XLOC_010359


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_010359
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 227820 ~ 239273 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00021774
ATAGAAACGGCTGGAGGAGCACAGCTGATCAGCAGTTCAGCACCTCTGCATCTCAggatatcatcatcatcatcatcatcatctcccgGATCATCAGTGTTTGCGCGGTGTGTTTTCTCTGTCTGTCGGACTCTGAGGATGTGTTCTGCTCTGGGCATTCATCAGTAACTCCTCGGTTTAGCTGTTCTTCATCAGTGAGGATGAGTGCGGAGAAGCCCAACTTCCTGTCTCAGCCCGAGGTGAAGAGCATTTACTTCTTCCGCAACGGAGACCCGTTTTTCGAGCCCCGGCGGCTGGTGCTGAACGCGCGGCGGGTGTGCGGGTTCGAGGCGGTGCTGCGGGAGGTGACCGGCGGGGTGCGGGCGCCGTTCGGAGCCGTCAGGAGCATCTACACGCCCCGCGGCGGACACCCGGTGCTCTCGCTGGAGGAGCTGCGGAGCGGGGAGCAGTATGTGGCCGCCGGCAGAGAAAAGTTCAAGAAGATCGATTATTCGCAGATTGGAGCCAGGAAGAAGAGAACACTTCAGCTCAATGGAGTGTTGAAGCCTGTTCCTCAGAGTCGAGTGATGGTTTCTGCACGCTTCCTCAAGCCCATCAAAGAGCCCTGCACAATATTTATTGTGGCGAATGGAGATGTCCTGAATCCAGCTGTGAGGTGTCTGATTCCCAGCcgtgtgattggtcagtttgagcGAATTCTGGAGATGATTACAGAGAAGATGGGCCTGCGGATCGTGGGTGGAGtgcacagCCTGTACACTTTCGAGGGCACTCTGGTCATGGATGGGAGCGAGTTAGAGAGCGGGCAGTTTTACGTGGCCGTCGGCAGAGACAAGTTTAAGAAGCTTCAGTACAGCGACCTGCTGTTCAGCAAACACACGGCGGTGAAGAGAGTCAAcggGTCTAAAGCGGCGTCTCTTCCACCCATCTACAAATACAGACGGCAGAATGGAGACgtgttgAACCCTCAGagtaagtgtgtgagtgtgcaggATAAGAGCGCAGCAGCGGTGAGCAGCAGCTCAGAGGATCAGCTGATGTCCATGGTGAGGGAGATGTCTCAGGCCAGACTCAGAATCATCCGCAAGAAGAGGAGCATGACCACCTCACTGGAGACACAGGACAACGGttagacatgcacacacacacacacacatgcacactagaCGTTGATCTGGAGCTCCACAGGGTCCATATACATGACCCAAATCTCTGCTCACTCCTGCCCATGCCGAACACAGTGGAGCAGCAGTGGAGATCTGAAGCATGGGGGGTCATGGCATTTCCTAGACCCAATCCTGGTGCTAGATGGGCACTGGGTCACTGTCAAGGACTACTTAGCCATTCTGGAGGAGCATGTGACCCAATGGGTCAAATATTGTATCCTGAAGGTGGTGGTGTGTGTCAGGATGATGATGCAGCAATACACACAGCAGGACTGGAGACAGAGCGGTCTGATGAACATGACAGTAAAGCTGAatatctcccatggcctgcacagcaCCCAgattaaacattattgagcactttggggtgttttggaggagtgagTCAGGAAAGGTTTTCCTCCAGCAGCATCAGTAGTGACCTGAACACTGTTCTGATTCATGCTGTGCAGGACTCGAGTCTGTCCTATACACCTCACACTGATCAACTACTGTGCTCTAAAACCAGTTGACCCAACACGATGCAACAACACAGTTTGTTTTCATCAGTGTTAGATGTTTGTGCTCCCCAATGTTTGCCTTTAAAGTCTCTCAGGCTCACAATACTCTTGTATATGGTGCCATTTAAAAGCTTAGAATAACTTTTTTCTACAGATATGCGTCACGTGGAAATGTTTTATTGTAGTAAacttatttacacttaaatgtacatacatacattcatatttACATACAGTCTAGCCTGAAATAATTCCTCCCCCTGGCTTATTGTGCAGCTGGTAGACTGCAGTGctgtgagtgtgcatgtgaggGCGCCACTGCTCTGTGGATGAACTCAGTACAGCCTGACtgattcagttcagctcagtcCCATCACACTCACATCAGATCTaatccaattcattcattcattttccttcagcttagtccctttattaatcaggagtcgccactgtggaacgaaccaccaattggcccagcatatgttttacacagtggatgcccttccagttgcaacctggtacagggaaacactcattcacacacacacttatacactacggtcagtgtagttgatcagttcccctatagcgcatatgtttggactgaaactggagcccctggaggaaacccacaccaacacggggagaacatgcaaactccacacagaaacaccaactcaaccagccgggactcaaaccagagaccttcttgctgtgaggccagaTTGCTGACCCCTGCAGCACCGTGCCGCCCTAATAATGTCAGTGTGGGGAAATCAACAATACTCCAGCATAGCGGAGCTGGAATGGCAGTGAGCGGCCGGACTGAACAGCTTCATCTCAGTAAATTCAGCCGCTGATCTGAGGTGATCTGCGCGTGGGTCAGTCTGACCAGATCAGATCTAAATTAATGAACTCATTCAAGTTTCCAGCGTCCAGGGTTCATGTCTGCGTGTCCTTCATGAAGCGTGTGTTACTGACGCAGTGAGACCAGCaagcaaaacacacacatgttCAAATTAAAATGAGTGTATTTCACACCCCACACACtgcttattttcagaaataatgagtcaaatgaagtgagcttttccttaaaaaaaagccAAATATTCTTATATCACAAGGAAAAAGAAGATTATTCactccattgtcagattattctgcttgttttaggGAGAAACTCTCCTCATTTCACTCATTATTGCTGGACACAACACTATATTTAGTGCTTGTCTATAaaaggcttcttgatttaagagtttgtatATATTTAGACCAGAAGCGAGACAGAAAGTCGTATTTGTGCAGCATATGCAGTGTTTCTGTGTAAAAGTTTGACCTCCTCTGTAAACTGCACATCATCATAATTGGAGAAGGTCTAATATTTGCATCAATAGTGCTCATAGTGAGATAACCACATCACCCTCTGCGATTAAACCGCTTCTGTCAGACATATTTCACAGCGCTGATAATGACAAGGTCATGAATATGATGATTCCCCCTCATTTGCATAAACGCATCATCATTAAGGGTTGTGACGCGGCTGCAATCACATCTGCAggttttatgagtgtgtgttgatcTCCATCTCTGTGCTGCGGCTCATTTGCATCTGATTGATTATGCGTCATGTGACCTGACGGAGGTACATCTGATGATGGCTGATATCTGTGTAGATTTGCATGCTGATATTACTGTATGCAGATGAGCGGACACTATGGCCAGCACTGGCGTTTACTGGAGGAATCCAGGAGCTCCTCATCAGTAGATTACAGACAGCAGGAGGAGTTGAGGAGATCAGCTGGAGACTCGCTGAAGATCTTCAGACTGAAGCTGCCgttacactagagtttgagcatgtgaaattctgtaaaaaaaaacgcGATgtatgtgtctgtggtccttcacggACTCTAAAGGTGAAGCTTCATAGTGTTGGGTCAACCAGCCATTGTGTATTGAGtctcctgtcacaaaatgcagcaacaagtcctacatgacagtaatagtttgattaggaTGTTTCCATGTCTacgctgcacttcaataatgccattaaaatcagcatactccacgtgCATTAATAcacttttagtttagtttgataATGAActtaaatctgattaaattaataaaaactaaaaatgtatatattaaaataaaaaattaacaaaataaaaaaagataattataaattaataaaataaaaaaattaaaattaaaaataaataaatttaaatgaaaaattataaaatttaataaataaataaataaataaatttaaataaaaaatatataaataaaaaaataaatagttaattaattaaaataaaaacattataaaatgtaaaaaaaataaatacattaaaattaattttaatacaataaaaaaataaaatcaaaatgaaaaaattataatatttaaaaaataaattaattattaaattaaaatataaaataacaaaataaaaaataattatttattaattaaaaaaaataaaaaataaataaattcaaatgaaaaattataaaatggaaaaaataaaataatattaaaaatatattaaataaaaaattaaataaaaaattatatttttttaaataaataaataaattttatatatatatatatttaatatataattatttaaaaataaaataaaataaataataaataattatttagaataaaaacattataaaattaaaaaaatagggaaattaaaatattttttataaaattaaaaaaataaataactcaaaataaaaaaatgtaaaattaaaaaaataaataaattagttattaaaaaatatataaaattttaaaaataaataaaataattaattaaaataaaaaataataaatacaaatacatcaatcaattaaaattaaaatatataaaattttaaaaataaatacaattatttattaaaattaaaaaattacaaaaattttaaaaataaataaatttaaataaatttttttttttaaaataattaatgaattaaaataaagaatatatataaaattaaaaaataaataaataaagtatagctttaattgtattaaaatcaaatgattggtgtccatgtaaacatactcagggAACTTTCCTCAACACCAGCGTACGTGTTGAAGACACTGTGATGAAGGACTCTTACATGGTGTAGGGTTCATATGAGTGGAGCTCGTCTCTCCATCACTGCGCTGTTTACTGCAGCGTTAGCGCTCCTGCTTGCAGACTGAGCTTAATAAATGTGAGCGATCTCCATCAGATATTCACACAAGCCCATTACTGCTGCAGCGGCTCGTCTCAATATTATTCCAGTCTGAGCTGATATGAGCGGCATTAATTCTGCTCTTTAATAATTCAGACTGTACTGATTTCACACACAATCGCTGGATTTAGTACTCATTAACTCTTTAAAGACTGCTGTAATGCTCCTGTTTACCAGCGAGTACCATGCTGTAAATCTGGCTCGGGAAATAATGACAGAAGCTCGGGAAGCTCATGGTCATCTGAACAGCCGCGCTGTAGTCAATTAATGAGGCGTTTTATATGCGGACACGCTTGAGACTGAATCAAACACGTCTGCAGTACGCTGATGTCGAAACACTGGAGTTTTTTAAAGTCATGTCAGTCAGCTGGTCTGTCATACGAGCAATCCGCTGATGAACCGCAGCTCTGAaccactccagtgtccctgtatctgtgttacacccagtaaacagcggtgagctCGGTGAACtccacagccaatcacagtcatttctgttgagcacgtgaacacaatgaccaatcagcgctgtttaagagcGCGCTCAACAGCGCTGTTAGAGGGAAACGCACGGTTTTAAAGTGCAGTATCGATTCGTACCGTATTCCAGTATCAGGACGACTCTGATCCTGACTGATGACCTCACAATCTACAACAGTACTGGTTTTCTCTAACAAAtaagtttgatttatttatctgtttgtttatttgagtCTTGGTATGtgaagccgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgaaatcCAGCAGCTCCTCAACTCCTAAGCCTGCAGTGCTGGCTGATGGTGGTGCTGATGCTTCATctgttcatctctctctctctctctttctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgagtatatgtgtgtgtgtgtgtgtgagtgtgtgtgtgNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGAAggagaaaaagaggaggagaaaatAGAGGAGGAGGAACACATACATGACAGTGGAGAAGAGAAGAATGAAGAAGCTGAAGGAgagaaagaagaggaggaggagga

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00021774 True 6142 lncRNA 0.40 7 227820 239273

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_010358 NA coding downstream 21561 204125 ~ 206259 (-)
XLOC_010357 NA coding downstream 49957 173564 ~ 177863 (-)
XLOC_010356 NA coding downstream 160113 66537 ~ 67707 (-)
XLOC_010360 slc6a3 coding upstream 8966 248239 ~ 263658 (-)
XLOC_010361 LO017917.1 coding upstream 38516 277789 ~ 280835 (-)
XLOC_010362 NA coding upstream 63482 302755 ~ 313553 (-)
XLOC_010363 NA coding upstream 106990 346263 ~ 353780 (-)
XLOC_010364 NA coding upstream 115573 354846 ~ 367144 (-)
XLOC_010626 CR392024.2 misc upstream 20655839 20895112 ~ 20895175 (-)
XLOC_010366 NA non-coding upstream 312409 551682 ~ 552627 (-)
XLOC_010368 NA non-coding upstream 964869 1204142 ~ 1218570 (-)

Expression


Co-expression Network