XLOC_010364


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_010364
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 354846 ~ 367144 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00022070
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>TCONS_00022072
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Function

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RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00022070 False 5945 lncRNA 0.43 3 354846 365399
TCONS_00022071 False 4495 lncRNA 0.45 2 354846 366915
TCONS_00022072 False 7355 lncRNA 0.42 3 354846 367144
TCONS_00022073 True 941 lncRNA 0.47 2 363724 366915

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_010363 NA coding downstream 1066 346263 ~ 353780 (-)
XLOC_010362 NA coding downstream 41293 302755 ~ 313553 (-)
XLOC_010361 LO017917.1 coding downstream 74011 277789 ~ 280835 (-)
XLOC_010360 slc6a3 coding downstream 91188 248239 ~ 263658 (-)
XLOC_010359 NA coding downstream 115573 227820 ~ 239273 (-)
XLOC_010365 irx4a coding upstream 11622 378766 ~ 383664 (-)
XLOC_010366 NA coding upstream 184538 551682 ~ 552627 (-)
XLOC_010367 irx2a coding upstream 188602 555746 ~ 563732 (-)
XLOC_010368 NA coding upstream 836998 1204142 ~ 1218570 (-)
XLOC_010369 NA coding upstream 983827 1350971 ~ 1353006 (-)
XLOC_010626 CR392024.2 misc upstream 20527968 20895112 ~ 20895175 (-)
XLOC_010358 NA non-coding downstream 148587 204125 ~ 206259 (-)
XLOC_010357 NA non-coding downstream 176983 173564 ~ 177863 (-)
XLOC_010372 NA non-coding upstream 1580881 1948025 ~ 1949069 (-)
XLOC_010378 CU929110.1 non-coding upstream 2368532 2735676 ~ 2735799 (-)

Expression


Co-expression Network