RNA id: TCONS_00073390



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00073390
length 138
RNA type rRNA
GC content 0.57
exon number 1
gene id XLOC_037293
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 34790750 ~ 34790887 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


tccccatgaccatcagggCAGCAGCAGCTCGGGATATGAGTCATGTACTCACAtgatcgcccactgaagctaagcagggctgtgcccggtcagtacctgaatgggagtccacatgggaaagctaggctgcagctggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120823

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00073382 lncRNA upstream 371197 34416401 ~ 34419553 (+) False XLOC_037290
TCONS_00075165 lncRNA upstream 399597 34390451 ~ 34391153 (+) True XLOC_037289
TCONS_00074930 lncRNA upstream 412947 34375528 ~ 34377803 (+) True XLOC_037287
TCONS_00074929 lncRNA upstream 414340 34373486 ~ 34376410 (+) False XLOC_037287
TCONS_00074928 lncRNA upstream 416318 34373475 ~ 34374432 (+) False XLOC_037287
TCONS_00073391 lncRNA downstream 31962 34822849 ~ 34828098 (+) False XLOC_037294
TCONS_00073392 lncRNA downstream 35778 34826665 ~ 34828098 (+) True XLOC_037294
TCONS_00073393 lncRNA downstream 160055 34950942 ~ 34959774 (+) False XLOC_037295
TCONS_00075166 lncRNA downstream 179956 34970843 ~ 34973324 (+) True XLOC_037297
TCONS_00073399 lncRNA downstream 215204 35006091 ~ 35010396 (+) True XLOC_037298
TCONS_00073389 mRNA upstream 143055 34641237 ~ 34647695 (+) True XLOC_037292
TCONS_00073387 mRNA upstream 308052 34433053 ~ 34482698 (+) False XLOC_037291
TCONS_00073388 mRNA upstream 313197 34434943 ~ 34477553 (+) True XLOC_037291
TCONS_00073384 mRNA upstream 361175 34425736 ~ 34429575 (+) False XLOC_037290
TCONS_00073380 mRNA upstream 362598 34397516 ~ 34428152 (+) False XLOC_037290
TCONS_00073394 mRNA downstream 160055 34950942 ~ 34968429 (+) False XLOC_037295
TCONS_00073395 mRNA downstream 161316 34952203 ~ 34962725 (+) False XLOC_037295
TCONS_00073396 mRNA downstream 161382 34952269 ~ 34962969 (+) True XLOC_037295
TCONS_00073398 mRNA downstream 205358 34996245 ~ 35009747 (+) False XLOC_037298
TCONS_00073400 mRNA downstream 223626 35014513 ~ 35025517 (+) False XLOC_037299
TCONS_00073386 other upstream 361530 34426291 ~ 34429220 (+) True XLOC_037290
TCONS_00073385 other upstream 361630 34425775 ~ 34429120 (+) False XLOC_037290
TCONS_00073383 other upstream 361638 34425728 ~ 34429112 (+) False XLOC_037290
TCONS_00073362 other upstream 954280 33810446 ~ 33836470 (+) True XLOC_037278
TCONS_00073351 other upstream 1544995 33244198 ~ 33245755 (+) True XLOC_037270
TCONS_00073397 other downstream 178563 34969450 ~ 34969567 (+) True XLOC_037296
TCONS_00073405 other downstream 226960 35017847 ~ 35022314 (+) False XLOC_037299
TCONS_00073409 other downstream 638315 35429202 ~ 35429316 (+) True XLOC_037302
TCONS_00073415 other downstream 1071197 35862084 ~ 35863842 (+) True XLOC_037304
TCONS_00073420 other downstream 2003497 36794384 ~ 36795322 (+) False XLOC_037311