G298214


Basic Information

Item Value
gene id G298214
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000086
NCBI id null
chromosome length 2920448
location 1419442 ~ 1427548 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU338563
AGTCTATTTTAGGACCATTATGATGTTTTGCATTGTGGTGTTAATTTTAATATCAGTGCTTATTTTGCATAAATCAAATCAATGCTTATCAATGCATAAATCAAACATAAATGAATGCTTATTTTGCATAAATATCAACATATTTTGCATAAAGAAAATAAGGCCTATTTTAGGACCAGAAAGATTTATTTATTTTTTGCATTGTAGCATTCATTTCGATATCAATACTCATATACTGGAGCAGAGATGGCGAATTTTTGTAGGCCAACCCGTAAGTTCGCATCACCCTGAATCCCTCGACAAAAACCCAATTGGATTTTTCCATTGACTTTTGGATTATTGCCGAAAATAAGGTCTGTGACTAACAAAAGCTTATGAGTCTCACATAGTTTGTTCATCATGATAATCTTCAGAAATGAACGCAACTTTTATGAATTTTGAAGCGTAAAGACAATCAGCAGAAGTCAAAAGCTAAATGCAGGCTATAAATGAACAACACCACGGTCACATGACTTCAGCGTCACCATCACTAAGCTTCAGTCAACTGTTTAAAAACATTTTCCCTGAAAGTTTGAGTTAAAGTAGTATGCAAGAGTGCGATTATAAACTCAACGAGGTTGTAATTATGGACTAGTGCGTAGATGAGTTTACCTGTTAATGACCCTCACAAGAGGGTATTACTGATGTATTTTATGTTGTAGAATAAAACGTGAAAATATATTGAGCTTGTGTTCACCATAGACCTCATTTTAAGCATTTAACCAAAAACCCATTCAATAAACCTTCAGGCGGGGCTTATATTTTTGGTATGTGGGTGTATTTACTCCTGTATTTATCTAGATCTTTTCCTCTTATAAATGACATGGCTATATAATCTCGTCTAGCTGCTCCTGAAGCTCCTCTCTTTGTTGGAAATGTTCTTGACAGTGTTTTTTGACATTCCCCAGAAAGTCTAGAGGAATTTGCGGTTCGTATCCACGAGCATGCGAAGCTTGTCGAGTCTATGGCCTCTCATTCATCAGAGCCTCCCTGCTTTTGTCATGGGGTGCTGACTGGAGGGTTTATCCCCTGTTGGGACATGCTGAATGGGCGTTCACCGCTCTGTGAGATGGATAGAGTTACAAGGAGCAGCTTGGCAGCTCTCACCCGAGGCTGGGTGGAAGCGAAGAGAGGAGCCGTGAGCTTTGAGCGCTTCCTCTCAGGAAAGCCAAGATCCTGTTCCACTTCTCGGAGTGGAGGAGGACGCTGCAGGCCTCTGAGCTACTGGTGAGGGGGCAGGAGAGTGCAATTAGCTCCTGGCTATTGAAACGGGGGATGGAGAGCGGCCGCTAAACGAGAGTCATGATTACAGCATCTGTTCTTCTGTTTTATCCTGCGCTGCTGAGATTAGATTTGACTTTCTCGATATGTGCAGAGTTTTTCAACAGTCTTTGCAAACTAAACTTGATGTGATTACTTGGCTAGATATAGACTAGATTGGTTATTGGAGCAATTATGACTGTAACTGAGGTTTTGGATAGGCTGATTAATGAACATTCAACCTTCTATGGACACACTGAAGCTTAAGTCGCCATTGGCTAGTAAATTCTTTATTTTACTCGCCAGACTTTTTACATGGAATGCAAGAACAATGCAAATGAAAAAAATTGAGTTTATTTTGAGTTTATCAACCTAATTTCGGAAACTTCCCTTGATTTTAATATTCTTTTCTGTAGAAAGACTATCATAAATAGTGATGAAAGCCAAAATATTAAATGTCACAGATGTATATTTACTGAGTAATTGAGTAGCCAATTTACAGGGGTGTAAAAATGACTTTTGAAAGATGGTAGGATCATTATTTTATTTTTACACAGAGATTGGTAGGTCTATTAATAAAATCTGTTGACTTTAGCAATCTTTGTTTCATTAAATGCCAACAGCAACAGTTCAAAAATGGGGAAAAAGCACTTCTTGTGTTTTTTGCCTCTAAGTTTGCATGCCTGTAACTCAAGAAGTATTAAAGATATCTTATCTGAAGAACAAATAGGCTAATGTCAAAATTAGAAATGTATCTCGTCTTTTTCTATCAAATCAATTCCATAGAACATACCTGAGTGCTATAAATATTCCTTTTCCAAAGTTTGCATGCATGTAACTCTAAAAGTATTCAAGATATATTAACATCTTTCTAGATTCTCATTCTTAACAAACTTTCCTATTGAAATCTTCATTTTCAAGACCCTATATAGTTTAATCCCATAGATATGGGGATCTCAAAGCAGCTCCATGTTCAAAAGGAATTGAAGAATAAATAATGTTTAAAGTAGAAATGTATCTTGTTTCCCTCTATCAAAAGTATTGCATAAAACATAACTCTCTGAGTACCATAACTCAATGTGTATTCAACTTCAACTATGTTTACTAGGATACTCGCTAATTTTGACTCGCGGCATTTTGACATAATTTTGTGTGAAATTGTCCGTTCAAGCATGAGACATGAAAGAGAGCTCAATTCAGTACTCGTGTGCTGTCAGATGTGGCTTTCTGGATGCGTGCTTCAGATGTGCAATTTACACGCACAATACTTCCCACACAACGTGCACGGGTTATCTACACGTGCAAATGATAAACTTTCATGACATCGCTGCAATGGTCCGATCGGGACAGTGACAGTTCTGTCAACAAGCCTTGCATAAGACAATTTTTTTTTTTTTTTTAGTTGCCTCTCATGAAATTTGGTCGCATATGTGACTGATTTACTCACATTGTAGAGGGTTGATAATTAGTCATTTTTTAAGTAAATATTGACCTGGTTTCACAGACAGGGCTTAGATTAAGCCAGGATTAGGCCTTAGTTCAATTAGGGCATTTAAGTAGCTTTTATAAACATGCCTTAGAAAAAACAACAAAAAAAAAAACATTACTAATGTATATCTTGAGACAAAACAATGGCACTGACATATTTTAAGAGGTGACAGTACTGTTGCTGTCAGTTAAAACAGCTCAAACATGCATTTCAGTCTGAAACTAGGCTTACGCCTCGTCTGTGAAACCGAGGGATTGAGTTTGTTTCAGTAAGGTTTTTGAGCTATTTATTTTTCTGCCATCCAGCATCAGCGTCGTCTTTTAAGAACCCCACATCGGTCAACCAACAACTGATGTCGTAAGGAGCTGTTCACACAGGAGATGTTTTTGCAATCCTTCTGCAATGTTATTTTTTTTTGTACACATCTGTTGTTGTTCACATATCTCTGCCCTTTTTTTAATATGCAGTATCAAGTTAAAAGAAGTTCCAATTTAAATGTGCATCCAAACTTTTTGACTGATTTTGCCTGATTCTCCATGACCTTGCAAGTTGTTTTTAGTCACTGGAAAAGGATTTGAGTCATTCAAATTCAGACCAATTTACTTGTGAATCATTAATCATTTGGATTGCAAGCAAGAGCATAACTGGAAATGCTGTTTGTTTTTTTTGTTTTTTTTTAAGCATAAAAGGATCCTGGGGAAAAAAAAAAAAATGCATTACAGTTTCCACAAAAATACGAAGCTGCACAACTGTTTTCAACATGGATAATAGTAAGAAATGTTTCTTGAGCAGCAAGTTGGCATATTAGGCATATTTTGCCCCTATTTGGGTGTGAGCAAAAACACTGAGCTGCTGCTCCCGGCCCACTTTCCAGAAGAGGGCGGAGCTTTAACAGCTCGCGCTTCGGTTGCTCAACAACAACAAAGCTGGAGAATCTCACGCAGACAAAATGAGGATTGTCAGTAACGGTGTTCAGCCTTACATTGTTCAAACCGGAGTCGAACACTAATGGAGAGACTCAGGAAGAAGTTACAACTTTTAGAATGAAACTGGACGTTTCTGAATGGTTAGTGGATAAATTTATGTAGTTGCTGTGGAGTTGATTCAACTTATCGACTAGCATGTGCCATCATGTTAATCTTTTGTGCAAATCCAGTGTTGAATTGACCCTCGTTTGTGAAGCAGTCTGGCGTAAAATGACGGCATGGTAACAACACTCTACTACAACAACTCTTCCTCTTCTCTAAAGCAGCCCAACATGGCCCCACCTCCTTTGTTGGGTGTTCTCGGGGGTGGGGTTTATGTAAATTTTAGGGTTAGTGATGTCACAAACCCAGGAAGAAGCTCATTGTAGTCCCTACAAGCCATTTGTTGTAGTCCTTAAAAAGCGATTTCTGTAAAAGAAAATATCTCCCTTTGCATTGAACTTTGAGCGTCGTAACTTTGCAGATGTTGTTTATGCTCAAATAGCAACATTACACACTAACTAAAGTTAAAAAAAGTGAAATCACAATCAAAGACCCCTTTAAAATATATTCACATAGAAAACAGTCATAATATTTCACAATATTAGTGTTTTTACTGTATTTTCCATTAAATAAGTGCAGCATTGGTGAGCAGAAGATACTTATTTCAATAACATTAAAAAAATCTTACCATACACACAACTTTTATTTAAACTTGTATTTATTTACTCACTATAGGAATTTACATAACTCTTGTCCTCACAAAATTTCCCCAATATGTATCCAGGTTTTCCATGGAACTCTGTGGAAGCTCATGCTGATGCTCTCCATCTGGCTGTTTTGATTGTGTGTCCTGTGTGAACGGCCCTTAAGTGTACTTGCAGTATAATTTGATACTGTACTAACATCATTGTGATTATGTGCTGTAAGAGAAAATGTATTAAAATGTCTGGTTTAAATTTGTGATCTAATTCTAGTGTCTCTATTAAATCTGTTGTGCCTCTGTGAATATTAGGCTATATTACAGTGTTTTCTTTCAGTGAAGATTAGCGCAAAAATCTTCTCAAATGCCATTTAATGCAAAACTACTTGAGATGAAGCACTGCGATTCTATTTAAATTATTTGCAATAACATGGATTTTCTAGTGCATGGAAAATATTACAAAATGCTAAAGTTTTGGATCAAGGTCAGTTAAAGCAAATGATTTACCGGTTGTTTAATCTCTAAAGGACTCATTTGTTTCTTT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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU338563 True 7984 lncRNA 0.36 2 1419442 1427548

