Fish Transcriptome and Expression Database

G265149

Basic Information

Item	Value
gene id	G265149
gene name	NA
gene type	non-coding
species	grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species	economic fish

Chromosome Information

Item	Value
chromosome id	CI01000063
NCBI id	null
chromosome length	7808773
location	5608129 ~ 5609834 (+)
genome version	v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU300917
AGATGTTTAGCAGAATGTTCACGCTGCTCTTTTTCATACAGTGAAAGCTTATTGTGACCAGGAACAGTCAAGTTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTGACCTCACCTTAAATGTTTTTTACTTATGATTTGAGAAGCCTTTCAATATTGTGCATAAGTTACATGGACTACTTTTGTTATTTTTGGAACATGACTGCCACTGGTCAAAATATGTTTTCATTTTTTGGGAAAAGCATTGTTAACATTATACAAACCTTCTACTTTTGTGTTGCACGTAAGAAGGTTATACCAGTTTTGGAACGATATGAGGGTGAGTAAATGATTACATAATTTTCATTTTGGGCTGAAATAACCCAGTGACAGAATATTATGCTGACTAAAAATATAATAAGTTTTGCTGACACAAAAAGGGAAGAGTTAATTATATGTCAGCATGTAGTACGTCTCAGTTCCTTTGAATCATGTGCCGTAAGAATCCCACTGCAGATACCACAAATAATTGCTCTCCATTACAGCTGTGAAATCTGTCGACTTTACTATGAACCTGTACTTTTATTCTCTAGGATTAAGATTTAGAGTCTTACAAATAAAGCTGAGAGTGGTTTTGTCGCAGTTTTTGGGTTCTGATGAATTTCAGTCTTAACCACAATGTGGTCGAGACTCCTAAAATCAATCAGTGCAGCCCAGACTCCGGGGGGAGGGGATTCTCATCAGCTGTTGCTTTGGGATTACTGTCTCACAAAATTACAGTGTTCTTTTTAAAGATTTACTGGCATGTGTAGAGAAAAGACGAGAGAAGATGCTGTCACGTGTTATGGATTTAGAGCAGTGCAGAGAAGAGATAGCCTAGTCATTACTATGAAACAAAGCCCCAGGAGAGGAATTGATTACATAATTCTGTTGCACTGAGTTGATATGACTGCTTCCCATTTGTCCTTTTGTAGTGTGAGCAGCCATATGCATTTCCCCTTTCGACATGCACATGGCAACTTGCCAGTAATACCCTTTGATGTGGTGAAAATCTTGCAAAGATAAAAATTTAGAGCAGTGGTTCTCCAAACTTTTTGACTGTTGTCCAGCAAAATATTCAAAGGCTGTCAGATATTCAAGTACTTTTACTGTAATTATGACAAAGCTGTGTGTTTTCAAACTTTTTGTATAAACTGAAACTAGGAGTATTGATATTAATTATTAAATAATTAATTTTGTGACCTCAGAAGTTTCAAGAACTGTATACTCTTCAATTAAAAACAAGTTATTGAGTGGGAAAAATAAATATATTTTTTTATTTTACTATTTTTATTTCAGAATTTGTTTATTTTTACTATAATATTATATAAAATATTTTTTTTAGTTTACATCTTGGTTTTACATGTTTTTTAGCATCAGTGGTAAACTTGATGGTAACTAGGTTTTGCTCTACAACTTAAATTACACTAATATTGAAATTGCGAATTTTTAAGCTGTTATGTTTATTTAACAAGATAAGACAGCTTGTGGTGCGAGTGTGTGCAGTTTACATTGTAGAACAAAATGTTAAAGTATAGTCAACTTAGGTTTACCGAAGACCTTATTTTACTCATAAATTGAAAAACCCCATATGAAAAGTTTGAGGGAACCAGTGTTGAATTAGTCTTCCGGGTTTTGACGTCATCCCTGCCCCACTCTATTTAGAGCCAATGCTAGAGCTGGTCTATGCAAACCANNNNNNNNNNNNNNNTGCTACAGTAATGAAGAGCGTTAAAGATGCCTTACACCTGTGAGCAGGAGTTTTATACTCAGAGAAATTATTTTCTTTGTCACTATAATTCATGTAGTGCATCACACAAAAGGAAACCCAGACATGTTTTGCCTCATCTCAATGTTTTGACCTAGAGATGTAATGAAGTTCTAGCTAACAATGTGCAGTACATTTAGGTACAGACTTTTTTTGTATCCGAGGCAGTTCATACCCCATAACTTTTAGAGATCTGCTAGATGTTAGCATGCGGCTAATGTTAAACCTAGATGGCCCGGGGCACTTGTGCTTAAATGAGAGCTGGAAGTTGCTCACCAAGCTTATCTGCACCCATATCTGGAACTATGTTTTGGAAATGTATATTGCCTTTTTTGTTGAGAATAAAACA
>TU300918
