XLOC_010480



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_010480
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 10980052 ~ 11011652 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00022124
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Function


GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00022124 True 14537 lncRNA 0.39 2 10980052 11011652

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_010479 NA coding downstream 60618 10917584 ~ 10919434 (-)
XLOC_010478 CU468227.1 coding downstream 63648 10916290 ~ 10916404 (-)
XLOC_010477 NA coding downstream 120438 10849706 ~ 10859614 (-)
XLOC_010476 rabac1 coding downstream 142807 10828787 ~ 10837245 (-)
XLOC_010475 g6fl coding downstream 432271 10522596 ~ 10547781 (-)
XLOC_010481 znf526 coding upstream 215594 11227246 ~ 11241424 (-)
XLOC_010482 BX005242.1 coding upstream 426217 11437869 ~ 11538821 (-)
XLOC_010483 NA coding upstream 585732 11597384 ~ 11639472 (-)
XLOC_010484 zgc:158701 coding upstream 748950 11760602 ~ 11779661 (-)
XLOC_010485 tlr21 coding upstream 774315 11785967 ~ 11789108 (-)
XLOC_010626 CR392024.2 misc upstream 9883460 20895112 ~ 20895175 (-)
XLOC_010472 NA non-coding downstream 550159 10421170 ~ 10429893 (-)
XLOC_010473 NA non-coding downstream 551512 10425747 ~ 10428540 (-)
XLOC_010491 NA non-coding upstream 980914 11992566 ~ 12005084 (-)
XLOC_010492 CU467865.1 non-coding upstream 1000422 12012074 ~ 12012188 (-)
XLOC_010497 CR388102.3 non-coding upstream 1227755 12239407 ~ 12239460 (-)

Expression



Co-expression Network