RNA id: TCONS_00060742


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00060742
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.57
exon number 1
gene id XLOC_031285
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 38798204 ~ 38798318 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCCAGCAGCTTGCTTTCTGCAACGcacacatggtcgcccactgaagctaagcagggctgtgcccagtcagtacgtggatgggagaccacatgggaaagctagattgctgccTGAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000191335

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00062054 lncRNA downstream 6359 38790732 ~ 38791845 (-) True XLOC_031284
TCONS_00060739 lncRNA downstream 20412 38772347 ~ 38777792 (-) True XLOC_031282
TCONS_00062053 lncRNA downstream 24718 38772347 ~ 38773486 (-) False XLOC_031282
TCONS_00062051 lncRNA downstream 164485 38614868 ~ 38633719 (-) True XLOC_031276
TCONS_00062052 lncRNA downstream 175233 38620957 ~ 38622971 (-) True XLOC_031277
TCONS_00062055 lncRNA upstream 243736 39042054 ~ 39045354 (-) True XLOC_031288
TCONS_00062056 lncRNA upstream 1082340 39880658 ~ 39881073 (-) True XLOC_031294
TCONS_00062057 lncRNA upstream 1184370 39982688 ~ 39985497 (-) True XLOC_031295
TCONS_00062058 lncRNA upstream 1429970 40228288 ~ 40230908 (-) True XLOC_031299
TCONS_00060768 lncRNA upstream 1758914 40557232 ~ 40713887 (-) False XLOC_031304
TCONS_00060738 mRNA downstream 20352 38771779 ~ 38777852 (-) False XLOC_031282
TCONS_00060737 mRNA downstream 35790 38732861 ~ 38762414 (-) True XLOC_031281
TCONS_00060735 mRNA downstream 86698 38686046 ~ 38711506 (-) True XLOC_031279
TCONS_00060733 mRNA downstream 152851 38641951 ~ 38645353 (-) False XLOC_031278
TCONS_00060734 mRNA downstream 152912 38644385 ~ 38645292 (-) True XLOC_031278
TCONS_00060746 mRNA upstream 356299 39154617 ~ 39171302 (-) True XLOC_031289
TCONS_00060748 mRNA upstream 587907 39386225 ~ 39474235 (-) True XLOC_031291
TCONS_00060749 mRNA upstream 881449 39679767 ~ 39698224 (-) False XLOC_031292
TCONS_00060750 mRNA upstream 881449 39679767 ~ 39702345 (-) True XLOC_031292
TCONS_00060752 mRNA upstream 908027 39706345 ~ 39805874 (-) False XLOC_031293
TCONS_00060736 other downstream 92373 38697496 ~ 38705831 (-) True XLOC_031280
TCONS_00060729 other downstream 291556 38490346 ~ 38506648 (-) True XLOC_031273
TCONS_00060704 other downstream 759987 38035337 ~ 38038217 (-) True XLOC_031259
TCONS_00060699 other downstream 834441 37948854 ~ 37963763 (-) False XLOC_031257
TCONS_00060700 other downstream 838225 37953336 ~ 37959979 (-) True XLOC_031257
TCONS_00060743 other upstream 15846 38814164 ~ 38824346 (-) True XLOC_031283
TCONS_00060744 other upstream 94304 38892622 ~ 38892759 (-) True XLOC_031286
TCONS_00060745 other upstream 231493 39029811 ~ 39029925 (-) True XLOC_031287
TCONS_00060747 other upstream 526450 39324768 ~ 39324884 (-) True XLOC_031290
TCONS_00060755 other upstream 978353 39776671 ~ 39805606 (-) True XLOC_031293