-) True XLOC_030755
TCONS_00061914 lncRNA upstream 1124822 3087231 ~ 3089463 (-) True XLOC_030756
TCONS_00059863 mRNA downstream 92300 1833741 ~ 1869982 (-) True XLOC_030738
TCONS_00059862 mRNA downstream 134707 1668478 ~ 1827575 (-) True XLOC_030737
TCONS_00059860 mRNA downstream 475020 1464613 ~ 1487262 (-) False XLOC_030736
TCONS_00059861 mRNA downstream 475023 1468461 ~ 1487259 (-) True XLOC_030736
TCONS_00059859 mRNA downstream 475026 1464291 ~ 1487256 (-) False XLOC_030736
TCONS_00059870 mRNA upstream 35356 1997765 ~ 1999417 (-) True XLOC_030746
TCONS_00059872 mRNA upstream 103853 2066262 ~ 2112030 (-) True XLOC_030747
TCONS_00059874 mRNA upstream 279314 2241723 ~ 2282256 (-) True XLOC_030749
TCONS_00059875 mRNA upstream 447145 2409554 ~ 2636078 (-) True XLOC_030750
TCONS_00059876 mRNA upstream 689003 2651412 ~ 2672492 (-) False XLOC_030751
TCONS_00059868 other downstream 2082 1960073 ~ 1960200 (-) True XLOC_030743
TCONS_00059866 other downstream 9504 1952652 ~ 1952778 (-) True XLOC_030742
TCONS_00059864 other downstream 125022 1837149 ~ 1837260 (-) True XLOC_030739
TCONS_00059855 other downstream 585414 1376773 ~ 1376868 (-) True XLOC_030735
TCONS_00059850 other downstream 780758 1181409 ~ 1181524 (-) True XLOC_030731
TCONS_00059873 other upstream 250263 2212672 ~ 2212788 (-) True XLOC_030748
TCONS_00059909 other upstream 2261106 4223515 ~ 4226620 (-) False XLOC_030776
TCONS_00059924 other upstream 2980189 4942598 ~ 4942712 (-) True XLOC_030789
TCONS_00059943 other upstream 4568658 6531067 ~ 6531182 (-) True XLOC_030808
TCONS_00059948 other upstream 4966625 6929034 ~ 6929148 (-) True XLOC_030810

Expression Profile

//