XLOC_010387 (si:ch211-175f12.2)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_010387
gene name si:ch211-175f12.2
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 4010967 ~ 4031386 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00020430
tcccaaagatgggttgcggctggaagggcatccgctgcgtaaaaactttctggataagttggcggttcattccactgtggcgaccccggattaataaagggactaagccgacaagaaaatgaataactatatatattactaatgctttccttcttagactttacacacctgaaacttgccttcagcacttattcattgttgctcttataatgTGTAAACTGCttacttgtcctcatttgtaagtcgctttggataaaagtgtctgctaaatgactaaatgtaaatgtaaatgtaaaatgactAAGCTGATTATAAAACTTGCCCATATTAAGGTAAATTTATAGTTAGAGCGAGTAAATTATTGTAATGGAAAAGTTCATGTCTACACCTCAGACATGCTTTATGTTGTTTTATGGCTTGCTTTACTGTTTTTTGATTACATTATGTCCCAAGATACTGTAACACAAAGATATTTGGACTTGGGGAAAAAGTGGATCAGGAACCTAAATTAGTATGTGATGGGACGCAAGAGGAACACACAACCCTGTCAGTAATCAGATTAGACAGGATTATGTCTGTAGGCTTGAAGACATCAGACGAGCAACTGAAGAGATACACAGCAACCGGTATATTATCATCCACTGAAGAAGATCAACACGAGGCTTTGTTCAGCTGCTGAACATTTCAACCAGATATTTTATCAAGACTGCTGAGCACCATGTGAAACCCCTGTAAAATGGCGACTTATGTCCTGTGGTCAGCAGTAGTCTGGACTTTCAAGAGCCTGTTGTTCACATGGAGGTTTTTCTGGGTCAGCCCATATTGTGCTTTAAAGTCTGCACCGCAGCAAAGACTTGACACTGACCATAAACCCCAGCCAAAACTGACCACAGAGGTCAAGCGTCCCGCAGAGACAGATGTGATGAAGGACAAACCTGAAAACTGTGCTCAGCGCGATCGCAAAAGCGGCCTGTTCAAGAGACTGCTGTCGGCTGAAGGAGAGATCCGGGAACTGAAGATAGAGATTGCAAATCAGAGAGCATCGTGGGATATGCGGTTTGTGGAACTGCAAAGGAGACAACATGATCTGAGAGACCAGCTGACCTCAGAGATTCTGGTTCGGACGGGAATGCTGTACAGAGATAATGATTCAGAAGAAACAAATGAGGTCTTTACAGAGTCTGGCCTGGAAAACGGAGTTTATACAGATGAGTGTATAAGTGGTCTCAGACAGACCCACCAGCAAAAGAGGCTTGATATGGATCTGCTTGGAGACGGTGTTGAGCAAAAGAGTTTGTACGGAAGTCAAACCTCCTGCCAATCCAGAGCCACTTCTGCCATGTCTAACATCAGTGTAAGGTCTTGGAGGAGTGGAGGTGGACCTCATCGAGTGTTTGTGCCCCATTCCCCCATGGACCTGAAAACTGGACACAGAGTTCGGATTATGTTACCGTCTGGACGGATCTGCACCGGGACCTTACGTTACCTTGGCAACATGCACAACTCCCCTGACCACTATCTCGGTGTAGAACTGGAGATGGCTGATAATGGACAGCACGACGGCACTTATGAAGGGCAGCGCTACTTTGACTGTGACCCGGGATATGGTGCGTTTGTACCCTTCAGTAAATTGTTAATGGCTTGGGAGTAAACACTAAGTGAAGACTCAACACACGTCACGGCGAAGTACAATGCGATCTTGGATTAACATCAtcttgatcctggaacatcatatTTGTTGAAAAACGTAATCCATTCCTTTTTCCTACCCATTCCACAATCATAACTGTGAGTTATTCCCAAATTCAGAagagaataatagttggataacaatcatgtagaaccGTAAGCCTAAAtttaacataaacagtaaacaaatcccttaattctgattggttgattggaatcttgttccaggatcaacgtaaatgttaatccaggaacatgtccagCGTGGTGAAATCAGGTTAGGAAAGATGAAGACTCAACAGCACTTTCACAACAGCTGTAAGAATCACAACAACTGCTTCAATTCTCACAGAACTGTACGACTGCAGTGGTGACGTATTTTTGTGGGTCAATCTACACTTTGGCTCCCTCAACGaaacacaaatataattttttctcAGGTGGGTTTAGGTTAATTGAAGAAAATAAATTTGAAGGTTATGTTTCTTACAACTTTTAAGCATcatgataatctttaaaaatgaacTTTGACTAATACTGACGCATAATTACAGTATAGTTGGCAGAGGGAAACAATGCAATGTCAACTCTGCTAGTCGAATGATAGCTTACAGAAACAAATAGCAACATAATCAAACGTTCCCTATGTcacattttgacattattttactTTACAATAATGGATTGTTTACACTCAAAAATAAAGGCACGActgctgtcactggggtggaacAATTTTAAAAGGTACACGCTTGTAACTAAAAGTCCTTATTAATACCGTAAGGGTACGTACTAGTACCTTAAAAGTTTAAATGTGTACCTCTGGAAaattgtaggtactaatatacgcCTTGATAGCATGGCAGCTCAGGGATTAGCACTGTcatgtcacagcaagaaggtcactggtctgagtcctggctgggtcagttggcatttctgtgtggagtttgcatgttctccccatgttggcgtgggtttccttccagtgctccagtttcccccacagtccaaatattgaataagctaaattagccatagtgtatgggtgtttactaGTACTGGATTGGACAGacatgtataaaacatatgctagaacagttggtggttcattccgctgtggcgacccctgataaataagtgactaagccgaaggaaaatgaatgaatatacaccTTTAAGGTagtaatatggaccctttaagtacaaatgtataccttttaaaaaggtaccaccctagtaacagctctcgtacctttatttcttttCGTATACTATTTCAGTTTATAATCGGAAAATGCTTGCAATGTATGTGCTGTTCTAAAACAAGTCACCTGTTTGTACATGTATTACAGTGTGATTTGTATGAAAATGTTCAATGTTTTGAAGACAATTAAGTATCtttaaccccgccggtcctacaccccCCAACCCATTCTGACAACCTTCAGCATGGCAGTCGGTTGCTTTACAGAGGAGGCTAAAGACTGTGACCTCTagagtctgtcgctagagcaccttttagaggtcagaggagtgaggtttacctgcacttCACTTGCTGGCCTCCATTACAATCACGCCTCTAAGCCTCACtcctatccgggtcacggcaccaatgcaaCCCCGCTGGTGTTCCACCCCCCTAACCCGCTACGAGCTGTGATcaaaccggccactttctgcatcggttgctctaccaaggaagctaaagaccatggcctctttcgtctgttgctagagcaccttttacgaaacattcacacagagcaacagTGTCAACGCTtcacattcactttgaatgggtgacgtcaggcgttgcgaaactgcattgtggatccctcgtcgccgcttcagaggcgttgctcattGCAGAatttgggactttctcaacttttcaagcgccaacggaagcatcagccaatcagatcgctgcgtgcaaatacaccagctcagacaaatgccgattgctgactaattccATTGGCTggcgctgctatgacgatcgcgtcagccccaacttcagacatgccctctgtcaagcgttgacgctgaagctccGTGTGAATGCActgtagaggtcagaggagtgaggtttacctgcacagcactttactagctggctTCGTTGCACTCACCAcattaaacctcactcccatctgggaaATAACTCTtgttaaggtaaagttggttttatatttgcacattcgttcatttttgaacagtgacaataTTTGACATGGACTCTATATTGGAACAGcatctgaaatagcatgtaagtttgACTTCAAACcaacatttaaaactatttaattgactttgaatgATGACGTACATTGGTAgtcgttggctgctaatatgattacTCTGAACACTTctcagaaattatattattaaggagaaagtcagaatgcgTAAATATGAAACCAACTTGACCTCAGTGTAACGTTCTGTGGACGTGAAGGGATTGTATATTAAACATTTGAATGAGACTACACAGAAATGCATGCGATTTACCAACCAATTCCTTgcaattaaattgtgttttactcTGCATTATTTTACTGACTGTTCTCTGAAATTCTGGATGGATACCAGCAGATTTAAGATAAGTATGATCTTATCAGTTATTTTTGAAAATGCCAAACATAGCCTATATACAAGGAGCGGTGTTGAAATTCTGTAGAATTTCATGCACACACATGCCATGCATTGTATGACATTTCATTTATAACCCATATTAGTGTCTATTTTCAtggtactagtacttatttttagATACCAGTATCTTTTCCATTAGGaggtacttatttattagatgctagtgcttttttaaaatatactagCGCTTAATCATTAGATACTAGTT
