XLOC_010484 (zgc:158701)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_010484
gene name zgc:158701
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007127.7
NCBI id CM002900.2
chromosome length 55266484
location 11760602 ~ 11779661 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

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>TCONS_00020574
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>TCONS_00020575
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>TCONS_00020577
GCCTGGTTCGATATTCCTGTTTCCGGGGTTTGGCAGCTGACCGCTGGCTGACTGATTCAACACAAAACTCTGCTGTAGAACATTTGTCGTGATGAGTGGAGATTCAAACCCTGCAGCCACACCCACCCCCTGTCAGGACATACAGGGAGATGGACGATGGATGTCATTGCACAATCGATTTGTATCAGACAGTAAAGGAAAAGAGCCTGATGTTCTGTTTGTTGGAGATTCACTCATCCAGCTTCTGCATGAGTTTGAGGTTTGGAGAAAATTGTTTTCTCCTCTCCACGCTCTAAACTTTGGGATTGGTGGAGATGCTACGCAGC

Function

symbol description
zgc:158701 Predicted to enable DNA binding activity and protein heterodimerization activity. Predicted to be part of nucleosome.

GO:

id name namespace
GO:0000786 nucleosome cellular_component
GO:0005634 nucleus cellular_component
GO:0005694 chromosome cellular_component
GO:0003677 DNA binding molecular_function
GO:0046982 protein heterodimerization activity molecular_function

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-040426-1026 Predicted to enable hydrolase activity. Predicted to act upstream of or within lipid catabolic process. Orthologous to human PAFAH1B3 (platelet activating factor acetylhydrolase 1b catalytic subunit 3).
ZDB-GENE-070410-10 Predicted to enable DNA binding activity and protein heterodimerization activity. Predicted to be part of nucleosome.

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000058047 ENSDARG00000091864 ENSDARG00000105336

RNA

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TCONS_00020576 False 1172 lncRNA 0.43 5 11775141 11779444
TCONS_00020577 True 326 mRNA 0.48 4 11778271 11779508

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_010483 NA coding downstream 121130 11597384 ~ 11639472 (-)
XLOC_010482 BX005242.1 coding downstream 221781 11437869 ~ 11538821 (-)
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XLOC_010480 NA coding downstream 748950 10980052 ~ 11011652 (-)
XLOC_010479 NA coding downstream 841168 10917584 ~ 10919434 (-)
XLOC_010485 tlr21 coding upstream 6306 11785967 ~ 11789108 (-)
XLOC_010486 cnfn coding upstream 10979 11790640 ~ 11798994 (-)
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Expression


Co-expression Network