RNA id: TCONS_00074623


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00074623
length 121
RNA type rRNA
GC content 0.46
exon number 1
gene id XLOC_038043
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 38469446 ~ 38469566 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TCACACAGCCATgacaccctgcagcccaagaccggttactcactaaagctaagcaaggctgagcCTGGTAAGTAAGTacttggataggagaccacatagAAAAAGTAGGTTGCTGttaaaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120696

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075427 lncRNA downstream 116561 38351581 ~ 38352885 (-) True XLOC_038040
TCONS_00075008 lncRNA downstream 397530 38070084 ~ 38071916 (-) True XLOC_038037
TCONS_00074612 lncRNA downstream 649234 37817266 ~ 37820212 (-) True XLOC_038034
TCONS_00075426 lncRNA downstream 1332190 37118184 ~ 37137256 (-) True XLOC_038031
TCONS_00075007 lncRNA downstream 1448975 37015729 ~ 37020471 (-) True XLOC_038030
TCONS_00075428 lncRNA upstream 89073 38558639 ~ 38559750 (-) False XLOC_038044
TCONS_00075429 lncRNA upstream 89073 38558639 ~ 38560263 (-) True XLOC_038044
TCONS_00075430 lncRNA upstream 238897 38708463 ~ 38709221 (-) True XLOC_038046
TCONS_00075431 lncRNA upstream 760960 39230526 ~ 39282273 (-) True XLOC_038048
TCONS_00075432 lncRNA upstream 1441130 39910696 ~ 39915313 (-) False XLOC_038050
TCONS_00074622 mRNA downstream 70014 38389842 ~ 38399432 (-) True XLOC_038042
TCONS_00074621 mRNA downstream 70657 38385561 ~ 38398789 (-) False XLOC_038042
TCONS_00074620 mRNA downstream 101308 38353452 ~ 38368138 (-) True XLOC_038041
TCONS_00074618 mRNA downstream 312552 38140911 ~ 38156894 (-) True XLOC_038038
TCONS_00074615 mRNA downstream 426507 38029475 ~ 38042939 (-) False XLOC_038036
TCONS_00074624 mRNA upstream 95334 38564900 ~ 38587275 (-) False XLOC_038045
TCONS_00074625 mRNA upstream 95473 38565039 ~ 38579758 (-) True XLOC_038045
TCONS_00074626 mRNA upstream 524666 38994232 ~ 39005317 (-) True XLOC_038047
TCONS_00074628 mRNA upstream 844378 39313944 ~ 39624173 (-) False XLOC_038049
TCONS_00074629 mRNA upstream 853561 39323127 ~ 39624173 (-) False XLOC_038049
TCONS_00074619 other downstream 264918 38204407 ~ 38204528 (-) True XLOC_038039
TCONS_00074610 other downstream 719527 37636957 ~ 37749919 (-) False XLOC_038033
TCONS_00074611 other downstream 719527 37747587 ~ 37749919 (-) True XLOC_038033
TCONS_00074599 other downstream 1686781 36782547 ~ 36782665 (-) True XLOC_038026
TCONS_00074598 other downstream 1698783 36770357 ~ 36770663 (-) True XLOC_038025
TCONS_00074627 other upstream 760960 39230526 ~ 39255210 (-) False XLOC_038048
TCONS_00074636 other upstream 1611958 40081524 ~ 40350169 (-) True XLOC_038052
TCONS_00074637 other upstream 1915564 40385130 ~ 40385247 (-) True XLOC_038053
TCONS_00074639 other upstream 2039963 40509529 ~ 40509643 (-) True XLOC_038055
TCONS_00074649 other upstream 2473553 40943119 ~ 40953573 (-) False XLOC_038063