RNA id: TCONS_00073333



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00073333
length 790
RNA type processed_transcript
GC content 0.37
exon number 4
gene id XLOC_037261
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 33074680 ~ 33082181 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TTGATAAACATCAGTTGATGTTGATGACAGcttcatttttaatgattttgtgCTGTGCCTGTTTTCATCTCAGTAAAATTGatacaagttatttaaaaaaaaaactgtatttcacAAATTCAAATCTGACACTGAACTTTCTGAAGGGATTAGCCAGTCAAAAGACGGAAATCGAAGCAGCACATGGAATGCCCATTATGCCCTTGAACCATGGGAAATGAGCGGCAGATGCAAGAGGGACTCTACGCTCAGACTTGCACGCACtgacctgcacttccagacctatTGTTTTCTCAGACAGTGCTACCTGCTGTTGGGTTGGCTGAAGCGGCAGGGAGAACATGACGGAAAGAAGCAGAAGATTTCTCAGCATTGCCATGATGAACCTGAAAATGAATAAGATGGAAGAGATAATGTGCGTGTTCACGATCCACACACTGTTGATtctcaaattattttaaagataGCATACAGCAGTACCTTGAGCAGATTATTCAGCAAGTTGCTGTATCAACTCACCTTAGTGTTCAGATGATTGAAGAGTTAGTGAAGTTCCAGAAAGAGTCCTGCTTTTATGCTGTTACGTGTGTATGAGTCATGAGGATGATGCAGGATGTGACTTGTTAAATTGTGgatttattcaaatttttatgAGAATGTGGGgttaagtatatatttattttagtttaaactaTTTAGCTAGTTTAAATATGATTCAAAAGAGACATTTTTTCTTATTAACAAAATATTTGAAGGACAACAAGGAAATAAAGTACATGCATAAAGATGA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000138331

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075156 lncRNA upstream 179580 32891897 ~ 32895100 (+) True XLOC_037257
TCONS_00073321 lncRNA upstream 423243 32649076 ~ 32651437 (+) False XLOC_037255
TCONS_00073325 lncRNA upstream 424576 32649507 ~ 32650104 (+) True XLOC_037255
TCONS_00074918 lncRNA upstream 537296 32536746 ~ 32537384 (+) True XLOC_037254
TCONS_00075155 lncRNA upstream 725655 32344883 ~ 32349025 (+) True XLOC_037252
TCONS_00073335 lncRNA downstream 63404 33145585 ~ 33147007 (+) False XLOC_037262
TCONS_00073336 lncRNA downstream 63891 33146072 ~ 33147664 (+) True XLOC_037262
TCONS_00075157 lncRNA downstream 644502 33726683 ~ 33742935 (+) False XLOC_037276
TCONS_00075158 lncRNA downstream 644513 33726694 ~ 33742935 (+) False XLOC_037276
TCONS_00075159 lncRNA downstream 644517 33726698 ~ 33742935 (+) False XLOC_037276
TCONS_00073332 mRNA upstream 19240 33009284 ~ 33055440 (+) True XLOC_037260
TCONS_00073331 mRNA upstream 93020 32978302 ~ 32981660 (+) True XLOC_037259
TCONS_00073329 mRNA upstream 128241 32930622 ~ 32946439 (+) False XLOC_037258
TCONS_00073330 mRNA upstream 133064 32931625 ~ 32941616 (+) True XLOC_037258
TCONS_00073327 mRNA upstream 199112 32860345 ~ 32875568 (+) False XLOC_037256
TCONS_00073334 mRNA downstream 63341 33145522 ~ 33148873 (+) False XLOC_037262
TCONS_00073337 mRNA downstream 72660 33154841 ~ 33169215 (+) False XLOC_037263
TCONS_00073338 mRNA downstream 76010 33158191 ~ 33162205 (+) True XLOC_037263
TCONS_00073339 mRNA downstream 91883 33174064 ~ 33195586 (+) False XLOC_037264
TCONS_00073340 mRNA downstream 92012 33174193 ~ 33187569 (+) False XLOC_037264
TCONS_00073322 other upstream 422608 32649076 ~ 32652072 (+) False XLOC_037255
TCONS_00073307 other upstream 887428 32184055 ~ 32187252 (+) True XLOC_037247
TCONS_00073304 other upstream 970873 32100203 ~ 32103807 (+) True XLOC_037246
TCONS_00073294 other upstream 1081247 31993311 ~ 31993433 (+) True XLOC_037244
TCONS_00073291 other upstream 1502001 31566399 ~ 31572679 (+) True XLOC_037241
TCONS_00073341 other downstream 98501 33180682 ~ 33181352 (+) True XLOC_037264
TCONS_00073351 other downstream 162017 33244198 ~ 33245755 (+) True XLOC_037270
TCONS_00073362 other downstream 728265 33810446 ~ 33836470 (+) True XLOC_037278
TCONS_00073383 other downstream 1343547 34425728 ~ 34429112 (+) False XLOC_037290
TCONS_00073385 other downstream 1343594 34425775 ~ 34429120 (+) False XLOC_037290

Expression Profile


//