CI01000069_03571631_03573352



Basic Information


Item Value
gene id CI01000069_03571631_03573352
gene name NA
gene type misc
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000069
NCBI id null
chromosome length 5329268
location 3563293 ~ 3576335 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence


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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU312899 True 13012 TUCP 0.39 2 3563293 3576335

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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CI01000069_03441535_03443377 NA coding downstream 128135 3441270 ~ 3443400 (-)
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CI01000069_03670799_03677837 NA coding upstream 94528 3670271 ~ 3677843 (-)
CI01000069_03678617_03697993 PIH1D1 coding upstream 102555 3678298 ~ 3698756 (-)
CI01000069_03721128_03722393 NA coding upstream 145201 3720944 ~ 3722393 (-)
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G275750 NA non-coding upstream 19978 3595721 ~ 3627754 (-)
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G275754 NA non-coding upstream 37010 3612753 ~ 3636263 (-)
G275828 NA non-coding upstream 38575 3614318 ~ 3633114 (-)
G275920 NA non-coding upstream 160911 3736654 ~ 3736958 (-)
CI01000069_03415853_03417644 LIMD2 other downstream 145161 3412973 ~ 3417644 (-)
G275699 NA other downstream 493367 2992504 ~ 3078168 (-)
CI01000069_02997434_03008924 NA other downstream 571102 2997275 ~ 3008924 (-)
CI01000069_02589498_02621318 SYT3 other downstream 941219 2589469 ~ 2621641 (-)
CI01000069_01645966_01647142 NA other downstream 1924209 1644522 ~ 1647326 (-)
CI01000069_03768812_03787588 BRSK1 other upstream 189930 3765673 ~ 3787588 (-)
CI01000069_03804630_03807180 PRMT1.S, PRMT1 other upstream 228873 3804616 ~ 3807180 (-)
CI01000069_04932463_04940554 NA other upstream 1363778 4932144 ~ 4941471 (-)

Expression



Co-expression Network


Homologous


species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
zebrafish (Danio rerio) XLOC_026466 zp3e coding NC_007114.7 CM002887.2 31875772 ~ 32055378 (-)
rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) G12390 NA non-coding NC_048565.1 CM023219.2 13581105 ~ 13581310 (+)
rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) kcnc3a LOC106600760 misc NC_048576.1 CM023230.2 62238004 ~ 62342939 (+)
mexican tetra (Astyanax mexicanus) G10838 NA unknown NC_035898.1 CM008301.1 15758762 ~ 15769243 (+)