RNA id: TCONS_00059873


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00059873
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_030748
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 2212672 ~ 2212788 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tgccacagccatatcaccctgcagcccaagactggttactcactgaagctaagcagggctgagcctggtcagtacctgaatgggagacctaatgggaaaactaggttgctgctgttg

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000179591

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00059871 lncRNA downstream 213179 1997764 ~ 1999493 (-) False XLOC_030746
TCONS_00061913 lncRNA downstream 214119 1997764 ~ 1998553 (-) False XLOC_030746
TCONS_00061912 lncRNA downstream 221006 1989460 ~ 1991666 (-) True XLOC_030745
TCONS_00061911 lncRNA downstream 306135 1879511 ~ 1906537 (-) True XLOC_030740
TCONS_00059858 lncRNA downstream 748237 1460363 ~ 1464435 (-) False XLOC_030736
TCONS_00059881 lncRNA upstream 559501 2772289 ~ 2775472 (-) True XLOC_030755
TCONS_00061914 lncRNA upstream 874443 3087231 ~ 3089463 (-) True XLOC_030756
TCONS_00061915 lncRNA upstream 954411 3167199 ~ 3169025 (-) True XLOC_030758
TCONS_00059886 lncRNA upstream 1045335 3258123 ~ 3266117 (-) False XLOC_030760
TCONS_00059885 lncRNA upstream 1045335 3258123 ~ 3266117 (-) False XLOC_030760
TCONS_00059872 mRNA downstream 100642 2066262 ~ 2112030 (-) True XLOC_030747
TCONS_00059870 mRNA downstream 213255 1997765 ~ 1999417 (-) True XLOC_030746
TCONS_00059865 mRNA downstream 249174 1950660 ~ 1963498 (-) False XLOC_030741
TCONS_00059867 mRNA downstream 250172 1955655 ~ 1962500 (-) True XLOC_030741
TCONS_00059863 mRNA downstream 342690 1833741 ~ 1869982 (-) True XLOC_030738
TCONS_00059874 mRNA upstream 28935 2241723 ~ 2282256 (-) True XLOC_030749
TCONS_00059875 mRNA upstream 196766 2409554 ~ 2636078 (-) True XLOC_030750
TCONS_00059876 mRNA upstream 438624 2651412 ~ 2672492 (-) False XLOC_030751
TCONS_00059877 mRNA upstream 438624 2651412 ~ 2676783 (-) True XLOC_030751
TCONS_00059878 mRNA upstream 467667 2680455 ~ 2689753 (-) True XLOC_030752
TCONS_00059869 other downstream 250263 1962282 ~ 1962409 (-) True XLOC_030744
TCONS_00059868 other downstream 252472 1960073 ~ 1960200 (-) True XLOC_030743
TCONS_00059866 other downstream 259894 1952652 ~ 1952778 (-) True XLOC_030742
TCONS_00059864 other downstream 375412 1837149 ~ 1837260 (-) True XLOC_030739
TCONS_00059855 other downstream 835804 1376773 ~ 1376868 (-) True XLOC_030735
TCONS_00059909 other upstream 2010727 4223515 ~ 4226620 (-) False XLOC_030776
TCONS_00059924 other upstream 2729810 4942598 ~ 4942712 (-) True XLOC_030789
TCONS_00059943 other upstream 4318279 6531067 ~ 6531182 (-) True XLOC_030808
TCONS_00059948 other upstream 4716246 6929034 ~ 6929148 (-) True XLOC_030810
TCONS_00059949 other upstream 4935503 7148291 ~ 7148407 (-) True XLOC_030811

Expression Profile

//