G251314


Basic Information

Item Value
gene id G251314
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000059
NCBI id null
chromosome length 10376574
location 95696 ~ 99149 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU285271
TTAAACTCAATAGATTCAATTATCCTCTACTTAAAATAATGAGTAGTACGAAATTTTTTTGAGTGGTCATGCGCAGTTCTACCTGTAGGTGGAGTCAATTTGCAACATATTCTGAGGGGAGAAGCACATGGAACGATTTCTTAAGATTAAAATGTTTGATGACTACACAATGGATCCGTTTTGTGGAATGAGATATGCATTGGAAATATCAATGCAGAGTTCAATCACATCACAATCAAGAAGCCTCAATCAAGAATTCTTCTCAGCACTTTATCAACTTGCAGCTTGATTTCTGGAAATTTGTGCAACAAAGAAAGTGGCAGTTGAAAAGAGAGTTTCTTGCGCAAATTAAATCTATGCACTGTCATCACTGCTAAGTGCACAGTTCTTCATGGCCTTCCTCTTATTCTTGGAGAAGAAACCGCTGATTTTTTTAAACAATGCTGACAGGACTGTGATTGTGACACACCCTTCTTGGGGATTCTGACTGTGATAACAGAAGACAGCCAGGATTCTTCCTCCACAAGAACTACATTTGGAGTCTTCATGCACAGCATTATTCTAGACTGAGCCATTGTCATGGATGAACTTGAAAACCTTCCAGGTGCCATGTGACTAATTTTTGGGTTGATATATGCCAAATTTGGAGTTTTTCTTTCCCTTGGACACAATTCTCTGAAACCAAAACTACATTCACTTTAAAACCCTTCTGTTGATGTAAGCAAAGGCTGTTTGAGATCGTTAAAGGCTTAGTTCACCCAAAAATGTAAATTCTGTCATCAGTTTTTCACTCTCATGTTGTTTGACTTTGGTTAGTCTTTCAAACACAAATTTAGATATTTTTAAAGAAAACAGGCTGGAAAACTTTTTGGATCTTTTAAGTTTTGGTTACCTGGACTTTCAGTTGGAGGGACAGAAACCTCTCAGATTTCATTAAAAATATCTTCATTTATGTTTCAAAGTCTAACCAAAGTCTTATGGGTTTGTGACATCATGAGGGTGAGTAAATGATCTGAGAATTTCATTTTTTTGTGAACTATCTCTTTAATCTTGTGGTTGCACTAAAGTCAACATTCTTTTTAATTAAAGTGTTAAATTGTCACCTGCCAAAGTTTAAACTGTCAAAATTAAGCTAACATTGATTTTTGTTTCATGGTCAGCTATTCAGTTTCTTGTCAAAAGACTGTTAGTATTATTGGTTTATTCATCAATCATGATTTGTAATCCATATTGTTACATTAATGAAAAATGTTTAGAATTTAGGGGTGCCAGAATGGCATTGTTTGGTACATTGTAGTGTCTGAAGAAAATTGATGAGCAATAA
>TU285272
TTAAACTCAATAGATTCAATTATCCTCTACTTAAAATAATGAGTAGTACGAAATTTTTTTGAGTGGTCATGCGCAGTTCTACCTGTAGGTGGAGTCAATTTGCAACATATTCTGAGGGGAGAAGCACATGGAACGGTGAGTTGGTGCTTGTTTGTCATATTTTAAAATTTCTGAATTGTTTAATATACATTAATCGATAGTGTAATATAATCAGATTAAACAATTTACACAGTGACACTGGGTGTGATGTTATATTATTGAAATTGTTGAGTGTGTTTGATTGTGCTAATCGAAATTAGCAGTTAGCATTTGCAAGTTACTGGTCTTTGGCTGCATGTTTTGAATAAAGGAACGTTTTTTATGTTTTAGATATTTTTATTATGTGTACAATGTAGACTGGGGAAAACTTTACTAATTACTGATTTATATTTGGATGCTAGTTTAGGTGTGTTGTACAGGGATGTTATAATTTGTTTTGTTTTTTTTGTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTATTTTAGATTTCTTAAGATTAAAATGTTTGATGACTACACAATGGTTCGTAATTAATATTTAAATCTATATAGTAAGAATTATTTTCTTAATTTTCAGAGCTTGTTTTATGGAACGAGACATGTAGATTAATACAAGGCTATTTTTCTTCATTTGCAGGATCCGTTTTGTGGAATGAGATATGCATTGGAAATATCAATGCAGAGTTCAATCACATCACAATCAAGAAGCCTCAATCAAGAATTCTTCTCAGCACTTTATCAACTTGCAGCTTGATTTCTGGAAATTTGTGCAACAAAGAAAGTGGCAGTTGAAAAGAGAGTTTCTTGCGCAAATTAAATCTATGCACTGTCATCACTGCTAAGTGCACAGTTCTTCATGGCCTTCCTCTTATTCTTGGAGAAGAAACCGCTGATTTTTTTAAACAATGCTGACAGGACTGTGATTGTGACACACCCTTCTTGGGGATTCTGACTGTGATAACAGAAGACAGCCAGGATTCTTCCTCCACAAGAACTACATTTGGAGTCTTCATGCACAGCATTATTCTAGACTGAGCCATTGTCATGGATGAACTTGAAAACCTTCCAGGTGCCATGTGACTAATTTTTGGGTTGATATATGCCAAATTTGGAGTTTTTCTTTCCCTTGGACACAATTCTCTGAAACCAAAACTACATTCACTTTAAAACCCTTCTGTTGATGTAAGCAAAGGCTGTTTGAGATCGTTAAAGGCTTAGTTCACCCAAAAATGTAAATTCTGTCATCAGTTTTTCACTCTCATGTTGTTTGACTTTGGTTAGTCTTTCAAACACAAATTTAGATATTTTTAAAGAAAACAGGCTGGAAAACTTTTTGGATCTTTTAAGTTTTGGTTACCTGGACTTTCAGTTGGAGGGACAGAAACCTCTCAGATTTCATTAAAAATATCTTCATTTATGTTTCAAAGTCTAACCAAAGTCTTATGGGTTTGTGACATCATGAGGGTGAGTAAATGATCTGAGAATTTCATTTTTTTGTGAACTATCTCTTTAATCTTGTGGTTGCACTAAAGTCAACATTCTTTTTAATTAAAGTGTTAAATTGTCACCTGCCAAAGTTTAAACTGTCAAAATTAAGCTAACATTGATTTTTGTTTCATGGTCAGCTATTCAGTTTCTTGTCAAAAGACTGTTAGTATTATTGGTTTATTCATCAATCATGATTTGTAATCCATATTGTTACATTAATGAAAAATGTTTAGAATTTAGGGGTGCCAGAATGGCATTGTTTGGTACATTGTAGTGTCTGAAGAAAATTGATGAGCAATAA
>TU285274
TTAAACTCAATAGATTCAATTATCCTCTACTTAAAATAATGAGTAGTACGAAATTTTTTTGAGTGGTCATGCGCAGTTCTACCTGTAGGTGGAGTCAATTTGCAACATATTCTGAGGGGAGAAGCACATGGAACGGATCCGTTTTGTGGAATGAGATATGCATTGGAAATATCAATGCAGAGTTCAATCACATCACAATCAAGAAGCCTCAATCAAGAATTCTTCTCAGCACTTTATCAACTTGCAGCTTGATTTCTGGAAATTTGTGCAACAAAGAAAGTGGCAGTTGAAAAGAGAGTTTCTTGCGCAAATTAAATCTATGCACTGTCATCACTGCTAAGTGCACAGTTCTTCATGGCCTTCCTCTTATTCTTGGAGAAGAAACCGCTGATTTTTTTAAACAATGCTGACAGGACTGTGATTGTGACACACCCTTCTTGGGGATTCTGACTGTGATAACAGAAGACAGCCAGGATTCTTCCTCCACAAGAACTACATTTGGAGTCTTCATGCACAGCATTATTCTAGACTGAGCCATTGTCATGGATGAACTTGAAAACCTTCCAGGTGCCATGTGACTAATTTTTGGGTTGATATATGCCAAATTTGGAGTTTTTCTTTCCCTTGGACACAATTCTCTGAAACCAAAACTACATTCACTTTAAAACCCTTCTGTTGATGTAAGCAAAGGCTGTTTGAGATCGTTAAAGGCTTAGTTCACCCAAAAATGTAAATTCTGTCATCAGTTTTTCACTCTCATGTTGTTTGACTTTGGTTAGTCTTTCAAACACAAATTTAGATATTTTTAAAGAAAACAGGCTGGAAAACTTTTTGGATCTTTTAAGTTTTGGTTACCTGGACTTTCAGTTGGAGGGACAGAAACCTCTCAGATTTCATTAAAAATATCTTCATTTATGTTTCAAAGTCTAACCAAAGTCTTATGGGTTTGTGACATCATGAGGGTGAGTAAATGATCTGAGAATTTCATTTTTTTGTGAACTATCTCTTTAATCTTGTGGTTGCACTAAAGTCAACATTCTTTTTAATTAAAGTGTTAAATTGTCACCTGCCAAAGTTTAAACTGTCAAAATTAAGCTAACATTGATTTTTGTTTCATGGTCAGCTATTCAGTTTCTTGTCAAAAGACTGTTAGTATTATTGGTTTATTCATCAATCATGATTTGTAATCCATATTGTTACATTAATGAAAAATGTTTAGAATTTAGGGGTGCCAGAATGGCATTGTTTGGTACATTGTAGTGTCTGAAGAAAATTGATGAGCAATAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU285271 False 1324 lncRNA 0.35 6 95696 99149
TU285272 False 1818 lncRNA 0.33 4 95696 99149
TU285274 True 1287 lncRNA 0.35 5 95696 99149

