XLOC_011205 (fam167aa)



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_011205
gene name fam167aa
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 5611166 ~ 5622440 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


>TCONS_00022381
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>TCONS_00022382
ATGCATCATTATTCAACAACATTCTCAGAAGTGAAACCAAAAAACTGCAAAAGAACATCAAATCTTGAGAGAGAGAAAATCAACGATAGATCATAAATAATATGTGATATAAAAGTGCTCTGAAACAAAAGAAGACTCATTGAATCTCTGTATATTTTAGATTCTAATCCAGCAGTTGGAGACATGCAGGTTTCTTGATTTTATCTTTGCtgcaagtttaaaataaaacatctctGAAGCCAATGGAAGTGACACTGACACCAAAGACTTTGAGAGCCCCAGAATGGCCGCAAGAGGACCATCTTTCCAGTTTGAAGGCTTTAGCTGAGAAGTTAAAACTGGAGACCAGAAAGACGTCGTATCTGGACTGGAGAGCTCAGCTGGAGGTGATGCTAAACCAGAGCCACAGAGATGAAGAGATTAAAAAAACGGAGAAAccacacacagaaaacacactGAGGAATCAATCAGGACACATACGAGGGTTTGGAAGTATTGATCAAGCGCTGGAGTGGCTCAGGAAAGAGCTGATAGAGATGCGTCTTCAGGATCAGCAGCTCGCACTTCAGCTGATGCGTTTGCGCAGCGATATAAACGATCTGAGAATCGTGCAGACGTGCAACCAACACCGTGAGATGCTGAACGACGCCACCTTTGAGCTGGAGGAACGGGGCGACATGTCAGATTTATGTGATGTGCCATTGTCTCCTGGATTAGGCCTGTCCACACCGCTTAAAGTCATTGGTGTCACAAAAATGAACATCAACACCCGCCGCTTCTCCCTCTGCTGACAGACACACTTTATTCAAAGAGAATGACATTATAGAGTGCACTGTAAAGAATATCTGTAGATTAACAGTTTTCATATTTTCAcgtgtttactgtttatttacggttgtgaattgcattatgggatgttgatctctgctctgtccacttttaatgttgaaaatgctactctacagtttaacaaagtgacttattGATCTTTTAGTAGTttgatttaatataatgtataagaaatagaGAGAAATGAGtgtgtaaataacaaaaaatgtgctgcagtttattacaaggtttctgtagagtaatgtacaacaccaacccagacaatacatcgctttgaactattaaaaatgttcataaaagtaacTTATTGACCTTTTCAaggtaaaaatttaaataagaaaGTTCAAGGTCCCGTAATGCAatgcaaaagcataaataaatggggaaaaatataaacatgaatcacaaaatacgaaaaCGGCTAATTtgtggatattttttacagtgtagatcttGGACATTGACATTTTCAGCCTTTTACAGttaaagagaataaaaaaatgttagccctcctgtgaaattataatattgtttttaggGTAAAATGTTTTctgcagaatgtttttttttttttacttgactggaatatatacagttgaagtcagaattgttagccacctttgattttttttcttccttttttaaatatttcccaaaatgaaagaaaataatttttttcaactagaaaaaacatcacaaaattCAAAACAACTATattatacaaacattttaatttatttgtccacagaacaagccactgttatacaatgacagttaccttaacttgcctaattaccttaattaccttaacttgcctaattaaccatgttaagcctttaaatgtcactttaagctgaatactagtcttttgaaaagtatctagtcaaatattatttactgtcatcatgacaaagataaagttaaaaaattagttattaaaacgtattcaatttcttttcggcttagtccctttattaatctggggtcgccacagaagaatgaaccgccaacttatccagcatttgttttacgcagcggatatttattaaaactattatctttaaaatggttttctgTAAAACCTCACTTGGTAAATATTTGACACATAATTAAaacttcacaggagggctaaaaagTTTGTCTTTAACTGCATGTAATTTGCCTTAAATGGGAATTTCACACAGACTCTGAACACTGAATTTCTTTCACAAAATCACCCTAAAAGTCAGCAAGTGTGtgatctttttaaaataaaaaaaaaattaaataaaaattctctGGTCAGAGAAATGAATGAGGAAAATAAAAGGGTTCCATTTTAAAGGGttgagtatttttttaaacaacaaataaatggaTATAACAGAGCAATATAATATACAttcataataaattacataaaaatatagtcAACCTATATTATTGTACTTCATACATGATATATCTAATGTTTATTATAATGATGACAGCCACTTAAAAAAAGTTAATCATACAAATATTTACAATTCTGCTATGACATATCTAAAACTGGACAAAAGCATTTTCCCGAACAGCACTTCTCAGATAATCTTCAATTCAACAGACAAAACACAATGATCAGTATATGCTGTCATTACAGTGTGAACTGGTGTAAATCAACATTTCAAGGTGACTTTAAATATATCTTTTGTACAGTCTTGGTTGTGTTTGATATTACATAACATATTGACATAACTTTAGGAAAATGTAGCTTGAACTTTACTAAGGTCTTGTCTAAGGTCTATCAGCCTGGAGCTGAATCTTTCTGAATAAATCAATTCCTTGAAATGTATTTAACAATGTTCATGAATTCTATaaacacataagaagatatttcACTCTTTTCTTATTCAATAAAgtcaatattttattgctaaattttttgtttttatttttgggtgaaggATGTTTATATGTTTACAGAGTTTACAATGttcttttaaagggccatgaaacaccCCTCCTGTCTCAGCAGGGGTTTtttctagaggtgtgaacctatactggtctcatggttcggttcggttacgataaTCATACGATTATCGATTTGGTTcgatatcacggtgcattgacgatgctttccatacacagtgttatattttggggggaggctataacaagctctctgtataaacacacagcaccacactgtctctcattcacacacatacacaaacatagacagcaccaaacgaacacacacaaacacacttaagccctcgcaaaagcaataaaaaaaacgaaaaaaagagaGCAATGGTCgtaattttaactaattttaaatttaattttaacacTGCTCCATTTAAACCCTTGCCAATATGCGTTCAGCCGGGAGAGCTCGTGCCGAGCGGAGGTCTTAGTAAGgaaccgtcggaaaagtgcttctttttttctttttttcctccgtcctgcgtgttttattttaaacacaactaattttctcttaaatgagcacaaacagttactaaagtagtcgaatgcttcattatagatctgtgcattatTACATCAACacatctgttatcaaacaaaacacaatgagagattcactagctgctcttcactaaataactctagtaactttaatcaatatgcaaatacaatcaaaagtgaaatagattttatagctttatttaattcctggataggccattgattttaataggctaaaccttttgtttcattgtcaatattttctaatgtttgctatgtattctataatttgaatctatttgttgtcccatattttttacatccaacgttggacagattgctaatcaataaatagctatagtgctatctgttagttttgacgtcagctaatgttgtggaagggcatagatgttatggaaaaaaGTAAtggtaatgtaactacccccatcattccttcttCAAGCAAATGCGTAAATATTAAATCTATTCAGcattaatgttaattgcattggcatatttatctgatgttttcccagcttgtagtagtcaatcaaaaagctatttagtttggctatacagtggaatttactgcgatgtgacggggcgccacctgaaatcttgcctagggtgccaaattgcttagggccgggcctggtgggacacatatatgactgtcagcatctcaaaaaatgtgtttcacGACCCTTTAAAATTGTATTGTCTTATTGTATTTGCAGTGTGACAGATCTAAACATTTTAACCGcacttttaatataaatattaaaaaat

