RNA id: TCONS_00073351



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00073351
length 285
RNA type unprocessed_pseudogene
GC content 0.45
exon number 3
gene id XLOC_037270
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 33244198 ~ 33245755 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


AGAAACTGTCAAAGTCTTGGAGCAAATCTCGCTTCTGTGCATAACAAAGTGGAAAATTATTTCCTGCTTTCTCTGGTACCTGGTTCCACACGTTGCTGGATTGGTGGCCATGATGgaaggaaagtggctGTGGTTTGATGGATCTGTGTATGATTATACAGATTGGTGCACTGGAGAGCCTAACAACAGCCATAATGAGGAGCACTGCACGGAGATAAACTTTAGCaCCAACCATTGCTGGAGTGATACGCCTTGTTCAAAGTCAATGGGGTATATTTGAGCCAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000147066

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00073336 lncRNA upstream 96534 33146072 ~ 33147664 (+) True XLOC_037262
TCONS_00073335 lncRNA upstream 97191 33145585 ~ 33147007 (+) False XLOC_037262
TCONS_00075156 lncRNA upstream 349098 32891897 ~ 32895100 (+) True XLOC_037257
TCONS_00073321 lncRNA upstream 592761 32649076 ~ 32651437 (+) False XLOC_037255
TCONS_00075157 lncRNA downstream 480928 33726683 ~ 33742935 (+) False XLOC_037276
TCONS_00075158 lncRNA downstream 480939 33726694 ~ 33742935 (+) False XLOC_037276
TCONS_00075159 lncRNA downstream 480943 33726698 ~ 33742935 (+) False XLOC_037276
TCONS_00075160 lncRNA downstream 480959 33726714 ~ 33764177 (+) False XLOC_037276
TCONS_00075161 lncRNA downstream 487406 33733161 ~ 33752405 (+) True XLOC_037276
TCONS_00073349 mRNA upstream 5949 33236844 ~ 33238249 (+) False XLOC_037269
TCONS_00073350 mRNA upstream 5958 33236846 ~ 33238240 (+) True XLOC_037269
TCONS_00073348 mRNA upstream 20369 33222911 ~ 33223829 (+) True XLOC_037268
TCONS_00073346 mRNA upstream 22528 33220342 ~ 33221670 (+) False XLOC_037267
TCONS_00073347 mRNA upstream 22539 33220347 ~ 33221659 (+) True XLOC_037267
TCONS_00073352 mRNA downstream 15575 33261330 ~ 33321040 (+) False XLOC_037271
TCONS_00073353 mRNA downstream 21456 33267211 ~ 33319395 (+) True XLOC_037271
TCONS_00073354 mRNA downstream 88746 33334501 ~ 33354738 (+) False XLOC_037272
TCONS_00073355 mRNA downstream 94556 33340311 ~ 33346269 (+) True XLOC_037272
TCONS_00073356 mRNA downstream 111256 33357011 ~ 33361199 (+) True XLOC_037273
TCONS_00073341 other upstream 62846 33180682 ~ 33181352 (+) True XLOC_037264
TCONS_00073333 other upstream 162017 33074680 ~ 33082181 (+) True XLOC_037261
TCONS_00073322 other upstream 592126 32649076 ~ 32652072 (+) False XLOC_037255
TCONS_00073307 other upstream 1056946 32184055 ~ 32187252 (+) True XLOC_037247
TCONS_00073304 other upstream 1140391 32100203 ~ 32103807 (+) True XLOC_037246
TCONS_00073362 other downstream 564691 33810446 ~ 33836470 (+) True XLOC_037278
TCONS_00073383 other downstream 1179973 34425728 ~ 34429112 (+) False XLOC_037290
TCONS_00073385 other downstream 1180020 34425775 ~ 34429120 (+) False XLOC_037290
TCONS_00073386 other downstream 1180536 34426291 ~ 34429220 (+) True XLOC_037290
TCONS_00073390 other downstream 1544995 34790750 ~ 34790887 (+) True XLOC_037293

Expression Profile


//