G247947


Basic Information

Item Value
gene id G247947
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000058
NCBI id null
chromosome length 5213219
location 1714284 ~ 1733492 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU281430
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU281430 True 19031 lncRNA 0.38 2 1714284 1733492

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000058_01625351_01664692 PIK3C2B coding upstream 48490 1625351 ~ 1665794 (+)
CI01000058_01580247_01591754 NA coding upstream 122031 1579663 ~ 1592253 (+)
CI01000058_01496481_01498802 NA coding upstream 214474 1494870 ~ 1499810 (+)
CI01000058_01431719_01434294 CHIA.2 coding upstream 279771 1431559 ~ 1434513 (+)
CI01000058_01391493_01394283 NA coding upstream 319865 1391493 ~ 1394419 (+)
CI01000058_01740599_01784355 PLEKHA6 coding downstream 7107 1740599 ~ 1784676 (+)
CI01000058_01794468_01800421 KISS1 coding downstream 60976 1794468 ~ 1800421 (+)
CI01000058_01838039_01842964 NA coding downstream 104547 1838039 ~ 1843230 (+)
CI01000058_01957358_02009847 ATP2B4 coding downstream 223866 1957358 ~ 2009847 (+)
CI01000058_02028188_02037502 MDM4 coding downstream 294657 2028149 ~ 2037628 (+)
G247948 NA non-coding upstream 7901 1686779 ~ 1706383 (+)
G248112 NA non-coding upstream 37131 1676857 ~ 1677153 (+)
G248104 NA non-coding upstream 96364 1617351 ~ 1617920 (+)
G248103 NA non-coding upstream 97270 1616576 ~ 1617014 (+)
G247993 NA non-coding upstream 163434 1492179 ~ 1550850 (+)
G247975 NA non-coding downstream 14278 1747770 ~ 1752339 (+)
G248118 NA non-coding downstream 90297 1823789 ~ 1823990 (+)
G248122 NA non-coding downstream 98577 1832069 ~ 1832368 (+)
G248128 NA non-coding downstream 103816 1837308 ~ 1837522 (+)
G248135 NA non-coding downstream 118182 1851674 ~ 1851901 (+)
G247940 NA other upstream 257837 1452997 ~ 1456447 (+)
CI01000058_01280337_01289153 DNASE2B other upstream 426014 1278592 ~ 1289874 (+)
CI01000058_00592498_00596709 NA other upstream 1117113 592331 ~ 597171 (+)
CI01000058_00435196_00437830 AGTRAP other upstream 1258540 434913 ~ 455744 (+)
G250039 NA other downstream 2960916 4694408 ~ 4697161 (+)
CI01000058_04864571_04888198 NA other downstream 3092884 4864571 ~ 4888216 (+)

Expression


Co-expression Network