XLOC_001042 (si:dkey-31e10.1)



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_001042
gene name si:dkey-31e10.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 10642322 ~ 10647484 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00001673
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>TCONS_00001672
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>TCONS_00001671
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>TCONS_00001674
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Function


symbol description
si:dkey-31e10.1 Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane.

GO:

id name namespace
GO:0016020 membrane cellular_component
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-060503-356 Predicted to be located in membrane. Predicted to be integral component of membrane.

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000067992

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00001673 False 3785 mRNA 0.38 3 10642322 10647484
TCONS_00001672 False 3877 mRNA 0.38 2 10642322 10647484
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TCONS_00001674 True 777 mRNA 0.44 4 10643541 10647307

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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XLOC_001040 trpc5a coding downstream 21863 10486093 ~ 10620459 (-)
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XLOC_001037 CR854964.1 coding downstream 369597 10270247 ~ 10272725 (-)
XLOC_001043 si:dkey-31e10.5 coding upstream 19963 10667447 ~ 10669436 (-)
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XLOC_001047 crfb15 coding upstream 162120 10809604 ~ 10821584 (-)
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XLOC_001051 BX004756.1 non-coding upstream 415040 11062524 ~ 11062647 (-)

Expression



Co-expression Network