G281417


Basic Information

Item Value
gene id G281417
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000071
NCBI id null
chromosome length 5214881
location 1983522 ~ 1992903 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU319048
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU319048 True 9330 lncRNA 0.37 2 1983522 1992903

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000071_01966426_01969786 NA coding upstream 13736 1966093 ~ 1969786 (+)
CI01000071_01909999_01929819 NA coding upstream 53261 1909078 ~ 1930261 (+)
CI01000071_01677282_01720849 NA coding upstream 262673 1677282 ~ 1720849 (+)
CI01000071_01580310_01581199 NA coding upstream 402317 1580310 ~ 1581205 (+)
CI01000071_01514470_01525572 NA coding upstream 457927 1514315 ~ 1528807 (+)
CI01000071_02000540_02048898 NA coding downstream 7482 1993072 ~ 2049583 (+)
CI01000071_02063411_02065517 NA coding downstream 70508 2063411 ~ 2065565 (+)
CI01000071_02105220_02105800 NA coding downstream 112317 2105220 ~ 2106022 (+)
CI01000071_02137176_02137478 NA coding downstream 143103 2136006 ~ 2137909 (+)
CI01000071_02329452_02331682 NA coding downstream 336329 2329232 ~ 2332031 (+)
G281377 NA non-coding upstream 95501 1887676 ~ 1888021 (+)
G280787 NA non-coding upstream 162043 1821204 ~ 1821479 (+)
G280783 NA non-coding upstream 171471 1811623 ~ 1812051 (+)
G280781 NA non-coding upstream 175218 1808076 ~ 1808304 (+)
G280772 NA non-coding upstream 198706 1784616 ~ 1784816 (+)
G281424 NA non-coding downstream 13106 2006009 ~ 2007559 (+)
G281406 NA non-coding downstream 57252 2050155 ~ 2052383 (+)
G281412 NA non-coding downstream 82827 2075730 ~ 2076186 (+)
G281451 NA non-coding downstream 105838 2098741 ~ 2098967 (+)
CI01000071_01374449_01376813 NA other upstream 605852 1373996 ~ 1377670 (+)
G280443 NA other upstream 1061426 905217 ~ 922096 (+)
CI01000071_00792254_00802384 SLC6A4B, SLC6A4 other upstream 1180205 791346 ~ 803317 (+)
CI01000071_02815324_02834097 NA other downstream 811741 2815127 ~ 2835525 (+)
G282080 NA other downstream 1063181 3056084 ~ 3056531 (+)

Expression


Co-expression Network