RNA id: TCONS_00059943


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00059943
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.55
exon number 1
gene id XLOC_030808
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 6531067 ~ 6531182 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

agccacagccatatcaccctgcagcccaagactggttactcactgaagctatgcagggctgagcctggtcagtacctggatgggagaccacatgggaaaactgtTGGCAggtgttg

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000174835

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00061934 lncRNA downstream 19228 6511314 ~ 6511839 (-) True XLOC_030806
TCONS_00061510 lncRNA downstream 58313 6471025 ~ 6472754 (-) False XLOC_030804
TCONS_00061509 lncRNA downstream 58313 6471025 ~ 6472754 (-) False XLOC_030804
TCONS_00061933 lncRNA downstream 58316 6471965 ~ 6472751 (-) True XLOC_030804
TCONS_00061932 lncRNA downstream 58333 6471965 ~ 6472734 (-) False XLOC_030804
TCONS_00059947 lncRNA upstream 205094 6736276 ~ 6745488 (-) True XLOC_030809
TCONS_00061511 lncRNA upstream 845800 7376982 ~ 7377405 (-) True XLOC_030813
TCONS_00061512 lncRNA upstream 1160693 7691875 ~ 7712224 (-) True XLOC_030815
TCONS_00061513 lncRNA upstream 1193882 7725064 ~ 7725275 (-) True XLOC_030818
TCONS_00061514 lncRNA upstream 1562103 8093285 ~ 8096026 (-) True XLOC_030822
TCONS_00059940 mRNA downstream 22817 6489260 ~ 6508250 (-) True XLOC_030805
TCONS_00059939 mRNA downstream 97490 6401427 ~ 6433577 (-) True XLOC_030803
TCONS_00059938 mRNA downstream 153202 6350328 ~ 6377865 (-) True XLOC_030802
TCONS_00059937 mRNA downstream 700030 5708576 ~ 5831037 (-) True XLOC_030798
TCONS_00059936 mRNA downstream 861188 5666864 ~ 5669879 (-) True XLOC_030797
TCONS_00059944 mRNA upstream 194973 6726155 ~ 6745511 (-) False XLOC_030809
TCONS_00059945 mRNA upstream 195359 6726541 ~ 6745454 (-) False XLOC_030809
TCONS_00059946 mRNA upstream 195609 6726791 ~ 6745442 (-) False XLOC_030809
TCONS_00059950 mRNA upstream 667575 7198757 ~ 7199998 (-) True XLOC_030812
TCONS_00059952 mRNA upstream 956882 7488064 ~ 7513082 (-) False XLOC_030815
TCONS_00059924 other downstream 1588355 4942598 ~ 4942712 (-) True XLOC_030789
TCONS_00059909 other downstream 2304447 4223515 ~ 4226620 (-) False XLOC_030776
TCONS_00059873 other downstream 4318279 2212672 ~ 2212788 (-) True XLOC_030748
TCONS_00059869 other downstream 4568658 1962282 ~ 1962409 (-) True XLOC_030744
TCONS_00059868 other downstream 4570867 1960073 ~ 1960200 (-) True XLOC_030743
TCONS_00059948 other upstream 397852 6929034 ~ 6929148 (-) True XLOC_030810
TCONS_00059949 other upstream 617109 7148291 ~ 7148407 (-) True XLOC_030811
TCONS_00059951 other upstream 900243 7431425 ~ 7431523 (-) True XLOC_030814
TCONS_00059954 other upstream 1101513 7632695 ~ 7632819 (-) True XLOC_030816
TCONS_00059964 other upstream 1441577 7972759 ~ 7972879 (-) True XLOC_030821

Expression Profile

//