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000086_01413340_01416793 MAN1C1 coding upstream 2627 1413295 ~ 1416815 (+)
CI01000086_01371003_01393249 SLC9A1 coding upstream 25635 1371003 ~ 1393807 (+)
CI01000086_01265644_01273085 NA coding upstream 145996 1265364 ~ 1273446 (+)
CI01000086_01150842_01165271 DHDDS coding upstream 253686 1150842 ~ 1165922 (+)
CI01000086_01098078_01098642 NA coding upstream 320637 1097935 ~ 1098805 (+)
CI01000086_01492811_01493179 NA coding downstream 65263 1492811 ~ 1494000 (+)
CI01000086_01506402_01526965 NA coding downstream 78711 1506259 ~ 1527057 (+)
CI01000086_01546688_01584240 NA coding downstream 118628 1546176 ~ 1589583 (+)
CI01000086_01626671_01626957 NA coding downstream 199123 1626671 ~ 1627917 (+)
CI01000086_01630097_01641734 MAN1C1 coding downstream 202549 1630097 ~ 1641869 (+)
G298391 NA non-coding upstream 158804 1237921 ~ 1260638 (+)
G298413 NA non-coding upstream 190008 1229030 ~ 1229434 (+)
G298386 NA non-coding upstream 195096 1188408 ~ 1224346 (+)
G298382 NA non-coding upstream 234985 1179163 ~ 1184457 (+)
G298366 NA non-coding upstream 271575 1136660 ~ 1147867 (+)
G298234 NA non-coding downstream 54893 1482441 ~ 1486554 (+)
G298472 NA non-coding downstream 228002 1655550 ~ 1656075 (+)
G298485 NA non-coding downstream 240664 1668212 ~ 1695255 (+)
G298503 NA non-coding downstream 269632 1697180 ~ 1697542 (+)
G298381 NA other upstream 242526 1172156 ~ 1176916 (+)
G298208 NA other upstream 439332 947191 ~ 980110 (+)
CI01000086_00499939_00501377 NA other upstream 917326 498625 ~ 502116 (+)
G298529 NA other downstream 449342 1876890 ~ 1881453 (+)
CI01000086_02807666_02845401 PHLDB3, ETHE1 other downstream 1380035 2806368 ~ 2845762 (+)

Expression


Co-expression Network