RNA id: TCONS_00062521



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00062521
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_031935
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 15544055 ~ 15544170 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TTTATTAGCCACAGCCAACtgtgcagcccaagaccggttaactgaagctaagcagggctgagcctggtcagtacctggatgggagacagctagggaaaactaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000176076

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00064823 lncRNA upstream 235470 15305765 ~ 15308585 (+) False XLOC_031933
TCONS_00064824 lncRNA upstream 235470 15306023 ~ 15308585 (+) True XLOC_031933
TCONS_00062512 lncRNA upstream 586667 14950471 ~ 14957388 (+) True XLOC_031927
TCONS_00064822 lncRNA upstream 1752735 13787917 ~ 13791320 (+) False XLOC_031922
TCONS_00064608 lncRNA upstream 1755406 13780630 ~ 13788649 (+) False XLOC_031922
TCONS_00062524 lncRNA downstream 351464 15895634 ~ 15897758 (+) False XLOC_031937
TCONS_00064609 lncRNA downstream 353112 15897282 ~ 15902635 (+) False XLOC_031937
TCONS_00062526 lncRNA downstream 394451 15938621 ~ 15940105 (+) True XLOC_031938
TCONS_00064610 lncRNA downstream 446765 15990935 ~ 15993964 (+) False XLOC_031939
TCONS_00064611 lncRNA downstream 447705 15991875 ~ 15993477 (+) False XLOC_031939
TCONS_00062520 mRNA upstream 96059 15373153 ~ 15447996 (+) True XLOC_031934
TCONS_00062518 mRNA upstream 243915 15268685 ~ 15300140 (+) False XLOC_031932
TCONS_00062519 mRNA upstream 244111 15268703 ~ 15299944 (+) True XLOC_031932
TCONS_00062517 mRNA upstream 284636 15250672 ~ 15259419 (+) True XLOC_031931
TCONS_00062516 mRNA upstream 297521 15210072 ~ 15246534 (+) True XLOC_031930
TCONS_00062522 mRNA downstream 218477 15762647 ~ 15893049 (+) False XLOC_031936
TCONS_00062523 mRNA downstream 218480 15762650 ~ 15790424 (+) True XLOC_031936
TCONS_00062525 mRNA downstream 355439 15899609 ~ 15900954 (+) True XLOC_031937
TCONS_00062528 mRNA downstream 487019 16031189 ~ 16034286 (+) True XLOC_031940
TCONS_00062530 mRNA downstream 862553 16406723 ~ 16423323 (+) True XLOC_031942
TCONS_00062509 other upstream 1562963 13980945 ~ 13981092 (+) True XLOC_031925
TCONS_00062481 other upstream 2498554 13039990 ~ 13045501 (+) True XLOC_031909
TCONS_00062453 other upstream 3769323 11774617 ~ 11774732 (+) True XLOC_031897
TCONS_00062446 other upstream 4135918 11397641 ~ 11408137 (+) False XLOC_031893
TCONS_00062436 other upstream 4525523 11018416 ~ 11018532 (+) True XLOC_031889
TCONS_00062540 other downstream 1506869 17051039 ~ 17051135 (+) True XLOC_031953
TCONS_00062544 other downstream 1661022 17205192 ~ 17205289 (+) True XLOC_031958
TCONS_00062547 other downstream 1773387 17317557 ~ 17317653 (+) True XLOC_031961
TCONS_00062548 other downstream 1837315 17381485 ~ 17381582 (+) True XLOC_031962
TCONS_00062555 other downstream 2710230 18254400 ~ 18261416 (+) True XLOC_031969