CI01000059_07650742_07651278


Basic Information

Item Value
gene id CI01000059_07650742_07651278
gene name NA
gene type coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000059
NCBI id null
chromosome length 10376574
location 7650601 ~ 7653815 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>CI01000059_07650742_07651278.mRNA
AGCAACCAAGTGTGTTTTTCATCATGGACTGATCTGAAAGCATCAACAAACCCTGTACAAGCCCTGCAGTTTATATACTCCTGAAATATGGGTGGAGAAAGACCATTGTTAAGATTTTTAAAAACCCAACAGTAGCCTATATCTGCAAATTTAATCAGATGCTATCAACTCAAAAAAGAATACTCAGCTAAAATATCACAATGATGGAATCAATCTGATCTTAAGAGCATAATTATCAACTAGGCCTATTGATGTTTTTAATGTTAAGGTATTTTGTTTGGTTTTCTTTCTGGTTACAAATTATTGCTAGTGTGTTCGAGCTCAATATAGACAGATAAATAGACTTTAAGACAGATAAATTTATTTTCTTCAGATAGGTTTTGTTTTGCAGTTGAGTCTCAAGGCACCGGTAGGTGGCGGTGTGCGCGTACACTGCCCGAGCCGCATTGAGTAGAAGAAGAAGAGTTCTTCAGCCGGCAGCAGCCGCGCGCAGGTGAGTGGTGGTAAAATAACTCATATTTTAGCATCCTTTTTGCAGATAGCCCACTTATAAGCGCGTTACAGACTATCAAAGAGAACTGTTTTATAATGCAGCCTAAACTATCGATAACTGCACTGACATGTCGCAGATTTTAGATGATTAAAAACTCCACATCAATGTATTGTGTATGAAAGCATTCGTAATATAAAAGCATATCAAAATTCCTCTGAGCGTGTTTGTCTGTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTGTCCATTTATTTATGTCTATCTATTTATGTATGTCTGTCTATCTGTATCTATATCTGTCTATTTATGTATGTCTGTCTATCTATCTATCTATATATTTATATGTCTGTCTGTCTGTCTATTTACTTATGTCTATCTATCTATCTATGTATGTCTGTCTGTCTATCTGGATCTATCTGTCTGTCTGTCTATTTATGTCTAGCTATCTATTTATTTATGTATGTCTCTGTCTATCTGTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTGTCTATCTATCTGTCTGTCTGTCTATTTATGTCTAGCTATTTATGTATGTCCGTCTGTCTGTCTATCTGTATCTATATCTGTCTGTCTATTTATGTCTGTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATTTATTTATTTATGTCTCTGTCTATCTGTATCTATCTGTCTATTTATGTCTATCTATCTATCTATCTATCTATATATTTATATGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTATTTACTTATGTCTATCTATCTATCTATGTCTGTCTGTCTGTCTATCTGGATCTATCTGTCTGTCTGTCTATTTATGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTATCTATATGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTATTTACTTATGTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATGTATGTCTGTCTATCTGGATCTATCTGTCTGTCTATTTATGTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCTATCTATCTATCTATATATTTATATGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTATTTACTTATGTCTATCTATCTATCTATGTCTGTCTGTCTGTCTATCTGGATCTATCTGTCTGTCTGTCTATTTATGTCTAGCTATCTATTTATGTATGTCTCTGTCTATCTGTATCTATCTGTCTGTCTATTTATGTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATATGTCTGTCTGTCTATTTACTTATGTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATTTATCTATCTATCTATCTATCTGTCTGTCTATTTATGTCTAGCTATTTATGTATGTCCGTCTGTCTGTCTATCTGTATCTATATCTGTCTGTCTATTTATGTCTGTCTATCTATCTATCTGTCTGTCTATTTATTTATTTATGTCTGTCTGTCTGTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATTTATTTATTTATGTCTCTGTCTATCTGTATCTATCTGTCTATTTATGTCTATCTATCTATCTATCTATCTATTTATCTATATGTCTGTCTGTCTGTCTATTTACTTATGTCTATCTGTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATGTATGTCTGTCTGTCTATCTGGATCTATCTGTCTGTCTATTTATGTCTAGCCATCTATTTATTTATGTACGTCTATCTATCTATCTATCTATGCTTTGTTAGTTGAGATGTTTGCACTATTAATACTTTTTATATTTTTTCCTAGTGTGTAGACCATGCCAGGAAGAGCAGGGGGACTCGGCGGGTTTGCTCAGATAACGGACCGTTTGTACATCGGCAACGGCAAAACAGCAAACGACTCTTCGGTCATAAGCTCTCTCAAAATCACATGTATTATTAATGCAACTCAGGACATAAACTCAAACATTCCCACTATTGATTATATGCACGTGTCTGTCTCTGATGATCCTGAATCCAGACTCACTGACCATTTTGACACTGTTGCTGATAAGATACATCAGGTTACTGAAGAACATGGACGCGTCCTGGTTCACTGTAACGCAGGCGTCAGTCGCTCCGCCACGCTGTGTCTGGCATACCTGATGAAACACCGCCATATGACGCTAGCGGAGGCGCACGCGTTGCTCAAAGCTCAGAGACCCATAGTCAGACCAAACAGCGGCTTCTGGAGTCAGCTGATAGAGTACGAGCGGAAATTACATGGGAAAAATACAGTCAGTATGATAAACTCTCCTGTTGGACACATTCCAGATTTATATGAGAGAGAAACAAGGGGCTTGATTCCACTTTAGGAAATGAAATATTTGTGGTTCTTGTTATTTCATTCATATTTGAATGATTTTGAACATTTTTGTAGAGCGCTTCAACATTATATTTGACTTTATAAGTTTTTTGTTCTTTATAATGTAGTGTTTGTGATGTAATGCAATAAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
CI01000059_07650742_07651278.mRNA True 3215 mRNA 0.32 1 7650601 7653815

