RNA id: TCONS_00062453


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00062453
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_031897
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 11774617 ~ 11774732 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GAGGATTGTAATAGCTCtcagcaactctcacatggtcgcccactgaagctaagcagggctgcgcctggtcagtacctggattggagaccacatgggaaagtaggttgctgtcggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000178624

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00062447 lncRNA upstream 375873 11397653 ~ 11398744 (+) True XLOC_031893
TCONS_00064819 lncRNA upstream 766187 10988645 ~ 11008430 (+) False XLOC_031888
TCONS_00062435 lncRNA upstream 766187 10988764 ~ 11008430 (+) True XLOC_031888
TCONS_00064607 lncRNA upstream 843527 10930890 ~ 10931090 (+) True XLOC_031887
TCONS_00064818 lncRNA upstream 884393 10889061 ~ 10890224 (+) True XLOC_031885
TCONS_00062477 lncRNA downstream 1212121 12986853 ~ 12993502 (+) False XLOC_031907
TCONS_00062476 lncRNA downstream 1212124 12986856 ~ 12990694 (+) True XLOC_031907
TCONS_00062479 lncRNA downstream 1253132 13027864 ~ 13031519 (+) True XLOC_031908
TCONS_00062487 lncRNA downstream 1342809 13117541 ~ 13123424 (+) False XLOC_031912
TCONS_00064820 lncRNA downstream 1485350 13260082 ~ 13267143 (+) True XLOC_031915
TCONS_00062452 mRNA upstream 10279 11760749 ~ 11764338 (+) True XLOC_031896
TCONS_00062451 mRNA upstream 69937 11681011 ~ 11704680 (+) True XLOC_031895
TCONS_00062449 mRNA upstream 71865 11680726 ~ 11702752 (+) False XLOC_031895
TCONS_00062450 mRNA upstream 75435 11681011 ~ 11699182 (+) False XLOC_031895
TCONS_00062448 mRNA upstream 279016 11438972 ~ 11495601 (+) True XLOC_031894
TCONS_00062454 mRNA downstream 55135 11829867 ~ 11994799 (+) False XLOC_031898
TCONS_00062458 mRNA downstream 75627 11850359 ~ 11978997 (+) False XLOC_031898
TCONS_00062457 mRNA downstream 75627 11850359 ~ 11978997 (+) False XLOC_031898
TCONS_00062456 mRNA downstream 75627 11850359 ~ 11978997 (+) False XLOC_031898
TCONS_00062455 mRNA downstream 75627 11850359 ~ 11978997 (+) False XLOC_031898
TCONS_00062446 other upstream 366480 11397641 ~ 11408137 (+) False XLOC_031893
TCONS_00062436 other upstream 756085 11018416 ~ 11018532 (+) True XLOC_031889
TCONS_00062432 other upstream 907476 10867024 ~ 10867141 (+) True XLOC_031883
TCONS_00062404 other upstream 1865855 9901124 ~ 9908762 (+) False XLOC_031864
TCONS_00062400 other upstream 1896398 9877713 ~ 9878219 (+) False XLOC_031862
TCONS_00062481 other downstream 1265258 13039990 ~ 13045501 (+) True XLOC_031909
TCONS_00062509 other downstream 2206213 13980945 ~ 13981092 (+) True XLOC_031925
TCONS_00062521 other downstream 3769323 15544055 ~ 15544170 (+) True XLOC_031935
TCONS_00062540 other downstream 5276307 17051039 ~ 17051135 (+) True XLOC_031953
TCONS_00062544 other downstream 5430460 17205192 ~ 17205289 (+) True XLOC_031958