>TCONS_00020431
ATCGCAAAAGCGGCCTGTTCAAGAGACTGCTGTCGGCTGAAGGAGAGATCCGGGAACTGAAGATAGAGATTGCAAATCAGAGAGCATCGTGGGATATGCGGTTTGTGGAACTGCAAAGGAGACAACATGATCTGAGAGACCAGCTGACCTCAGAGATTCTGGTTCGGACGGGAATGCTGTACAGAGATAATGATTCAGAAGAAACAAATGAGGTCTTTACAGAGTCTGGCCTGGAAAACGGAGTTTATACAGATGAGTGTATAAGTGGTCTCAGACAGACCCACCAGCAAAAGAGGCTTGATATGGATCTGCTTGGAGACGGTGTTGAGCAAAAGAGTTTGTACGGAAGTCAAACCTCCTGCCAATCCAGAGCCACTTCTGCCATGTCTAACATCAGTGTAAGGTCTTGGAGGAGTGGAGGTGGACCTCATCGAGTGTTTGTGCCCCATTCCCCCATGGACCTGAAAACTGGACACAGAGTTCGGATTATGTTACCGTCTGGACGGATCTGCACCGGGACCTTACGTTACCTTGGCAACATGCACAACTCCCCTGACCACTATCTCGGTGTAGAACTGGAGATGGCTGATAATGGACAGCACGACGGCACTTATGAAGGGCAGCGCTACTTTGACTGTGACCCGGGATATGGTGCGTTTGTACCCTTCAGTAAATTGTTAATGGCTTGGGAGTAAACACTAAGTGAAGACTCAACACACGTCACGGCGAAGTACAATGCGATCTTGGATTAACATCAtcttgatcctggaacatcatatTTGTTGAAAAACGTAATCCATTCCTTTTTCCTACCCATTCCACAATCATAACTGTGAGTTATTCCCAAATTCAGAagagaataatagttggataacaatcatgtagaaccGTAAGCCTAAAtttaacataaacagtaaacaaatcccttaattctgattggttgattggaatcttgttccaggatcaacgtaaatgttaatccaggaacatgtccagCGTGGTGAAATCAGGTTAGGAAAGATGAAGACTCAACAGCACTTTCACAACAGCTGTAAGAATCACAACAACTGCTTCAATTCTCACAGAACTGTACGACTGCAGTGGTGACGTATTTTTGTGGGTCAATCTACACTTTGGCTCCCTCAACGaaacacaaatataattttttctcAGGTGGGTTTAGGTTAATTGAAGAAAATAAATTTGAAGGTTATGTTTCTTACAACTTTTAAGCATcatgataatctttaaaaatgaacTTTGACTAATACTGACGCATAATTACAGTATAGTTGGCAGAGGGAAACAATGCAATGTCAACTCTGCTAGTCGAATGATAGCTTACAGAAACAAATAGCAACATAATCAAACGTTCCCTATGTcacattttgacattattttactTTACAATAATGGATTGTTTACACTCAAAAATAAAGGCACGActgctgtcactggggtggaacAATTTTAAAAGGTACACGCTTGTAACTAAAAGTCCTTATTAATACCGTAAGGGTACGTACTAGTACCTTAAAAGTTTAAATGTGTACCTCTGGAAaattgtaggtactaatatacgcCTTGATAGCATGGCAGCTCAGGGATTAGCACTGTcatgtcacagcaagaaggtcactggtctgagtcctggctgggtcagttggcatttctgtgtggagtttgcatgttctccccatgttggcgtgggtttccttccagtgctccagtttcccccacagtccaaatattgaataagctaaattagccatagtgtatgggtgtttactaGTACTGGATTGGACAGacatgtataaaacatatgctagaacagttggtggttcattccgctgtggcgacccctgataaataagtgactaagccgaaggaaaatgaatgaatatacaccTTTAAGGTagtaatatggaccctttaagtacaaatgtataccttttaaaaaggtaccaccctagtaacagctctcgtacctttatttcttttCGTATACTATTTCAGTTTATAATCGGAAAATGCTTGCAATGTATGTGCTGTTCTAAAACAAGTCACCTGTTTGTACATGTATTACAGTGTGATTTGTATGAAAATGTTCAATGTTTTGAAGACAATTAAGTATCtttaaccccgccggtcctacaccccCCAACCCATTCTGACAACCTTCAGCATGGCAGTCGGTTGCTTTACAGAGGAGGCTAAAGACTGTGACCTCTagagtctgtcgctagagcaccttttagaggtcagaggagtgaggtttacctgcacttCACTTGCTGGCCTCCATTACAATCACGCCTCTAAGCCTCACtcctatccgggtcacggcaccaatgcaaCCCCGCTGGTGTTCCACCCCCCTAACCCGCTACGAGCTGTGATcaaaccggccactttctgcatcggttgctctaccaaggaagctaaagaccatggcctctttcgtctgttgctagagcaccttttacgaaacattcacacagagcaacagTGTCAACGCTtcacattcactttgaatgggtgacgtcaggcgttgcgaaactgcattgtggatccctcgtcgccgcttcagaggcgttgctcattGCAGAatttgggactttctcaacttttcaagcgccaacggaagcatcagccaatcagatcgctgcgtgcaaatacaccagctcagacaaatgccgattgctgactaattccATTGGCTggcgctgctatgacgatcgcgtcagccccaacttcagacatgccctctgtcaagcgttgacgctgaagctccGTGTGAATGCActgtagaggtcagaggagtgaggtttacctgcacagcactttactagctggctTCGTTGCACTCACCAcattaaacctcactcccatctgggaaATAACTCTtgttaaggtaaagttggttttatatttgcacattcgttcatttttgaacagtgacaataTTTGACATGGACTCTATATTGGAACAGcatctgaaatagcatgtaagtttgACTTCAAACcaacatttaaaactatttaattgactttgaatgATGACGTACATTGGTAgtcgttggctgctaatatgattacTCTGAACACTTctcagaaattatattattaaggagaaagtcagaatgcgTAAATATGAAACCAACTTGACCTCAGTGTAACGTTCTGTGGACGTGAAGGGATTGTATATTAAACATTTGAATGAGACTACACAGAAATGCATGCGATTTACCAACCAATTCCTTgcaattaaattgtgttttactcTG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000095831

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00020430 False 4558 mRNA 0.42 8 4010967 4031386
TCONS_00020431 True 3287 mRNA 0.43 5 4011282 4026265

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_010386 NA coding downstream 214334 3784874 ~ 3796633 (-)
XLOC_010385 GRIK3 coding downstream 331991 3463727 ~ 3678976 (-)
XLOC_010384 NA coding downstream 662258 3348006 ~ 3348709 (-)
XLOC_010383 csf3r coding downstream 883218 3103182 ~ 3127749 (-)
XLOC_010382 cdcp1a coding downstream 1140445 2847565 ~ 2870522 (-)
XLOC_010388 NA coding upstream 147650 4179036 ~ 4179967 (-)
XLOC_010389 rrp15 coding upstream 165546 4196932 ~ 4203022 (-)
XLOC_010390 CU469524.1 coding upstream 179091 4210477 ~ 4211935 (-)
XLOC_010391 CU469524.2 coding upstream 203341 4234727 ~ 4267736 (-)
XLOC_010392 vegfaa coding upstream 256156 4287542 ~ 4317879 (-)
XLOC_010626 CR392024.2 misc upstream 16863726 20895112 ~ 20895175 (-)
XLOC_010380 NA non-coding downstream 1198959 2809717 ~ 2812008 (-)
XLOC_010378 CU929110.1 non-coding downstream 1275168 2735676 ~ 2735799 (-)
XLOC_010372 NA non-coding downstream 2061898 1948025 ~ 1949069 (-)
XLOC_010394 BX927222.1 non-coding upstream 496095 4527481 ~ 4527647 (-)
XLOC_010396 NA non-coding upstream 522685 4554071 ~ 4558497 (-)

Expression


Co-expression Network