G276095


Basic Information

Item Value
gene id G276095
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000069
NCBI id null
chromosome length 5329268
location 5138358 ~ 5152509 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU313217
CTCTACAGAGACTTGAGCCGCTGTTGTCAGTTTCAACAAAATGGCTGCTGGAGCGCCACAAACGAAAACCCAGTGAACGCTTCACGTCAGTGCAGTATCATTTTAAATGGATGCATTGGAATTTCCCTACCTTCTGAGCATCGGGACATTTACTCGTGTGGACTCGTTTACATACGTATTAGCGAAATGAAGGCATGCTGAAATATTTCCCTTTACGCACTTTATATACACCCAAAAGCATACAGAAGCTCAAACTGCCAGTGTGCGCGCGTCTGTGTGGGTGCGCGCGTGTGTAGCTGCTCCTAAAAATCGTCGTAATGTTGAAGATTATCAACCTTAAGCTTTCTTGCTTACGTGGAAAATTGTCGTTTAATGTAATTTTCACTGTTTGCACTGGCATTTTTTGAGTTTTTTTTTCCCCCCCCGCATCTGGATAAATTCCACTGCATATTGAGAGGTGAATTCCTCAACTGGAAAGTCAGCCTCGCCATTGCAGCTCACTGCAAGAGCGAGTGTCCCGACTGCGACTGAATAATATCTGATCTGTGTCAGTACGGGTATCGACAACATCCTCCTTCACCATGCAGCTCATGCATCACATTTGAACGGCAGACCGCAGTTGCTCCGTGTGCAAAATAAAGCCTTGGGACAAAACACGTCACACAAGAGGAGAACCATTTGATGGAAGAAAAGAAAAAGAAAAAGCAAGAGGAAAAGAAAAAGAAGGAAGCTGCTCAGAAAAAGGTGAGGGCTTCTTTCCTATGACCTACAAGCTTTCACGTAGAATCTTTTGCTTGCGTCCTCCTTATAAAAGCTGCTTAACGGACACCTTAGTCTGTCATAAGCTTCTGAGACATCTTTACCAATGTGAAGCACAGGTACCAAACAGAAGACCTGGCAACCTGTTTGATGTCTGCCTGTGAAACTGTTCAAACACAGTTGTTATGGTGCTCACTTCTTAGACATCATCATGAAGTTACAAAGTCAGTGTTCCCGTCTTGTGTATACTAATGTAACATTCACTGATGTTACACAGGTCACATTCTGGTGCTCTTTTGACTGATTTAGCACATCCAGCTTGATCTCTATTTAGCTAAATACTGAACATCTTATGTGTTCCAAGATTTATGGTCCACTAGTCATTTTTACAGTTTTTTTTTTTTTGTTCCAGAAGTGACACATTCTTTGTTATAAAGCTTTTGTACACTAGACCTGTGAAAGTGTGCATCTCTCAGTCTACCTTTGTTCTTCCTTTACAGGCTGCTGAACAGAAAACCAAAGGTCAGTTATGATTCTCTTTGCAGTGCTGCACTAAAGCATGAAGTTAAAATGTGTTTCTTTTTTAAGGATCTTCTCCATACAGATATGTTCATACCACATATATCTCCTCAAACACCTCTAGAGTGGCAACTTATGAAGCATATGAACGTTCGAAATTTGAATGTTATTGAGCGGCTCAGAAGTATGATCAGGATTATATTTCTTAATATGTAAATCTGGCAATATTGTAAACTGGCAGCATCATACGATTTTAAAAAGCGTTTCTTCAACTATGGTCACTTTTGGCACTGTGGACTTTGAGTTCACACTCTCACTAGTTTGATTGGTCTACTAATTGTCTTCAACAGTGAACATATACATCAGGAGAATGCTGTTCTTTTTGTCATTGCCATCATACCTCAAATAATGTATTCTGTTTGATTGAATTCTGTGGTGGAAATGACATTTAAAATATTTTAAATGAAAATCGCAATTTAGAATGGCCGACTTTTTTGTCTTGCTAAGACTAATTTCATAGCTAACATTTGATTGGTCCTAAATACACATAATTAAATTATATATTTTTTTTATATTTTTGTTTTAAAACTTTTTATTGATTTTAGTGTTGTTTTAATGTACATGACAACTGAAGAGCTGTTGTAGTTTGTGTAAAGATTTGCATAATTTTCACACAGTAAATATTAGAATGTGTATTTTGCTCTATTTGTAGATTATCATAGTTGTAAAAATGCAATAAAATTATGAATTTTCATATTTTTAAATCTGTGACTGGGACAAGTATAAAACAATAGAATCTGTACAGTACATAAATGGTGTTTGCAAAGTAGCCACTTAAATGGAGAACAATTTTACAAAAAGAAACAAGCTGAAAAAAATTCAACTAGTGCTTGTAGTTGAAGAAACACCCATTCATTTAAAAGTATCTGTTCTCTGTTAGTCTGATTGTTAGTAGGTCCTGTTTAAATCAGTGTTAGCAGCAGATCTTAGAGTGACAGGAGAAGTGAGAGTGACAGCACTGGAAGGGAGACAAGGGGAGCAGGAGAGGAAGGTATGTGCTGACGTGTTTGGTTCTGGTCTCCTCACCCCATAGGTTACGCCGCCTTCATTGAGAGGGGTGAGGTATGAGGCAGTAAATTTTAGACGACAGAAAAGGCTTTTTGAGGGTTGTCATGGGGCAGATGGGAGAGGGGCTTATGTCATGTGAGGGATAGACAGTCATAAATCTCATTAGAGCATCTGCTAATGCTGTAACTCTCAAACATCAGACTTAACGCAGGAGGGAGTGCTGGTTTAGTGCACACAGGGAACTTCAATTGCAAAATATTCTGGAGAATTGAGTTGCAAAGCTCTTTCTTTCGCGCTTTCATCCCCTGAATCTCTATCACTGTGTGAGTCAATGTTCAGGATCTCTTGTTTCTTTAATCTGAGTGCACTAGGGGCATTCGTGGAGCTTTGCTAATTAGATCTAATCTGGTTTTGCTTTGTTTCACATCTTTCTTTATCCCCTCTTGAGCCATGGTACCTAAGGACACACATTATCTGCTGCTGATAAGGATATGTCTGTTCCTTCCGCCTGTTAGATCTTCTTGAATTTGGCTGACCTGTTTCTGGGTGGCTCGACATGTGTGTTAGATTTCTTCTGTGTAAAGTAAAATGGACCAAAGTGCTTGTTTTTGGAAAAGGGTTTGTCGAAGGTAGCATAACCCTCCTGGATCGAAGTTGACCTTTTAGTGCCTAAGTCTTAAATACTTTACCCAAGATACTGTCTGTGTGACAGATCTTTTATAGTTCGATAAATCTGTTTGATGTTTCTTGTAATTCGGGTTTTGTTTATGAAGTTGTATGTTTATTGTAAGGATGTTGCAAAAATGCACAATTTAGTGGGTTGTTTGAACAACTAGTTGGTCTTAAAGGGATAGTTCACCCCAAAATGAAAATTCTGTCATTTAGTTACTTATGGAGTTGTTCCAAAACTGTTTGGTTACCATCTAGGGCTGCATGATATTGGAAAAAACTGACATTGTGATTATATTGTTTTTCTGCGATATATATTGAGATATGAAAAAAATTCACCAGATGACTTGAATAGCTCTATTCGGAAAGAGTTTATCATTCTAGGATGATTTGTGGCTATTTTGTAGGTGAGTGAATACGCATAGAAAATAATGAACAAATTACAAGGATAGATAAATATTATAGAACAAAGATACAAATAAAATAAATAGTGCTTTATATTTTTCAGGTAAGAGTATTCAGTACAGTATTCAGGTACAGAAATTGAATAATCAAATGTAAAATAACACTGCATAGTCTTCCCTATATAAATTAAACAATTATTCTGTGGTAAAACTATAAAAAATTATTTTTCTCTGTCTTGTGTTGTTTGATTAACATTCAGTGGGAATATTAGGCTACTGTCACTTTAAGACCGAATGCGCGGATCCAAAATACTGTTACTGTAATACTGTATTTCTTCCTCAATTGTTTAGTTCACCTAAGCCATAAGCAACTGTATTTGAGGACAATGTTTTATGTGCATTTTGACAATTTCTTTGCAAATATGTGTCAGTTCAGGCACAAATAGATGCGGAAGAGAACGGCATTCGGTGTTCATGTGCATCTGTGTGTGCGCACGCACATAAAACAGTCGCACGTTTAGAATTGAGTTCTCTTTTGCATCTTCAAATAGTTTAAGTAGCTTGAATGTTTAAACTGAAAGAACCTAAAACACGTTCAAATGATAAACTTTTATTGTATGATGGTCAAACTTTTCAATTAATCCGAGAATCACGTGCGTTTTGAACCGTGTCTGGTCCGTACGAATTAACGATCCGTATACTTTGCATCGCACATCCTGCAATGTGACTATCGCGGATATCAGTGCTAAAACGATATATTGTGCAGCCCTATTACCAACATTCTTCAAAATATTTTCTATTATGTTCCACATAAGAAAGAATTACAGGTTTGAAACTACATGAGAGTGAGTAAATGTTTACAGAGTTTTCTTATTTTGGTGGGGTGTACTGTCCCTTTTAAGGTAGCCATTTATAACTAGGATGGTTTAGGGCATGTCCATCAAATGCCAGATGTGTTTTTAACAATGTTTAGATGCTAATTGCAGTTCTTCAGTGGGGTAACTGACAGGTATTCATCAAACAAAATTATTAAATTATGTAACCTTTAGTGCACAAAATCGCCAGTCATTATAAAAACAGAGACCTACGCATAAATAACAGCAAGTAATTTAAAGACTGACAATTAATGTCTTGAAATCTGAAGTTTGATGGCTCGACAGGACTTCTGTTAGTCTTTCAGCATGCTAAAATGTTCTCTGATAAGTTGTCCCCTTTAAAACCCTGCCACTATAAATATTAAAGCTAAATAAAAAGAAAAAAAGGAGTTGACCTGACTTATCACCTACTATTTGACCACTCTGACCACAAAAATTCACTGGATATTCTGTGATTGCTGAAAGGACATTTTAAATTCAGCATGATGTCGCCTAAAGATCTTTTGTATCATTAGAGAAAGGTGAAGGTGAGCTCTGAGGCATGAATCTCTAAAGAGACTCCTGGAGGAAGCAGCGCTGTGCTCTGGTACTGAGTGAGCAGTGACGACCGCAAGGCCATCTTTCTCTTTTCAAGAGAGGCCCAGGAGGGGCATATACACACACATACACACACATACACACACACACACACACACACACACACACA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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU313217 True 6849 lncRNA 0.38 2 5138358 5152509

