XLOC_010086


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_010086
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 34913284 ~ 34916253 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00021979
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>TCONS_00021983
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TCONS_00021983 True 2835 lncRNA 0.38 2 34913335 34916253

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_010085 AL929184.1 coding upstream 188602 34724568 ~ 34724682 (+)
XLOC_010083 paqr7b coding upstream 380396 34522977 ~ 34532888 (+)
XLOC_010084 stmn1b coding upstream 386078 34523515 ~ 34527206 (+)
XLOC_010082 NA coding upstream 411081 34478997 ~ 34502203 (+)
XLOC_010081 NA coding upstream 590277 34319889 ~ 34323007 (+)
XLOC_010087 CR385021.1 coding downstream 290602 35206855 ~ 35280788 (+)
XLOC_010088 si:dkey-34d22.1 coding downstream 427240 35343493 ~ 35379565 (+)
XLOC_010089 si:dkey-34d22.2 coding downstream 463467 35379720 ~ 35383122 (+)
XLOC_010090 si:dkey-34d22.5 coding downstream 479344 35395597 ~ 35398512 (+)
XLOC_010091 rab42b coding downstream 485290 35401543 ~ 35405887 (+)
XLOC_010080 NA non-coding upstream 591905 34315762 ~ 34321379 (+)
XLOC_010070 BX530064.2 non-coding upstream 1156905 33752102 ~ 33756379 (+)
XLOC_010093 NA non-coding downstream 639513 35555766 ~ 35556976 (+)
XLOC_010096 AL773558.2 non-coding downstream 809765 35726018 ~ 35726132 (+)
XLOC_010097 NA non-coding downstream 861422 35777675 ~ 35780839 (+)
XLOC_010098 NA non-coding downstream 899136 35815389 ~ 35817061 (+)

Expression


Co-expression Network