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000059_00075079_00094725 CLDN15B coding downstream 971 75079 ~ 94725 (-)
CI01000059_00056355_00058350 NA coding downstream 37009 55972 ~ 58687 (-)
CI01000059_00013963_00014292 NA coding downstream 81351 13775 ~ 14345 (-)
CI01000059_00001701_00003260 NA coding downstream 91385 1695 ~ 4311 (-)
CI01000059_00101987_00103012 NA coding upstream 1813 100962 ~ 103012 (-)
CI01000059_00130626_00143117 ARHGEF15 coding upstream 31057 130206 ~ 143117 (-)
CI01000059_00144949_00157845 GRK1B, GRK1 coding upstream 45184 144333 ~ 157885 (-)
CI01000059_00185897_00188899 SLC25A35 coding upstream 86688 185837 ~ 189044 (-)
CI01000059_00190249_00194415 NA coding upstream 90961 190110 ~ 194464 (-)
G251351 NA non-coding upstream 20575 119724 ~ 120008 (-)
G251335 NA non-coding upstream 50772 149921 ~ 150157 (-)
G251359 NA non-coding upstream 136238 235387 ~ 240320 (-)
G251360 NA non-coding upstream 144183 243332 ~ 243677 (-)
G251362 NA non-coding upstream 145293 244442 ~ 244659 (-)
CI01000059_00378673_00379901 NA other upstream 270782 378587 ~ 380137 (-)
CI01000059_01253451_01254823 NA other upstream 1152567 1251716 ~ 1254823 (-)
CI01000059_02096875_02098872 CDC26 other upstream 1997548 2094279 ~ 2098985 (-)
G253013 NA other upstream 3372326 3471475 ~ 3471909 (-)
G253914 NA other upstream 4654389 4753538 ~ 4754082 (-)

Expression


Co-expression Network