Function


symbol description
fam167aa Orthologous to human FAM167A (family with sequence similarity 167 member A).

GO:

id name namespace
GO:0008150 biological_process biological_process
GO:0005575 cellular_component cellular_component
GO:0003674 molecular_function molecular_function

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-061013-209 Orthologous to human FAM167A (family with sequence similarity 167 member A).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000067665

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00022381 False 1482 mRNA 0.37 3 5611166 5619798
TCONS_00022382 True 4095 mRNA 0.34 2 5616826 5622440

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_011204 runx2a coding upstream 94473 5351922 ~ 5516693 (+)
XLOC_011203 cdc5l coding upstream 505244 5061135 ~ 5105922 (+)
XLOC_011202 FO082819.1 coding upstream 740644 4870403 ~ 4870522 (+)
XLOC_011200 KLHL29 coding upstream 756315 4578552 ~ 4854851 (+)
XLOC_011201 CABZ01016068.1 coding upstream 950123 4660919 ~ 4661043 (+)
XLOC_011206 CU571310.1 coding downstream 1074 5623514 ~ 5629978 (+)
XLOC_011207 rp1l1a coding downstream 146168 5768608 ~ 5822120 (+)
XLOC_011208 CU929322.1 coding downstream 214868 5837308 ~ 5837694 (+)
XLOC_011209 fndc4b coding downstream 223762 5846202 ~ 5928942 (+)
XLOC_011210 znf513b coding downstream 309090 5931530 ~ 5951745 (+)
XLOC_011199 NA non-coding upstream 1118453 4489255 ~ 4492713 (+)
XLOC_011198 NA non-coding upstream 1132434 4470293 ~ 4478732 (+)
XLOC_011197 NA non-coding upstream 1145608 4460750 ~ 4465558 (+)
XLOC_011213 NA non-coding downstream 585719 6208159 ~ 6211272 (+)
XLOC_011217 NA non-coding downstream 764200 6386640 ~ 6392567 (+)
XLOC_011220 NA non-coding downstream 905583 6528023 ~ 6528543 (+)
XLOC_011230 NA non-coding downstream 1604290 7226730 ~ 7229012 (+)

Expression



Co-expression Network