RNA id: TCONS_00060737


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00060737
length 129
RNA type mRNA
GC content 0.28
exon number 6
gene id XLOC_031281
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 38732861 ~ 38762414 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

aaaacaaaaagtaACTTTGTTATACATGGGTGTTTCAATTTGCATCGAAACAAGGGAAAAATACCAGattttaaaaaccaaagTAAATGTGTGGCGAGATCTGATAATAACATAAatttgaaaacaata

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000186343

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00062051 lncRNA downstream 99142 38614868 ~ 38633719 (-) True XLOC_031276
TCONS_00062052 lncRNA downstream 109890 38620957 ~ 38622971 (-) True XLOC_031277
TCONS_00060719 lncRNA downstream 477117 38250044 ~ 38255744 (-) True XLOC_031269
TCONS_00062050 lncRNA downstream 477161 38250044 ~ 38255700 (-) False XLOC_031269
TCONS_00061542 lncRNA downstream 626062 38105452 ~ 38106799 (-) True XLOC_031262
TCONS_00062053 lncRNA upstream 9933 38772347 ~ 38773486 (-) False XLOC_031282
TCONS_00060739 lncRNA upstream 9933 38772347 ~ 38777792 (-) True XLOC_031282
TCONS_00062054 lncRNA upstream 28318 38790732 ~ 38791845 (-) True XLOC_031284
TCONS_00062055 lncRNA upstream 279640 39042054 ~ 39045354 (-) True XLOC_031288
TCONS_00062056 lncRNA upstream 1118244 39880658 ~ 39881073 (-) True XLOC_031294
TCONS_00060735 mRNA downstream 21355 38686046 ~ 38711506 (-) True XLOC_031279
TCONS_00060733 mRNA downstream 87508 38641951 ~ 38645353 (-) False XLOC_031278
TCONS_00060734 mRNA downstream 87569 38644385 ~ 38645292 (-) True XLOC_031278
TCONS_00060732 mRNA downstream 89673 38641933 ~ 38643188 (-) False XLOC_031278
TCONS_00060731 mRNA downstream 121454 38604877 ~ 38611407 (-) True XLOC_031275
TCONS_00060738 mRNA upstream 9365 38771779 ~ 38777852 (-) False XLOC_031282
TCONS_00060740 mRNA upstream 24067 38786481 ~ 38824466 (-) False XLOC_031283
TCONS_00060741 mRNA upstream 24842 38787256 ~ 38820046 (-) False XLOC_031283
TCONS_00060746 mRNA upstream 392203 39154617 ~ 39171302 (-) True XLOC_031289
TCONS_00060748 mRNA upstream 623811 39386225 ~ 39474235 (-) True XLOC_031291
TCONS_00060736 other downstream 27030 38697496 ~ 38705831 (-) True XLOC_031280
TCONS_00060729 other downstream 226213 38490346 ~ 38506648 (-) True XLOC_031273
TCONS_00060704 other downstream 694644 38035337 ~ 38038217 (-) True XLOC_031259
TCONS_00060699 other downstream 769098 37948854 ~ 37963763 (-) False XLOC_031257
TCONS_00060700 other downstream 772882 37953336 ~ 37959979 (-) True XLOC_031257
TCONS_00060742 other upstream 35790 38798204 ~ 38798318 (-) True XLOC_031285
TCONS_00060743 other upstream 51750 38814164 ~ 38824346 (-) True XLOC_031283
TCONS_00060744 other upstream 130208 38892622 ~ 38892759 (-) True XLOC_031286
TCONS_00060745 other upstream 267397 39029811 ~ 39029925 (-) True XLOC_031287
TCONS_00060747 other upstream 562354 39324768 ~ 39324884 (-) True XLOC_031290