G323149


Basic Information

Item Value
gene id G323149
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000110
NCBI id null
chromosome length 4324856
location 1243849 ~ 1250080 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU367449
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>TU367450
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Function

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RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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TU367454 True 6196 lncRNA 0.37 2 1243849 1250080

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000110_01135230_01139236 AP1AR coding downstream 104613 1135131 ~ 1139236 (-)
CI01000110_01126191_01127662 NA coding downstream 116187 1125835 ~ 1127662 (-)
CI01000110_01112020_01115441 NA coding downstream 128267 1111926 ~ 1115582 (-)
CI01000110_00929399_00931607 NANOS1, NANO1 coding downstream 312124 929146 ~ 931725 (-)
CI01000110_00779093_00781105 LBX2 coding downstream 462193 778574 ~ 781656 (-)
CI01000110_01422600_01428949 SELT2 coding upstream 171813 1421628 ~ 1428949 (-)
CI01000110_01432049_01434499 RAB33A coding upstream 181625 1431705 ~ 1434499 (-)
CI01000110_01436253_01450759 NA coding upstream 186125 1436205 ~ 1450759 (-)
CI01000110_01864492_01865547 NA coding upstream 614398 1864478 ~ 1865547 (-)
CI01000110_01988105_01990600 SLITRK4 coding upstream 736509 1986589 ~ 1991741 (-)
G323125 NA non-coding downstream 68332 1175311 ~ 1175517 (-)
G323124 NA non-coding downstream 68768 1174860 ~ 1175081 (-)
G323110 NA non-coding downstream 93695 1149867 ~ 1150154 (-)
G323107 NA non-coding downstream 97471 1146115 ~ 1146378 (-)
G323048 NA non-coding downstream 109261 985076 ~ 1134588 (-)
G323274 NA non-coding upstream 31966 1282046 ~ 1347313 (-)
G323322 NA non-coding upstream 115579 1365659 ~ 1443509 (-)
G323342 NA non-coding upstream 169266 1419346 ~ 1419646 (-)
G323346 NA non-coding upstream 206332 1456412 ~ 1456691 (-)
G323133 NA other downstream 7000 1205829 ~ 1236849 (-)
G322580 NA other downstream 1138030 103265 ~ 105819 (-)
G324936 NA other upstream 1865378 3013673 ~ 3120099 (-)

Expression


Co-expression Network