RNA id: TCONS_00075994



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00075994
length 5903
RNA type mRNA
GC content 0.37
exon number 4
gene id XLOC_038566
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NW_003334033.1
NCBI id KN150324.1
chromosome length 24032
location 8882 ~ 24012 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


tttaatttaatttaatttaataatttaattttgaatgatttaccggttagcttaaaatcagaaagtaatataaataacaaaaacaaaacagcagtgtttgcacaaaaaGTCTACTGTTAGTTGGTTGGATCATGTTGCCATTGGTTTTGCCTGCAGTAATTTcatgtaaataattttaatgtttttattatagttccattttgtcaatttttaagcctcctgtggacaggtgttatttataattatttaatatatatttaatatataattatttataattagcaagtttgctaaaacactttttaaaaaaagcatttggtTGTCAAGTGTAATTGTGATggccatgtcaaataaataaatgaataaataactattttaattagggtaaagttagggtgattaggcaagtcagtttaacagtggtttgttctggagacaatccaaaacatatagcttaaagggggcaataatattgaccttaaaatgagtttaaaactaGTATGAGTATTAAAACCTGCTTTTCTGctagccgaaaaaaaacaaataagactttctccagaagaaaaaatattatcagacatactgtgaaaaattcctgaatcagttcaacatcatttgggaaatatttgacaaagaaagGAACAGGAGGGCGAacaattctgtcttcaactgtatgaagGGAggagctgagagagagagagagagagagagagagagagagggcggtGCTATACTATAATCAGCAGCAGATAAAGCGGTGTGTAAAGCCGTGACCTCTCTGCACTGCTGAGCGCCAGCTAGAAACTTCTGCTGCACGTGTTGAAGAGCAGATCTACATGCTTACTTTCCATCACAAATAACCGTAGAGTAAATCTGTGTAAATAATAATCAGAAAACTCCATCATGCATCTCAAGACTACAAAGTGCAGTAATTCCTGTCTGGTGGCCACAGTGGTGGACTATGAGAtattcacgcgcacacacattcgGGAGCAGTTTGAGGCTTTGTTTCGTGCGTTTGATCCTGGCACATCATTCCAGTTCTTCAAAAGCTTCAGACGAGTTCGGATCAACTTCACGGATGCGCTGGCGGCGGCTGAGGCTCGAGTCAAGCTGCATAAAAGTGACTTCAATGGAAAGGAGATGCGCCTGTATTTCGCTCAGTCTGTACATATCGGCAGTCCTCGTCTTGAGCCTCCAAAACCAGAGAAGCAGTTCCTGATTTCTCCTCCAGCGTCGCCCCCTGTTGGCTGGGCGCAGTCGCAGGACGCAATGCCCGTCATCAACTATGACCTGTTGTGTGCCGTGTCCAAACTAGGACCAGgCGAGCAGTACGAGCTCCACTCCGGGACCACCAACACACCCAGTGTGATCGTGCACGTGTGTGAAGACGACAGTTCAGAAGGAGAAGATGAAAACGCCGAGGGTGGAAAACAAAACGTGCTCGGCCCAAAATCATCCAGACACGCCGCCCAGATTTCGTCCCGTCGGTGGACCAGTGAGCATTTCCTGACCCGTTCATCTCCGCGACCCAAACCGGGGAGCCACTAGGAAACATGCGGTCATGCAGTTTGTCATCCTCACCACTAGGGGACAACGGTGAGCATCAAAACCTCTTCCTAGTTTAGCGAGGGAGACGAGCGTCCTCATCATCTCGCGCTTCATTTCTGAACATCAGGGACTCGAGAGCTTCTCTCGTCTTACGAATGTCATTATTTGCTTGACGTCACTACTGTGTATTTTAATAACGCAAAGTGGAAACTGCGAGATGTGCGTCTGATTTGTGGAAGGcggttgtgtttttgtgtgtgtgtttagcacaAACATCGTGTCTAGGCATGGGCCGATATGATAACCTTAGGTATAAATATCACCGTTTCACAGTATTACTGCTcgaaatttttattaattttttttatttttaatgtattggtTGAAAAACGACTTTTATTCcaaattaaacacaatatattttattttaagaaacattttgaagcagtaaacacGTCGGGctacatcattaaaataaataatagacttctgctgtcttcatttgtttcaaaaacgcagatttctttacaatttgaaaaggatatctttattttctttggatataaagtaaacCACTGCACTGTTGAGAGCCGTAGCATGCACGGATGTTGGTTTATAAGCCATTTGTTTGCTGATTCATGGGCATGACCAGTAGCTTTCGATGTGGATGGTCATTTGCTGCTGGAGATACCCTAACAGCTGAATAAAAGTCATAATAAACACCTTAAAAAAACCATTGGTATAACGGAAAATGTTAACGTTTTTTaatccttgacttttccaaaccgcattatcgtcccatgcctaatcgtGTCTGAAGTGTGTATCGTTCGGGGGCCACTGTTGTGTACTCATGGTCTTTATTCTCACGTATCGTCTCTGCGTTTAGTCAGTTAAGCACTCGTACAGTCTTgaaatgtcattattattgtcGCTGAAGTTCTTGACGAGCTCTCCAAGTATTatgcactttaaaataatagaGCCTTATAATGTGGTACATGACAACAACATGAAGTACTTGTGTTTGTATTTCGAGCGCAACTGGGATTgactcctttttatttatttattaaatccccATCACTCCAAAACAGATCAGTGAAAATTGGAACcagaattattcaaataaaatattaaatctaaACCATCGGctgtataaaatgaaataaacaattggCTTTGTGTTTATATACAACATAAATATTGACTATAAATCACTGGCTctgttaaattaaatcaaaatattgagGATACCCTCGAATTGATTGGATCTAAACAATCTCACTGTAAATTTCtatagattattttaaaatcCACTTAATTCACAATGCATTTTTGTGAGATTAATAATTGGTGTACAATCATTACTGTAAGCTGTTGGCCATATTTAAAATGTGAAGCGTATATTTaacaacatatattaaataatttaaaaatcaaatttaaagacttaacattAAGGCTCCATTAGTTAGTAAACTTACAATGGACAATCTTTTTGCTCATTGTTAGTGAACAAAATGACATGAACAAATGATTAATCTTCGTTAGTAAGTTCGTTCGTTAATAATTTactgttaataatattattcCATATATGTGACCTATAGTTGCATATTTATTAACTGCATTTATTAACACAATTACACAAGTATTGTTCACCGTTATTTAATGCATTAGCTCATTAACTACTAGGaacttattgtaaaatattaccaAATCAATTTACATATATCTGACAGTTTTGACAGACAGGATGGCGGGtcacttttattatgttttgtttgcattttccATAATAAAAGCACTATTGGTGGGTTTCTGTATTAGTGCAGCAGAATTAAAGTGAACGATTTCAAactaagaaaattaataaatgaagtgTACGTTGTTGTCGAGCAGCGTTTATCGTGACTTAAGGACAAAATGAATGCGTTGGTCTGCAGTTGCGCTCTTGTGAACTGAACCGCTCTGTTGTGCTCTACTGTCTTTGGAGATGTTGTCCTATTTTCCATctaacatgaaaaaaatactacagtaatttactgcAAATACTTTAGCGTgtttgaaccatactataataGAGTACTGGAACTAATCTGTTGAAATGTTtttacagttgccatggtaacacaataactttagcaatgtatttgttgtggtgattctagagttgctatagtaacacaacaacgaTAGCAATTGATTTGTTGTACTGATactacggttgctatggtaacacaacaactatagtaataatcTGTAGTgctaattctacagttgctatggtaacacggcAACTAGAGTAATTCATTCGTTGcgctgattctacagttgctatggtaacacaacaactatagtaattaatctgttgtgctgaatctacagttgctatggtaacacaacaactacagtaattaatttgttgcgctgattctacggttgctatggtaacacaacaactatagtaattaatctgtagtactgattgtacagttgctatagtaacacgacaactatagtaattaatcagtTGTACTGATttttatggttgctatggtaacacagcaactagtaattaatttgttgtgctgattctacagttgctatggtaacacggcaactatagtaattaatttgtTGCGCTGATTTTacgttgctatggtaacacaactacagtaattattcTGTTGTactgattctactgttgctatggtaacacggcAACTATAGAAATTATTTTGTTGCACTGATTTTACAGTTGTTATTTTAACACAACAACTtgagtaattaatctgttgtattgattctacagttgctatggtaacacaacaactatagcaactaatctgttgtgatgattccaTTGTTGCTGTAGTAAcataactacagtaattaatctgtagTGGCGTTTCTGCAGTTGCTAAGGTAACAcatcaactacagtaattgatctgttgtggtgattctacagtcgctatggtaacacaacagctagagtaattgatctgttgtggtgattctacagtcgctatggtaacacaacagctagaGTGACATACCCAAAATggcccaatactgtagttttatgCAGCTATGGGATAGATGCTCCAGTATTTATCTGTTCACTGTAGTTAATACTACCGTTTGAGGAAGTGTTGTAAATGACATATACAGAAtaacacactttactatagtgtggtttactattgaccttattctaaaatgcagaagtgcgcctgttttcgcgattgttttagaacttctgattcagtcgcctatgggagataTGACTAGGAATAaaaaacggcagaaaacagtcaaactacttgctctacaaactaatgtttgcatgactatacagaccaagtagagtAATATAATCAGAAAATAtccgtttgcaacatcaagcagcgaaacgagcagtttttaatgtctaaaaatgaatgaaagtgaatgaaacCGCAAGATTCAagtggctgcgcccgctcgtcagccaagaataaggtgaatagtgtttactttaaatgACTGTAGTATTTGTTCATGTGGGATTGCTGTAGGAGGCGTTTAATGTCATCCTGTGGTTACTATTACATACTGTGTATATTTGATGTATCTGAATGTAGCCAATATCTTGAGGAAGCTTCTGGATTTCtatcaacaaaacaaacaaacaaacaaactaaaaacttcTTCTTTAGGTAGCAGGAATGTGGATGGAGGAGGAGCTGACCTACCTTTAATAAAACTATCTTGACCAAAGAAATGAATCTAGTGTATTTCTGACTTTGACACTTTTACAGAAGATAAAATCATCATCATATTTCAAGACTTTGAGTATTCAGAATATTTATCTGAACCACTGCTGACACTGAACGACTTTTCATTAGTCGAAAGTctcaaaacaaactcaaacaccAATCAAATGTTATTTTAGTATAAATTGTAGATAGTTTGTATTGTTAGTTTGAGCTGGGTaggtttgtattttaatttaatatgttttttaaacactattttgttttcacatttttattgttcaatacattttccttcggtttaatcTCTtgattcattaggggtcaccacagcggaatgaaccgccaactttttcagcatatgtttttcacagcagatggccttcaagctgcaacccagtactgggaaatacccatacatactcactcaaacacacacacactatcataacacaagaacacacacaaacactcaagaggatacaaaaatacagtgacacacacacacacacacacacacacacacacacatacacacacacacatacacacaagagGATACAAAAAtacactgtcacacacacacac

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000169018

JBrowse2


Expression Profile


//

Homologous


species RNA id representative length rna type GC content exon number chromosome id location
grasscarp (Ctenopharyngodon idella) CI01000299_04708767_04714088.mRNA True 846 mRNA 0.52 4 CI01000299 4708503 ~ 4714088 (-)