RNA id: AMCG00014533


Basic Information

Item Value
RNA id AMCG00014533
length 6483
RNA type mRNA
GC content 0.39
exon number 12
gene id AMCG00014533
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CM030128.1
NCBI id CM030128.1
chromosome length 42883965
location 16479887 ~ 16496581 (-)
genome version AmiCal1_2021_bowfin_Genome
species bowfin
(Amia calva)

Sequence

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Function

GO:

id name namespace
GO:0006629 lipid metabolic process biological_process
GO:0003824 catalytic activity molecular_function

KEGG:

id description
K13618 PLA1A; phosphatidylserine sn-1 acylhydrolase

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TU88386 lncRNA downstream 10659 16465779 ~ 16469228 (-) True G70731
TU88331 lncRNA downstream 110423 16366124 ~ 16369464 (-) True G70689
TU88319 lncRNA downstream 197988 16281685 ~ 16281899 (-) True G70679
TU88297 lncRNA downstream 265760 16212544 ~ 16214127 (-) True G70660
TU88073 lncRNA downstream 776573 15701495 ~ 15703314 (-) True G70491
TU88472 lncRNA upstream 225492 16722073 ~ 16723550 (-) False AMCG00014539
TU88566 lncRNA upstream 787738 17284319 ~ 17284576 (-) True G70876
TU88592 lncRNA upstream 852855 17349436 ~ 17350972 (-) True G70898
TU88625 lncRNA upstream 950287 17446868 ~ 17448717 (-) False AMCG00014555
TU88648 lncRNA upstream 1103880 17600461 ~ 17615905 (-) False AMCG00014559
AMCG00014529 mRNA downstream 22519 16451881 ~ 16457368 (-) True AMCG00014529
AMCG00014526 mRNA downstream 32919 16439295 ~ 16446968 (-) True AMCG00014526
AMCG00014530 mRNA downstream 48230 16425395 ~ 16431657 (-) True AMCG00014530
AMCG00014527 mRNA downstream 59396 16411736 ~ 16420491 (-) True AMCG00014527
AMCG00014528 mRNA downstream 70599 16380894 ~ 16409288 (-) True AMCG00014528
AMCG00014532 mRNA upstream 706 16497287 ~ 16504076 (-) True AMCG00014532
AMCG00014534 mRNA upstream 10806 16507387 ~ 16512051 (-) True AMCG00014534
AMCG00014539 mRNA upstream 225634 16722215 ~ 16737877 (-) True AMCG00014539
AMCG00014540 mRNA upstream 286496 16783077 ~ 16785522 (-) True AMCG00014540
AMCG00014541 mRNA upstream 303460 16800041 ~ 16814919 (-) True AMCG00014541
TU87063 other downstream 4817394 11660021 ~ 11662493 (-) False AMCG00014374
TU86854 other downstream 5681740 10796716 ~ 10798147 (-) True G69537
TU86630 other downstream 7162720 9310451 ~ 9317167 (-) True AMCG00014328
TU86412 other downstream 8095663 8383285 ~ 8384224 (-) True G69156
TU86302 other downstream 8321297 8156229 ~ 8158590 (-) True AMCG00014298
TU90285 other upstream 11833158 28329739 ~ 28332482 (-) True G72236
TU90581 other upstream 12892709 29389290 ~ 29398305 (-) True G72477
TU91283 other upstream 15766586 32263167 ~ 32263427 (-) True G73047
TU91373 other upstream 16100881 32597462 ~ 32614806 (-) True G73127
TU91374 other upstream 16100881 32597462 ~ 32619149 (-) False G73127

Expression Profile