RNA id: TCONS_00065656



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00065656
length 741
RNA type unprocessed_pseudogene
GC content 0.44
exon number 1
gene id XLOC_033546
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 17346399 ~ 17347139 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ATGAAGGCTACAATCGCTGTGCTCTTGCTTTTGGGGCTCTTTGGACTCAACACCAGTATCAGAAAACACTTTTTTGTGACTGAACAAATGACCTGGAAAGATGCACAGACGTACTGCAGAAAACACCACAGTGACCTTTCCACCGTGACCAAAGAAGCACAGCTGCTCTCCAGTAATACAGATGCTACATATTCATTTAGCTGGATTGGGCTTTATGAAAGTGCAATTGGATGGATATGGTCTGGAGGTCAGATGGAAGAAGTGGACAACTGGGATACAGACCAACCAGACGATATCGCTCAGCATTGTGTTTCGTTAAAGCAATCCACTTCTAAGCTACATGATACTCTTTGCTCTGATATGCTGTCTTTTTATTGTATGGATGTCGTAGAGACAATGTTGGTGAGTCAGAATAAGGCGTGGGATGAAGCCCTGGACTATTGCAGACAGAATTACTCTGACCTGGTGAGTCTAAGTTCAGAGATAATTGAGGCAGAGGTTATAAATGTCACAGGAAAATCCCAGACAGATTTTGTGTGGACTGGTCTGTGCTTCATGGCTGGTCATTGGTTTTGGGTCAGTGGTGAAGATCTTCAATATAAAGCCTGGTCTGTGGAGGGGGAACCCAAGTGTCCTGATGGAAATCTGCGCTGCGGAGCTCTGGATAGAAATAAGAAGGTTTGGAAAGCCATAGACTGTGAAAAGAGACTTAGTTTTGTCTGCATCAGGAAGGTTTAAAAG

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000163351

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00068800 lncRNA upstream 9657 17294868 ~ 17336742 (+) False XLOC_033545
TCONS_00065639 lncRNA upstream 243223 17096343 ~ 17103176 (+) False XLOC_033542
TCONS_00065636 lncRNA upstream 305077 17023289 ~ 17041322 (+) True XLOC_033541
TCONS_00068562 lncRNA upstream 1085692 16260278 ~ 16260707 (+) True XLOC_033536
TCONS_00068799 lncRNA upstream 1121315 16224312 ~ 16225084 (+) True XLOC_033535
TCONS_00068563 lncRNA downstream 210421 17557560 ~ 17557847 (+) True XLOC_033561
TCONS_00068801 lncRNA downstream 439951 17787090 ~ 17803644 (+) True XLOC_033564
TCONS_00065683 lncRNA downstream 469437 17816576 ~ 17905489 (+) False XLOC_033565
TCONS_00065689 lncRNA downstream 590783 17937922 ~ 17942385 (+) False XLOC_033566
TCONS_00065690 lncRNA downstream 590989 17938128 ~ 17942385 (+) True XLOC_033566
TCONS_00065648 mRNA upstream 37062 17255705 ~ 17309337 (+) False XLOC_033545
TCONS_00065655 mRNA upstream 37233 17303944 ~ 17309166 (+) False XLOC_033545
TCONS_00065654 mRNA upstream 37233 17303944 ~ 17309166 (+) False XLOC_033545
TCONS_00065653 mRNA upstream 37233 17303944 ~ 17309166 (+) True XLOC_033545
TCONS_00065647 mRNA upstream 94125 17229980 ~ 17252274 (+) True XLOC_033544
TCONS_00065657 mRNA downstream 5891 17353030 ~ 17353772 (+) True XLOC_033547
TCONS_00065658 mRNA downstream 9343 17356482 ~ 17357237 (+) True XLOC_033548
TCONS_00065659 mRNA downstream 27421 17374560 ~ 17376777 (+) False XLOC_033549
TCONS_00065660 mRNA downstream 27430 17374569 ~ 17376277 (+) True XLOC_033549
TCONS_00065661 mRNA downstream 46655 17393794 ~ 17397933 (+) True XLOC_033550
TCONS_00065650 other upstream 75392 17255728 ~ 17271007 (+) False XLOC_033545
TCONS_00065651 other upstream 85631 17255795 ~ 17260768 (+) False XLOC_033545
TCONS_00065626 other upstream 613609 16732674 ~ 16732790 (+) True XLOC_033539
TCONS_00065625 other upstream 797310 16539935 ~ 16549089 (+) True XLOC_033538
TCONS_00065621 other upstream 1142286 16203995 ~ 16204113 (+) True XLOC_033534
TCONS_00065709 other downstream 1660701 19007840 ~ 19008579 (+) True XLOC_033580
TCONS_00065710 other downstream 1667628 19014767 ~ 19015511 (+) True XLOC_033581
TCONS_00065712 other downstream 1679175 19026314 ~ 19027070 (+) True XLOC_033584
TCONS_00065774 other downstream 3120410 20467549 ~ 20471363 (+) False XLOC_033616
TCONS_00065791 other downstream 3298042 20645181 ~ 20651731 (+) False XLOC_033625

Expression Profile


//