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000059_07630261_07641794 NA coding downstream 8807 7629789 ~ 7641794 (-)
CI01000059_07614355_07620651 PSAT1 coding downstream 29790 7614039 ~ 7620811 (-)
CI01000059_07585791_07609336 NA coding downstream 41265 7585605 ~ 7609336 (-)
CI01000059_07578115_07581668 ISCA1 coding downstream 68933 7577342 ~ 7581668 (-)
CI01000059_07569069_07572960 NA coding downstream 76831 7568910 ~ 7573770 (-)
CI01000059_07656183_07663641 KISS1RB coding upstream 2231 7656046 ~ 7663647 (-)
CI01000059_07712901_07717294 NA coding upstream 57809 7711624 ~ 7717393 (-)
CI01000059_07735781_07738322 NA coding upstream 81549 7735364 ~ 7739192 (-)
CI01000059_07747741_07755772 PAX8 coding upstream 93654 7747469 ~ 7755772 (-)
CI01000059_07776352_07781815 ARL3.1.S, ARL3, ARL3.1 coding upstream 122160 7775975 ~ 7781815 (-)
G255697 NA non-coding downstream 323287 7274422 ~ 7327314 (-)
G255681 NA non-coding downstream 325033 7321519 ~ 7325568 (-)
G255742 NA non-coding downstream 416263 7234115 ~ 7234338 (-)
G255740 NA non-coding downstream 418602 7231788 ~ 7231999 (-)
G255735 NA non-coding downstream 481748 7167506 ~ 7168853 (-)
G255840 NA non-coding upstream 18233 7672048 ~ 7672829 (-)
G255845 NA non-coding upstream 30822 7684637 ~ 7684845 (-)
G255855 NA non-coding upstream 55778 7709593 ~ 7709962 (-)
G255866 NA non-coding upstream 108717 7762532 ~ 7762743 (-)
G255092 NA other downstream 1407809 6236106 ~ 6242792 (-)
G254203 NA other downstream 2412302 5237786 ~ 5238299 (-)
G253914 NA other downstream 2896519 4753538 ~ 4754082 (-)
G253013 NA other downstream 4178692 3471475 ~ 3471909 (-)
CI01000059_02096875_02098872 CDC26 other downstream 5550934 2094279 ~ 2098985 (-)
G256890 NA other upstream 1327881 8981696 ~ 8982117 (-)
G257014 NA other upstream 1800401 9454216 ~ 9599008 (-)

Expression


Co-expression Network