RNA id: TCONS_00062548



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00062548
length 98
RNA type miRNA
GC content 0.61
exon number 1
gene id XLOC_031962
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 17381485 ~ 17381582 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


caggttttctggtttgacgtcccggtgcaggacgccgcggctctcgcagtgttttagggccgcgatcagctgcaccagcactttcttggccagacgct

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000192221

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00064828 lncRNA upstream 107068 17058192 ~ 17274417 (+) True XLOC_031955
TCONS_00064827 lncRNA upstream 572259 16799202 ~ 16809226 (+) False XLOC_031948
TCONS_00064825 lncRNA upstream 706801 16591985 ~ 16674684 (+) True XLOC_031945
TCONS_00064826 lncRNA upstream 712339 16667458 ~ 16669146 (+) True XLOC_031946
TCONS_00062529 lncRNA upstream 983960 16394629 ~ 16397525 (+) True XLOC_031941
TCONS_00064612 lncRNA downstream 150436 17532018 ~ 17533025 (+) True XLOC_031963
TCONS_00062549 lncRNA downstream 230462 17612044 ~ 17613202 (+) True XLOC_031964
TCONS_00064613 lncRNA downstream 325427 17707009 ~ 17707782 (+) True XLOC_031965
TCONS_00062553 lncRNA downstream 787377 18168959 ~ 18177200 (+) True XLOC_031967
TCONS_00062556 lncRNA downstream 892015 18273597 ~ 18274390 (+) True XLOC_031968
TCONS_00062546 mRNA upstream 112488 17267681 ~ 17268997 (+) True XLOC_031960
TCONS_00062545 mRNA upstream 172220 17208022 ~ 17209265 (+) True XLOC_031959
TCONS_00062543 mRNA upstream 199012 17181157 ~ 17182473 (+) True XLOC_031957
TCONS_00062542 mRNA upstream 266492 17113677 ~ 17114993 (+) True XLOC_031956
TCONS_00062541 mRNA upstream 326519 17053650 ~ 17054966 (+) True XLOC_031954
TCONS_00062550 mRNA downstream 407899 17789481 ~ 17790513 (+) True XLOC_031966
TCONS_00062551 mRNA downstream 761041 18142623 ~ 18177170 (+) False XLOC_031967
TCONS_00062552 mRNA downstream 761135 18142717 ~ 18181589 (+) False XLOC_031967
TCONS_00062554 mRNA downstream 869558 18251140 ~ 18292410 (+) False XLOC_031968
TCONS_00062557 mRNA downstream 916862 18298444 ~ 18347478 (+) False XLOC_031970
TCONS_00062547 other upstream 63832 17317557 ~ 17317653 (+) True XLOC_031961
TCONS_00062544 other upstream 176196 17205192 ~ 17205289 (+) True XLOC_031958
TCONS_00062540 other upstream 330350 17051039 ~ 17051135 (+) True XLOC_031953
TCONS_00062521 other upstream 1837315 15544055 ~ 15544170 (+) True XLOC_031935
TCONS_00062509 other upstream 3400393 13980945 ~ 13981092 (+) True XLOC_031925
TCONS_00062555 other downstream 872818 18254400 ~ 18261416 (+) True XLOC_031969
TCONS_00062570 other downstream 1161059 18542641 ~ 18543403 (+) True XLOC_031975
TCONS_00062573 other downstream 1172085 18553667 ~ 18562835 (+) True XLOC_031976
TCONS_00062576 other downstream 1665405 19046987 ~ 19049980 (+) True XLOC_031981
TCONS_00062579 other downstream 2408618 19790200 ~ 19802529 (+) True XLOC_031983