XLOC_010482 (BX005242.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_010482
gene name BX005242.1
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 11437869 ~ 11538821 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00020570
GTGCTTTACAGAAGCATGTTTTACTCCGGCCTCAAGAGGACGCCATTTACTAAAACAGCAGCTAAAGAACAGCTAAAGGTGGATTTTTAACACTCTTCCATCAAAAGTCAACCTTGCTGTTTAACGTTTACAAGGAGGAAACGTGTGGTCGAGTTTGACAGCGTACCCTATTGATCAGCTCTCCCACCATGCCCGTCCACGAGCCGTTGGGTTCGGGTGCCCCGTACAGACCATCGTCCACCAGTTTGATGCGGAAACCTTGGCTTGTGTCTGAATTAACCAACCCAGGTCTGCTGAAGATCATccctgaacacacaacacatccaaccttgaagcagatgagcttcCGCAGAGGAAGAAGAGCACACTggtgcctctcctgtcagctGGAAACAGAAAAATGAGACTGCAATCGGCACAGAAACATGTTGCCTGCTCTAATGAGTCTCGATGTCTGCTGCAGCATTCAGATGGTTGGGGTTTTGGTGTAAACAACCcaaaagcatagatccatcctgccttttatcagtGGTTCAGACTGCTGTGGTGTAATGATGTgcgggatattttctttgcagaCGTATGACCCCTTATCCCTAACAAAGTGGTGTTGTTTAACTGATACTTATGCCCGAGTTTTGATTAAAGCCAcaaatctcaa
>TCONS_00022125
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Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000097130

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00020570 False 661 lncRNA 0.47 3 11437869 11538368
TCONS_00022125 True 7937 lncRNA 0.34 1 11530885 11538821

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_010481 znf526 coding downstream 196445 11227246 ~ 11241424 (-)
XLOC_010480 NA coding downstream 426217 10980052 ~ 11011652 (-)
XLOC_010479 NA coding downstream 518435 10917584 ~ 10919434 (-)
XLOC_010478 CU468227.1 coding downstream 521465 10916290 ~ 10916404 (-)
XLOC_010477 NA coding downstream 578255 10849706 ~ 10859614 (-)
XLOC_010483 NA coding upstream 58563 11597384 ~ 11639472 (-)
XLOC_010484 zgc:158701 coding upstream 221781 11760602 ~ 11779661 (-)
XLOC_010485 tlr21 coding upstream 247146 11785967 ~ 11789108 (-)
XLOC_010486 cnfn coding upstream 251819 11790640 ~ 11798994 (-)
XLOC_010487 cxcr3.1 coding upstream 314391 11853212 ~ 11859309 (-)
XLOC_010626 CR392024.2 misc upstream 9356291 20895112 ~ 20895175 (-)
XLOC_010473 NA non-coding downstream 1009329 10425747 ~ 10428540 (-)
XLOC_010491 NA non-coding upstream 453745 11992566 ~ 12005084 (-)
XLOC_010492 CU467865.1 non-coding upstream 473253 12012074 ~ 12012188 (-)
XLOC_010497 CR388102.3 non-coding upstream 700586 12239407 ~ 12239460 (-)
XLOC_010498 CR388102.2 non-coding upstream 709041 12247862 ~ 12247920 (-)
XLOC_010472 NA non-coding downstream 1007976 10421170 ~ 10429893 (-)

Expression


Co-expression Network