G292516


Basic Information

Item Value
gene id G292516
gene name NA
gene type misc
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000080
NCBI id null
chromosome length 5175454
location 3208855 ~ 3218403 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU331945
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>TU331946
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>TU331947
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>TU331948
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>TU331949
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>TU331950
NNNNGAAGCCGCTGCCCCTGCAGTTGAAGCCGCTGCCCCTGCAGTTGAAGCCGCTGCTCCTGCAGCTGATGCCGCTGCCTCTGAAGTTGAAGCCGCTGCCCCTGTAGTTGAAGCCGCAGCGCCTGCAGTTGAAACTGCTGGCCCTGTAGTTGAAGCCGTTGCCCCTGCAGCTGAAACCGTTGCACCTGCTGAAGACGTTGCCCCTGCAGCTGAAACCGTTGCACCTGCTGAAGACGCTGCTCCTGCAGCTGAAACCACTGCCTCTACAGTTGAAGCCGCTGCCCCTGCAGCTGAAGCTCCTGCTGCACCAGTATCTGAAGCTGCACCCACAGAAGAAGCCCCTGCCCAAGAAGCAATTGCTGAAGTTGTAGAAACAGTCAATGAAGTAGTTGCAGAAGCTGCCCCTATTGAGCCAGTTGCAGAGGCAGCTCCTGCTGAAGAGCTGGTAGATTCTGCCCCTGTGATCACAGATGCTACTGAAGTTCCAGCAGAAGTTGTGGAGACGCCTGAGGCTGGATTGGACCCCATTCAGAAACTTTTCCTAGATTCAATTCGTGCATACTCCACAAAAAGCGGTGCCGCTGGTGGTCTAGTTGATGCCGGTCCAGAGTATCAGAAGGCTCTTGCTGAGGAAATAGCCAAACTGCAGCGGTTGTATGGTGGTGGTGATCTGACTTCCTTCCCAGAATTCAAATTCCCAGAGCCTAAATTTGATGAAGTGTCCTCCAAGTAAACGTCTGTTTTCCTCTCCTGTGCCTCAGCCCAATTTTGTGAAAGAGGTCTTTAAATGACTTGTCTTTCATCTGTGAAAGTGAACATTTCGTGAGATTTTTAATTTTGTGAGACTCTAAATACTAAATAACTATTTTTCAAAAATTCTTATGTCTAATGGAAAAAGCTACCTATTTCATGTACTGTAACGCACATGTGGAAGAGAACATTGCTTAGCTGTTAAATAAATGCTTGTTGCTTTCCATAATGTTTGTCAGTGAGTTTAAGTATTTGGGGAAAGAGCTGAATAAACTGAGCC

Function

GO:

id name namespace
GO:0016071 mRNA metabolic process biological_process
GO:0000375 RNA splicing, via transesterification reactions biological_process
GO:0000377 RNA splicing, via transesterification reactions with bulged adenosine as nucleophile biological_process
GO:0006397 mRNA processing biological_process
GO:0000398 mRNA splicing, via spliceosome biological_process
GO:0016607 nuclear speck cellular_component
GO:0005681 spliceosomal complex cellular_component
GO:0005685 U1 snRNP cellular_component

KEGG:

id description
ko03040 Spliceosome

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU331946 False 613 TUCP 0.42 4 3209234 3218158
TU331947 False 858 TUCP 0.39 4 3209234 3218403
TU331948 False 613 lncRNA 0.41 4 3209234 3218158
TU331949 False 992 lncRNA 0.38 4 3208855 3218158
TU331950 True 329 lncRNA 0.48 1 3209234 3209562

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location