RNA id: TCONS_00062547



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00062547
length 97
RNA type miRNA
GC content 0.61
exon number 1
gene id XLOC_031961
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 17317557 ~ 17317653 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


aggttttctggtttgacgtcccggtgcaggacgccgcggctctcgcagtgttttagggccgcgatcagctgcaccagcactttcttggccagacgct

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000179705

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00064828 lncRNA upstream 43140 17058192 ~ 17274417 (+) True XLOC_031955
TCONS_00064827 lncRNA upstream 508331 16799202 ~ 16809226 (+) False XLOC_031948
TCONS_00064825 lncRNA upstream 642873 16591985 ~ 16674684 (+) True XLOC_031945
TCONS_00064826 lncRNA upstream 648411 16667458 ~ 16669146 (+) True XLOC_031946
TCONS_00062529 lncRNA upstream 920032 16394629 ~ 16397525 (+) True XLOC_031941
TCONS_00064612 lncRNA downstream 214365 17532018 ~ 17533025 (+) True XLOC_031963
TCONS_00062549 lncRNA downstream 294391 17612044 ~ 17613202 (+) True XLOC_031964
TCONS_00064613 lncRNA downstream 389356 17707009 ~ 17707782 (+) True XLOC_031965
TCONS_00062553 lncRNA downstream 851306 18168959 ~ 18177200 (+) True XLOC_031967
TCONS_00062556 lncRNA downstream 955944 18273597 ~ 18274390 (+) True XLOC_031968
TCONS_00062546 mRNA upstream 48560 17267681 ~ 17268997 (+) True XLOC_031960
TCONS_00062545 mRNA upstream 108292 17208022 ~ 17209265 (+) True XLOC_031959
TCONS_00062543 mRNA upstream 135084 17181157 ~ 17182473 (+) True XLOC_031957
TCONS_00062542 mRNA upstream 202564 17113677 ~ 17114993 (+) True XLOC_031956
TCONS_00062541 mRNA upstream 262591 17053650 ~ 17054966 (+) True XLOC_031954
TCONS_00062550 mRNA downstream 471828 17789481 ~ 17790513 (+) True XLOC_031966
TCONS_00062551 mRNA downstream 824970 18142623 ~ 18177170 (+) False XLOC_031967
TCONS_00062552 mRNA downstream 825064 18142717 ~ 18181589 (+) False XLOC_031967
TCONS_00062554 mRNA downstream 933487 18251140 ~ 18292410 (+) False XLOC_031968
TCONS_00062557 mRNA downstream 980791 18298444 ~ 18347478 (+) False XLOC_031970
TCONS_00062544 other upstream 112268 17205192 ~ 17205289 (+) True XLOC_031958
TCONS_00062540 other upstream 266422 17051039 ~ 17051135 (+) True XLOC_031953
TCONS_00062521 other upstream 1773387 15544055 ~ 15544170 (+) True XLOC_031935
TCONS_00062509 other upstream 3336465 13980945 ~ 13981092 (+) True XLOC_031925
TCONS_00062481 other upstream 4272056 13039990 ~ 13045501 (+) True XLOC_031909
TCONS_00062548 other downstream 63832 17381485 ~ 17381582 (+) True XLOC_031962
TCONS_00062555 other downstream 936747 18254400 ~ 18261416 (+) True XLOC_031969
TCONS_00062570 other downstream 1224988 18542641 ~ 18543403 (+) True XLOC_031975
TCONS_00062573 other downstream 1236014 18553667 ~ 18562835 (+) True XLOC_031976
TCONS_00062576 other downstream 1729334 19046987 ~ 19049980 (+) True XLOC_031981