RNA id: TCONS_00074482


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00074482
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_037946
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 32525255 ~ 32525371 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

agccacagccatatcaccctacagcccaagaccagttactcactgaagctaagcaggtttgagcctggtcagtacttggatgggagaccaaatgGGAACACTAAGTTGCTgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000174485

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00074480 lncRNA downstream 208420 32316139 ~ 32316835 (-) True XLOC_037944
TCONS_00075391 lncRNA downstream 246068 32271066 ~ 32279187 (-) False XLOC_037942
TCONS_00074998 lncRNA downstream 246203 32271066 ~ 32279052 (-) False XLOC_037942
TCONS_00074999 lncRNA downstream 248083 32271066 ~ 32277172 (-) False XLOC_037942
TCONS_00075390 lncRNA downstream 260597 32262205 ~ 32264658 (-) True XLOC_037940
TCONS_00075392 lncRNA upstream 235691 32761062 ~ 32781960 (-) False XLOC_037958
TCONS_00075000 lncRNA upstream 247104 32772475 ~ 32795884 (-) True XLOC_037958
TCONS_00074500 lncRNA upstream 276367 32801738 ~ 32804908 (-) True XLOC_037960
TCONS_00074504 lncRNA upstream 318642 32844013 ~ 32844887 (-) False XLOC_037963
TCONS_00074505 lncRNA upstream 320783 32846154 ~ 32847484 (-) True XLOC_037963
TCONS_00074479 mRNA downstream 181582 32312920 ~ 32343673 (-) False XLOC_037944
TCONS_00074477 mRNA downstream 224472 32286605 ~ 32300783 (-) False XLOC_037943
TCONS_00074478 mRNA downstream 224644 32287114 ~ 32300611 (-) True XLOC_037943
TCONS_00074470 mRNA downstream 333635 32190670 ~ 32191620 (-) True XLOC_037936
TCONS_00074468 mRNA downstream 348138 32161623 ~ 32177117 (-) False XLOC_037935
TCONS_00074484 mRNA upstream 35028 32560399 ~ 32604414 (-) False XLOC_037947
TCONS_00074483 mRNA upstream 35028 32560399 ~ 32604414 (-) True XLOC_037947
TCONS_00074485 mRNA upstream 115655 32641026 ~ 32648725 (-) True XLOC_037948
TCONS_00074486 mRNA upstream 129183 32654554 ~ 32656656 (-) True XLOC_037949
TCONS_00074487 mRNA upstream 132324 32657695 ~ 32659805 (-) False XLOC_037950
TCONS_00074481 other downstream 166590 32355235 ~ 32358665 (-) True XLOC_037945
TCONS_00074476 other downstream 246068 32274308 ~ 32279187 (-) True XLOC_037942
TCONS_00074475 other downstream 260597 32259814 ~ 32264658 (-) False XLOC_037940
TCONS_00074471 other downstream 319712 32200650 ~ 32205543 (-) False XLOC_037937
TCONS_00074461 other downstream 763726 31759506 ~ 31761529 (-) False XLOC_037929
TCONS_00074489 other upstream 136943 32662314 ~ 32665462 (-) True XLOC_037951
TCONS_00074494 other upstream 219717 32745088 ~ 32747794 (-) False XLOC_037956
TCONS_00074495 other upstream 219955 32745326 ~ 32747746 (-) False XLOC_037956
TCONS_00074496 other upstream 220573 32745944 ~ 32747765 (-) True XLOC_037956
TCONS_00074498 other upstream 260046 32785417 ~ 32785537 (-) True XLOC_037959