G275188


Basic Information

Item Value
gene id G275188
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000069
NCBI id null
chromosome length 5329268
location 1371056 ~ 1381154 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU312225
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GGCCTTTATTAACTCCCCGGAGCTGTGTGGAGTACTTTTACGATGGATGAATGCACTTTTTTTTTTTTTTGCTTCAAAA

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU312225 True 10079 lncRNA 0.39 2 1371056 1381154

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000069_01155772_01178120 RBFOX1 coding downstream 192936 1155442 ~ 1178120 (-)
CI01000069_01141607_01144384 NA coding downstream 226235 1141470 ~ 1144821 (-)
CI01000069_01085974_01097576 METTL22 coding downstream 273480 1085650 ~ 1097576 (-)
CI01000069_01052717_01076129 ABAT coding downstream 294927 1052208 ~ 1076129 (-)
CI01000069_01023405_01025613 NA coding downstream 344998 1023342 ~ 1026058 (-)
CI01000069_01410825_01412802 NA coding upstream 29433 1410587 ~ 1413155 (-)
CI01000069_01519314_01531186 FBXL16 coding upstream 138047 1519201 ~ 1531586 (-)
CI01000069_01571371_01593400 GSG1L coding upstream 190217 1571371 ~ 1593400 (-)
CI01000069_01632361_01633951 NA coding upstream 251070 1632224 ~ 1633951 (-)
CI01000069_01645966_01647142 NA coding upstream 263368 1644522 ~ 1647326 (-)
G275189 NA non-coding downstream 21832 1343436 ~ 1349224 (-)
G275182 NA non-coding downstream 64175 1273440 ~ 1306881 (-)
G275191 NA non-coding downstream 71927 1283491 ~ 1299129 (-)
G275184 NA non-coding downstream 130447 1237987 ~ 1240609 (-)
G275179 NA non-coding downstream 246759 1120362 ~ 1124297 (-)
G275195 NA non-coding upstream 10669 1391823 ~ 1395183 (-)
G275276 NA non-coding upstream 39257 1420411 ~ 1420848 (-)
G275284 NA non-coding upstream 69256 1450410 ~ 1450722 (-)
G275286 NA non-coding upstream 71972 1453126 ~ 1453361 (-)
G275187 NA non-coding upstream 73299 1454453 ~ 1455732 (-)
CI01000069_00952894_00955774 NA other downstream 415266 952361 ~ 955790 (-)
G275178 NA other downstream 425252 926923 ~ 945804 (-)
CI01000069_00044853_00051264 YPEL1, YPEL3, YPEL2, YPELD, YPELA, YPELC other downstream 1323842 43906 ~ 52896 (-)
CI01000069_02589498_02621318 SYT3 other upstream 1230021 2589469 ~ 2621641 (-)
CI01000069_02997434_03008924 NA other upstream 1607872 2997275 ~ 3008924 (-)
G275699 NA other upstream 1611350 2992504 ~ 3078168 (-)
CI01000069_03415853_03417644 LIMD2 other upstream 2031819 3412973 ~ 3417644 (-)

Expression


Co-expression Network