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000069_05100248_05121420 TNRC6C1, TNRC6C coding downstream 16938 5100067 ~ 5121420 (-)
CI01000069_05042346_05044105 NA coding downstream 93123 5042275 ~ 5045235 (-)
CI01000069_05025745_05032197 YIPF2 coding downstream 106161 5025297 ~ 5032197 (-)
CI01000069_04996783_05001227 CLPP, CLPP.L coding downstream 137131 4996340 ~ 5001227 (-)
CI01000069_04985959_04986408 NA coding downstream 151950 4985693 ~ 4986424 (-)
CI01000069_05227862_05278522 SEPT9A coding upstream 75353 5227862 ~ 5278522 (-)
CI01000069_05321785_05324036 NA coding upstream 168762 5321271 ~ 5324097 (-)
G276078 NA non-coding downstream 41372 5094118 ~ 5096986 (-)
G276103 NA non-coding downstream 48781 5086117 ~ 5089577 (-)
G276193 NA non-coding downstream 78790 5059333 ~ 5059568 (-)
G276107 NA non-coding downstream 128885 5004379 ~ 5009473 (-)
G276071 NA non-coding downstream 345555 4791382 ~ 4792803 (-)
G276200 NA non-coding upstream 2527 5155036 ~ 5155302 (-)
G276203 NA non-coding upstream 6199 5158708 ~ 5158935 (-)
G276204 NA non-coding upstream 6894 5159403 ~ 5159718 (-)
G276207 NA non-coding upstream 14523 5167032 ~ 5167723 (-)
G276208 NA non-coding upstream 16306 5168815 ~ 5169201 (-)
CI01000069_04932463_04940554 NA other downstream 196159 4932144 ~ 4941471 (-)
CI01000069_03804630_03807180 PRMT1.S, PRMT1 other downstream 1331281 3804616 ~ 3807180 (-)
CI01000069_03768812_03787588 BRSK1 other downstream 1369138 3765673 ~ 3787588 (-)

Expression


Co-expression Network