AGATGTTTAGCAGAATGTTCACGCTGCTCTTTTTCATACAGTGAAAGCTTATTGTGACCAGGAACAGTCAAGTTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGTTGACCTCACCTTAAATGTTTTTTACTTATGATTTGAGAAGCCTTTCAATATTGTGCATAAGTTACATGGACTACTTTTGTTATTTTTGGAACATGACTGCCACTGGTCAAAATATGTTTTCATTTTTTGGGAAAAGCATTGTTAACATTATACAAACCTTCTACTTTTGTGTTGCACGTAAGAAGGTTATACCAGTTTTGGAACGATATGAGGGTGAGTAAATGATTACATAATTTTCATTTTGGGCTGAAATAACCCAGTGACAGAATATTATGCTGACTAAAAATATAATAAGTTTTGCTGACACAAAAAGGGAAGAGTTAATTATATGTCAGCATGTAGTACGTCTCAGTTCCTTTGAATCATGTGCCGTAAGAATCCCACTGCAGATACCACAAATAATTGCTCTCCATTACAGCTGTGAAATCTGTCGACTTTACTATGAACCTGTACTTTTATTCTCTAGGATTAAGATTTAGAGTCTTACAAATAAAGCTGAGAGTGGTTTTGTCGCAGTTTTTGGGTTCTGATGAATTTCAGTCTTAACCACAATGTGGTCGAGACTCCTAAAATCAATCAGTGCAGCCCAGACTCCGGGGGGAGGGGATTCTCATCAGCTGTTGCTTTGGGATTACTGTCTCACAAAATTACAGTGTTCTTTTTAAAGATTTACTGGCATGTGTAGAGAAAAGACGAGAGAAGATGCTGTCACGTGTTATGGATTTAGAGCAGTGCAGAGAAGAGATAGCCTAGTCATTACTATGAAACAAAGCCCCAGGAGAGGAATTGATTACATAATTCTGTTGCACTGAGTTGATATGACTGCTTCCCATTTGTCCTTTTGTAGTGTGAGCAGCCATATGCATTTCCCCTTTCGACATGCACATGGCAACTTGCCAGTAATACCCTTTGATGTGGTGAAAATCTTGCAAAGATAAAAATTTAGAGCAGTGGTTCTCCAAACTTTTTGACTGTTGTCCAGCAAAATATTCAAAGGCTGTCAGATATTCAAGTACTTTTACTGTAATTATGACAAAGCTGTGTGTTTTCAAACTTTTTGTATAAACTGAAACTAGGAGTATTGATATTAATTATTAAATAATTAATTTTGTGACCTCAGAAGTTTCAAGAACTGTATACTCTTCAATTAAAAACAAGTTATTGAGTGGGAAAAATAAATATATTTTTTTATTTTACTATTTTTATTTCAGAATTTGTTTATTTTTACTATAATATTATATAAAATATTTTTTTTAGTTTACATCTTGGTTTTACATGTTTTTTAGCATCAGTGGTAAACTTGATGGTAACTAGGTTTTGCTCTACAACTTAAATTACACTAATATTGAAATTGCGAATTTTTAAGCTGTTATGTTTATTTAACAAGATAAGACAGCTTGTGGTGCGAGTGTGTGCAGTTTACATTGTAGAACAAAATGTTAAAGTATAGTCAACTTAGGTTTACCGAAGACCTTATTTTACTCATAAATTGAAAAACCCCATATGAAAAGTTTGAGGGAACCAGTGTTGAATTAGTCTTCCGGGTTTTGACGTCATCCCTGCCCCACTCTATTTAGAGCCAATGCTAGAGCTGGTCTATGCAAACCACNNNNNNNNNNNNNNTGCTACAGTAATGAAGAGCGTTAAAGATGCCTTACACCTGTGAGCAGGAGTTTTATACTCAGAGAAATTATTTTCTTTGTCACTATAATTCATGTAGTGCATCACACAAAAGGAAACCCAGACATGTTTTGCCTCATCTCAATGTTTTGACCTAGAGATGTAATGAAGTTCTAGCTAACAATGTGCAGTACATTTAGGTACAGACTTTTTTTGTATCCGAGGCAGTTCATACCCCATAACTTTTAGAGATCTGCTAGATGTTAGCATGCGGCTAATGTTAAACCTAGATGGCCCGGGGCACTTGTGCTTAAATGAGAGCTGGAAGTTGCTCACCAAGCTTATCTGCACCCATATCTGGAACTATGTTTTGGAAATGTATATTGCCTTTTTTGTTGAGAATAAAACA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id	representative	length	rna type	GC content	exon number	start site	end site
TU300917	False	1705	lncRNA	0.35	1	5608129	5609833
TU300918	True	1706	lncRNA	0.35	1	5608129	5609834

Notice the +/- strand.
Display format: symbol/gene id: RNA id. (Except when gene id is similar to RNA id.)
You can browse transcripts by dragging.
A more detailed transcript can be viewed by the zoom button in the upper right corner.

gene	XLOC_000007 f7
RNA	TCONS_00000019
bioproject	PRJEB12982

economic fish

Basic

Function

RNA

Expression

WGCNA

G265149

Basic Information

Chromosome Information

Sequence

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

Expression

Co-expression Network

copyright 2021-present@Lab of Aquatic Bioinfomatics, Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences